AI 制药日报 · 2026 年 10 月 26 日 · 星期一
下一分子
Baker团队开源RFD4后，38亿美元估值的Chai还值不值？
David Baker团队联合NVIDIA发布并开源RFD4-Proteina，代码与权重开放、核心许可为BSD 3-Clause，由此引发业内对Chai Discovery等闭源蛋白设计平台是否仍值得支付溢价的争论。
蛋白质与大分子设计
PNAS论文提出ThermoMPNN单突变稳定性打分器
北卡罗来纳大学教堂山分校Brian Kuhlman团队在PNAS发表论文，提出将ProteinMPNN结构特征迁移到稳定性预测任务的ThermoMPNN模型。该模型在Megascale测试集上预测值与实验值的相关系数约0.75，在Fireprot无同源子集上约0.65，均高于直接使用ProteinMPNN的约0.43和0.41。
AI 虚拟细胞与扰动预测
陈洛南团队在Nature Methods发表CauTrigger，用层级因果分解解析生物系统状态转变与导航
上海交通大学陈洛南团队与东京大学合原一幸团队在Nature Methods发表CauTrigger，将深度潜变量建模与基于do-calculus的干预性因果推断结合，从组学数据中识别状态转变的潜在触发因素及级联因果路径，并做虚拟扰动预测。
商业与生态合作
阿斯利康与insitro达成MASH与心肌病独家合作，首付4000万美元
insitro与阿斯利康达成全球独家研究合作，针对MASH与心肌病开展新靶点与创新疗法发现，insitro获4000万美元首付款，并有资格获得最高约14.6亿美元里程碑付款及个位数比例销售提成。
Enodia与辉瑞达成Sec61抑制剂研究合作及授权协议，总潜在价值超5亿美元
Enodia Therapeutics于2026年10月13日宣布与辉瑞达成研究合作及授权协议，共同发现与开发Sec61抑制剂，协议总潜在价值超过5亿美元。Enodia将负责发现阶段针对多个合作靶点筛选、优化并开发候选分子，合作期结束后辉瑞全权负责临床、生产、监管申报及商业化。
前沿论文与基准
多伦多大学等提出SELECTBENCH，评测九种生成模型难区分目标与脱靶蛋白
多伦多大学、Mila 等机构提出 SELECTBENCH，将目标与脱靶蛋白同时纳入评价，评测九种结构驱动小分子生成模型的选择性。
浙大侯廷军等在npj Drug Discovery提出智能体六级自主性框架
浙江大学药学院侯廷军等在npj Drug Discovery发表观点文章，梳理智能体在药物发现中的应用并提出L0至L5六级自主性框架。作者从科学决策、系统自主性和人工参与程度三个维度划分能力，将能提出原创假设并组织端到端探索的L5“虚拟科学家”定位为长期愿景。
研究揭示比对保守性评分的两类相反失效模式并给出可计算诊断
Karagöl 等人在预印本中刻画了基于序列比对的保守性评分的两类相反失效模式，并指出二者都能在评分使用前从比对中计算出来。第一类是空位导致虚高：在 55,816 个位点上，报告值随空位比例上升（rho=+0.553），改为仅在非空位残基上重算后降至 +0.066，且无空位重算与 AlphaMissense 的相关性为 rho=0.551，高于报告值的 0.416。
算法工具与系统
gmx_MMPBSA 扩展端态结合自由能计算能力并新增 amber_MMPBSA 入口
gmx_MMPBSA 团队扩展了这款基于 GROMACS 的端态结合自由能计算工具，新增 GBNSR6 与非线性 PB 模型、二阶累积量（C2）熵估计、显式结构水以及多位点丙氨酸/甘氨酸突变功能。