2026 年 11 月 8 日 · 星期日AI 制药 · 每日要闻每天 08:00 出刊
AI 制药日报 · 2026 年 11 月 8 日 · 星期日
下一分子
第 27 期082026 年 11 月星期日
十一月本月 8 期
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小分子与计算化学
融合 Boltz-2、OpenDDE 与 Schrödinger 的 GPCR 设计管线及 GPR84 实战
作者以 GPR84 为例，介绍一套融合 OpenDDE 生成、Boltz-2 共折叠与亲和力快筛、Schrödinger 2026-4 膜显式 MD 与 FEP+ 的 GPCR 计算设计管线。
前沿论文与基准
下一分子整理 AI 制药 Benchmark 清单 AIDD Bench Atlas，收录 85 项评测资源
下一分子整理并发布 AI 制药 Benchmark 清单 AIDD Bench Atlas，收录 85 项覆盖通用科研、靶点发现、分子设计、临床前、临床分期、注册和上市后等环节的评测资源。
文章速递
ACS JMC (药物化学)多样计算策略发现p38α−MK2分子胶
【摘要级】研究结合自由能扰动与机器学习，从多种化学来源的配体中筛选并优先排序，识别出多个结构多样、高效力且高选择性的p38α−MK2分子胶。先导化合物14和28在人全血中达到覆盖EC50的暴露水平，并在脂多糖小鼠模型中口服给药后显著降低TNFα水平。该工作为三元复合物类分子胶的计算驱动设计提供了筛选与优化路径，结果基于摘要报告。
ACS JCIM (化学信息与建模)结合对接变异性与相互作用能的化合物优先级策略识别LRH-1潜在结合剂
【摘要级】研究提出一种化合物优先级排序策略，利用靶向物理对接与生成模型盲对接采样得到的构象，在LRH-1（NR5A2）正构配体结合口袋的多构象上训练两个多层感知机（MLP）预测结合剂或激活剂。在分布外化合物集上，MLP能识别与训练集化学结构不相似的化合物，并对单一骨架修饰敏感。将该方法用于一项前瞻性药物发现初步研究，识别出四个LRH-1潜在结合剂；评分与预测指标组合可在不同库规模下富集命中化合物。
Briefings in BioinformaticsMulDR：保留多组学视图特异细胞系关系的药物响应预测框架
【摘要级】研究提出 MulDR 结构化多视图关系学习框架，在药物条件化细胞-药物交互之前，分别为通路活性、基因表达、突变和 DNA 甲基化构建独立的细胞系关系结构，并结合 motif 级、几何感知分子图和 Morgan 指纹三种药物表示进行融合。