AI 制药日报 · 2026 年 10 月 25 日 · 星期日
下一分子
Baker 团队设计无序区蛋白探针识别 Tau 与 Aβ 修饰并区分邻近磷酸化组合
华盛顿大学蛋白质设计研究所 Kejia Wu、David Baker 等与麻省总医院等团队在 bioRxiv 发布预印本，通过从头设计获得识别 Tau 和 Aβ 特定化学修饰的蛋白探针。
蛋白质与大分子设计
Astrolabe：通过跨情境协调与结构干预实现可编程全原子生物分子设计
作者提出 Astrolabe 闭环框架，将结构条件化的序列生成与用户定义目标结合，在残基、链或复合物层面同步更新，并在预测结构偏离目标几何时进行干预。在摘要报告的评测中，Astrolabe 在蛋白结合剂和小分子结合剂基准上取得最高的计算通过率，并可处理从局部有序化到多结构域重排的靶点构象变化。
LangAAI：仅用序列抗原上下文改进抗体高变区建模
作者提出掩码语言模型 LangAAI，仅以抗体与抗原的一级序列为条件，无需三维结构、对接构象或表位注释。将同源抗原替换为非结合诱饵后，LangAAI 的序列恢复率明显下降且集中于 CDR3 环，而抗原无关模型基本不受影响。在各自评测协议下，其氨基酸恢复率优于现有抗体语言模型，与基于结构的方法相当，并按亲和力对实验测定的变体排序，效果接近使用骨架坐标的逆折叠模型。
小分子与计算化学
分子动力学模拟复现hERG离子通透并解析小分子调控机制
研究用分子动力学模拟复现了hERG钾通道持续的K+通透和与实验测量相当的单通道电导，并重现其单通道电导的不对称性。作者将选择性滤器最内侧离子结合位点S624的构象动力学确定为该不对称性的决定因素，将其替换为苏氨酸后不对称性消失。
AI 虚拟细胞与扰动预测
西湖大学吴泰霖团队提出PACE，从单细胞快照推断连续演化，被NeurIPS 2026接收
西湖大学与浙江大学团队提出PACE，以细胞状态空间的局部几何为约束，交替更新跨时间配对与连续路径，从离散单细胞快照推断群体演化，相关研究被NeurIPS 2026接收。
Marinka ZitnikCONCERT：预测基因扰动效应在组织中传播的生成模型
Marinka Zitnik 团队提出生成模型 CONCERT，用于预测基因敲除等扰动效应如何从被扰动细胞扩散到邻近组织区域。作者指出同一敲除在肿瘤核心与组织边界可产生不同响应，相关预印本已发布于 bioRxiv（10.1101/2025.11.08.686890v3）。
商业与生态合作
BMS一日敲定三起AI合作，Pathos获2.37亿美元E轮融资、Tempus获1.375亿美元数据授权
百时美施贵宝（BMS）在10月23日公布三起AI相关合作，包括领投Pathos的2.37亿美元E轮融资（投后估值约30亿美元），并与Pathos、Tempus联手研究阿尔茨海默病等神经系统疾病。