LangAAI：仅用序列抗原上下文改进抗体高变区建模

作者提出掩码语言模型 LangAAI，仅以抗体与抗原的一级序列为条件，无需三维结构、对接构象或表位注释。将同源抗原替换为非结合诱饵后，LangAAI 的序列恢复率明显下降且集中于 CDR3 环，而抗原无关模型基本不受影响。在各自评测协议下，其氨基酸恢复率优于现有抗体语言模型，与基于结构的方法相当，并按亲和力对实验测定的变体排序，效果接近使用骨架坐标的逆折叠模型。