Genesis Molecular AI 在 NeurIPS 2026 论文中报告，其方法在分子优化任务上达到与最强推理时搜索相同的性能，同时 oracle 调用次数减少 58 倍。该推文指出，预训练分子生成器掌握化学规律但不了解具体靶点，论文聚焦离散扩散设计选择对反馈效率的影响。
推荐理由：该论文比较离散扩散分子生成中不同设计选择对反馈效率的影响，为优化时的 oracle 调用预算提供参照。
Caltech 的 Trevor Chen 与 @ariel_1214_ 共同主导，联合 Genesis 团队（@edunov、@gruver_nate）等作者发布论文 arXiv:2607.02834，并在 GitHub 开源代码 DDAMO。材料未披露研究任务、方法细节与实验结果。
Pranam Chatterjee 实验室与 Roy Ben-Shalom 获 2026 年 Hartwell 基金会生物医学研究合作奖，将把前者的过渡路径采样与分子设计生成模型，与后者在离子通道功能和脑生理学方面的专长结合，开发儿童神经发育障碍新疗法。
Google DeepMind 为 Google Antigravity 发布 Cheminformatics Skills，基于 RDKit 并接入 ChEMBL 与 PubChem，让语言模型负责流程编排、确定性化学工具执行分子计算。
推荐理由：官方演示了智能体在真实肺癌药物数据上完成检索、配对分析与大环设计，可观察化学工作流的自动化边界。
Recursion 在 Q3 更新中报告，REC-4881 在 FAP 的 TUPELO 二期数据显示，治疗 12 周后 87% 患者总息肉负荷下降，85% 可评估患者在停药 12 周后仍低于基线，两名患者较大息肉数量从 90 个以上降至 1 个。
推荐理由：Recursion 季度更新同时披露 REC-4881 的 FAP 二期数据、赛诺菲与基因泰克合作里程碑及现金跑道，可对照其平台兑现节奏。
华北制药拟以不超过2.195亿元分三轮参与安源医药增资，华药集团则以2.45亿元受让安源生物所持47.1154%股权，交易投前估值5.2亿元。交易完成后华药集团持股47.8572%成为控股股东，华北制药持股12.8571%为参股方。安源医药深耕长效蛋白药物设计，核心在研产品为AP017、AP025、AP026及AP061。
内蒙古大学、上海财经大学与CMU团队提出ReSFlow，将类别概率经平方根映射到球面，在球面上重新配对并整流生成轨迹，使离散数据可一次模型调用完成生成，该工作已被NeurIPS 2026接收。
推荐理由：论文把离散类别概率映射到球面做整流，使一步采样接近多步ODE质量，为离散序列生成提供可迁移思路。
Endpoints News 将举办第二届健康科技主题活动，聚焦该领域最受关注的对话。原文正文仅披露活动将于周四举行，未给出具体议题、参与方或成果信息。
Isomorphic Labs总裁Max Jaderberg称未来所有药物都将由AI设计，公司目前仍处临床前阶段，预计2026年年底启动首次临床试验。其统一药物设计引擎IsoDDE在Runs N' Poses基准上对全新蛋白质-配体系统的准确率超过AlphaFold 3两倍，并声称可在无需晶体结构下预测结合亲和力。上述基准数据主要由公司自行发布，尚需独立验证。
IDPForge以ESMFold序列与残基配对模块结合去噪扩散，从氨基酸序列生成全原子无序蛋白构象集合，在32条单链IDP测试序列上综合NMR拟合的归一化X-EISD分数为0.890，高于IDPConformerGenerator的0.576、IDPFold的0.582和CALVADOS的0.584。
推荐理由：介绍IDPForge用扩散模型生成无序蛋白构象集合，并对照NMR与SAXS数据说明其优势与尺寸偏差。
2026年10月生物科技交易规模与9月持平，最贵一笔为Shionogi以20亿美元收购IntraBio，获得已获FDA批准的小分子药物Aqneursa。Viatris以16.5亿美元收购Pacira BioSciences，Merck计划以13亿美元收购Silence Therapeutics，Gilead以12.75亿美元首付款收购PepStar Therapeutics。
针对AI4S在制药行业的落地，有观察指出真正实现"实验数据回流模型"闭环的公司远比"AI制药"名单短。其提出四条标准：自主可控测量系统、百万级互作/筛选事件通量、超越存在性的定量读数，以及实验数据真正进入下一轮设计。文章还按仪器供应商、数据回流型和CRO化三类玩家分析了各自的生存路径。
深势科技与合作团队在《Nature》发表虚拟细胞模型ProteinTalks，将大规模动态蛋白质组与神经常微分方程预训练结合，用于药物扰动响应预测。
推荐理由：深势科技作为论文合作方，梳理了ProteinTalks在单药筛选、联用与耐药机制上的实验验证路径。
诺华终止了与BioArctic处于发现阶段的研究合作。同一报道还提及Teva、Ultragenyx和Specific Biologics的相关消息，以及两家风投机构完成首期基金募集。
Evaxion 将在 SITC 2026 年会以口头和壁报形式公布个性化癌症疫苗 EVX-01 联合 pembrolizumab 治疗晚期黑色素瘤的二期试验生物标志物数据，涵盖疫苗特异性 T 细胞应答之外的全身免疫调节分析。
当尽职调查项目足够具体、可评分时，智能体治疗发现才具备可合作性。Peter Clark 在 #ARDD2026 上发言。照片：https://agingpharma.org/photos2026
Recursion 2026年第三季度财报电话会 + FAP 网络研讨会 https://x.com/i/broadcasts/2BlMKndVoQyoqk
Fox Chase Cancer Center的Roland Dunbrack在bioRxiv发表预印本，将原本用于蛋白—蛋白相互作用的ipSAE评分扩展到蛋白—小分子、蛋白—核酸体系，以蛋白为对齐参照评估整个配体位置并调整归一化方式。
推荐理由：预印本把界面置信度评分扩展到蛋白—小分子与核酸体系，并给出留出集上的分类表现与失效案例。
德国慕尼黑大学Veit Hornung与马普生化所Matthias Mann团队在Cell发表SPARCS平台，将自动化激光显微切割改造为高通量单细胞分离手段并配合深度学习图像分类器，在7000万细胞规模完成自噬体形成与STING转运的全基因组筛选。
推荐理由：该平台把激光显微切割与深度学习图像分类结合，使复杂亚细胞表型可在全基因组尺度被筛选并回溯分析。
斯坦福大学 X-lab 与 SNAP 实验室联合发布蛋白设计框架 ProteoCraft，采用梯度提案、完整结构预测验证与两阶段蒙特卡洛树搜索，支持结合蛋白从头设计和限定区域局部改造。
推荐理由：报道介绍斯坦福团队的提案—验证搜索框架，用独立结构预测与湿实验数据展示从头与局部设计的阶段性表现。
Open Targets 发布临床数据挖掘管线 Mira（Multi-source Indication & Report Analytics），整合 ClinicalTrials.gov、DailyMed、PMDA、EMA 等 23 个来源，在 26.09 版本产出 289,954 条临床报告、覆盖 13 个研发阶段。
推荐理由：介绍 Open Targets 新临床数据管线如何整合 23 个来源并重估靶点临床先例，可了解其数据口径与阶段映射变化。
帕金森病的精准疗法 https://www.ddw-online.com/precision-therapies-for-parkinsons-disease-44580-202611/ 关注 DDW；面向全球科学界的商业洞察 #帕金森病
Radical Numerics 联合创始人 Eric Nguyen、Armin W Thomas、Michael Poli 与 Stefano Massaroli 在访谈中讲述从长序列架构 Hyena、DNA 生成模型 Evo 到多生物信号模型 Omnii 的技术路径，主张让 AI 直接学习尚未写成自然语言的原始生物数据。
下一分子2026年11月3日日报汇总多条AI制药进展，头条为东北大学、Broad研究所等在arXiv预印本提出自进化分子发现智能体MolRSI，将模型选择与组件组合等工作流作为优化对象，抗菌筛选命中率15.9%。
作者用 PartiDesign 针对 HLA-A*11:01 呈递的 KRAS G12D 突变肽完成一次从头结合蛋白设计，在 RTX 5080 上以 5 种长度各 100 个样本生成 500 条候选，约 78 分钟完成。
推荐理由：作者完整记录用 PartiDesign 设计 KRAS G12D pMHC 结合蛋白的流程，含 hotspot 取舍与评分分布，可作同类设计的操作参照。
针对 KRAS G12D 肽-HLA-A*11:01 pMHC 复合物，文章提出以 VHH 纳米抗体识别突变肽，并强调需在真实细胞上验证其能否区分仅差一个氨基酸的野生型肽及人体自身肽组。已有 TCR 研究支持该 pMHC 作为识别入口，但 VHH 路线仍属项目设想，尚无实验数据。文章建议将肽长度、可及表面与突变相关构象纳入靶点定义，并用遗传对照矩阵和靶向免疫肽组学检验内源呈递靶标。
腾讯混元于 11 月 2 日发布 Hyra 2.0（Hunyuan Research Agent），将 AI 科研智能体的目标从解决单个科研问题扩展到自主研发可复用的模型、算法和工具，并完成两个 AI4Protein 成果的研发。
推荐理由：腾讯混元披露科研智能体自主研发出两个蛋白质模型，并公开权重与推理代码，可供比较其研发流程与评测表现。
百图生科与空间组学企业德运康瑞签署战略合作协议，将结合DynaSpatial平台的空间单细胞多组学测量、SEERNA ISS与FISH的原位验证能力，以及xTrimo的学习与预测能力，探索具有真实组织语境、可通过实验反馈迭代的虚拟细胞模型。合作拟形成“组织测量—模型预测—原位验证—反馈迭代”闭环，推动虚拟细胞从聚焦孤立细胞状态的Cell Model迈向Cell-in-Context。
晶泰科技与迪拜医科大学签署战略合作协议，将结合后者的学术研究优势与晶泰科技的产业研发能力，探索AI与机器人技术在医学研究领域的创新应用。双方未来联合研究可能聚焦中东传统草药，借助现代药理学、药物化学及AI驱动技术识别潜在生物活性化合物。晶泰科技此前在迪拜世界健康博览会展示了参与建设的横琴实验室全自动中药研究平台，该平台整合机器人自动化与AI，实现从样品提取到生物活性测试的一体化流程。
没错
在神经衰老领域，AI驱动的靶点发现将一类难成药适应证转化为可命名的下一代靶点，供合作伙伴尽职调查。Iosif M. Gershteyn 于 #ARDD2026 演讲。照片：https://agingpharma.org/photos2026
Recursion在2026年三季度进展中披露，武田原开发的MEK1/2抑制剂TAK-733经细胞表型筛选发现可改善APC缺失相关异常表型，重命名为REC-4881并推进至家族性腺瘤性息肉病；15名患者治疗12周后13人全消化道息肉负担下降，中位降幅47%，停药12周后13名可评估患者中11人仍低于基线。
衰老是动态且异质的，因此随时间对单细胞读数进行共配准，可构建出合作伙伴真正能用于训练的AI就绪数据。Hao Pei 在 #ARDD2026 上发言。照片：https://agingpharma.org/photos2026
Edison Scientific与普林斯顿大学合作发布ChefNMR2，输入分子式和一维NMR峰表，由原子级流匹配模型生成候选平面结构，再由智能体核对谱图与文献。
阅读更多：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.29.762711v1
https://x.com/jrkelly/status/2008899712565313655?a=M6J1k1CmDwLMzYHgMlw&s=20
人源化小鼠、AI引导的抗体发现以及伴侣动物研究，弥合了衰老项目仍面临的小鼠到人类的转化差距。沈月雷在 #ARDD2026 上分享。照片：https://agingpharma.org/photos2026
加州大学伯克利分校Michael Rapé团队在《Science》发表研究，提出刺激性蛋白降解（SPD）策略，用小分子解除BEX蛋白对E3连接酶CUL2-FEM1B的抑制，促进其天然底物降解。
推荐理由：研究提出激活E3连接酶天然底物清除的SPD策略，为多蛋白异常疾病提供不同于PROTAC的作用模式参照。
研究人员提出AF3-PTI-PAE方法，用AlphaFold 3预测MHC–抗原肽–TCR三元复合物结构，并以TCR–抗原肽界面预测排列误差判别抗原特异性，无需针对特定抗原训练。
推荐理由：研究用AF3预测三元复合物界面置信度推断TCR抗原特异性，并给出独立验证与敏感性限制。
清华AIR孵化、张亚勤创办的水木分子获评央视「中国AI创业十骏」，是1200家参赛企业中唯一上榜的AI制药公司。公司以对话式药物研发平台ChatDD推进自然语言与生物数据连接，其首条自研管线为自身免疫领域双特异性抗体，从立项到确认PCC用时七个月，而传统方法需12-24个月。