百图生科与德运康瑞达成战略合作,共探真实组织语境下的虚拟细胞模型
百图生科与空间组学企业德运康瑞签署战略合作协议,将结合DynaSpatial平台的空间单细胞多组学测量、SEERNA ISS与FISH的原位验证能力,以及xTrimo的学习与预测能力,探索具有真实组织语境、可通过实验反馈迭代的虚拟细胞模型。合作拟形成“组织测量—模型预测—原位验证—反馈迭代”闭环,推动虚拟细胞从聚焦孤立细胞状态的Cell Model迈向Cell-in-Context。
百图生科与空间组学企业德运康瑞签署战略合作协议,将结合DynaSpatial平台的空间单细胞多组学测量、SEERNA ISS与FISH的原位验证能力,以及xTrimo的学习与预测能力,探索具有真实组织语境、可通过实验反馈迭代的虚拟细胞模型。合作拟形成“组织测量—模型预测—原位验证—反馈迭代”闭环,推动虚拟细胞从聚焦孤立细胞状态的Cell Model迈向Cell-in-Context。
斯坦福大学与华盛顿大学团队在Science发表Virtual Biotech,一个以药企组织为蓝本的多智能体框架,由虚拟首席科学官统筹靶点发现、安全性、modality选择与临床开发四个部门智能体,并设科学审查员质控。
HUPO 2026 大会在新加坡汇聚 45 国 1,428 名代表,主题为“Proteomics Plus: Transforming Lives”。中国发起的 π-HuB 计划提出在三十年内投入数十亿元人民币,目标预测个体一生的蛋白质组状态;西湖大学郭天南则报告了覆盖 58 种主要组织类型、251 种细分组织类型和 25 种癌型的空间蛋白质组工作,以及针对三阴性乳腺癌的扰动蛋白质组虚拟细胞模型。
Marinka Zitnik 团队提出生成模型 CONCERT,用于预测基因敲除等扰动效应如何从被扰动细胞扩散到邻近组织区域。作者指出同一敲除在肿瘤核心与组织边界可产生不同响应,相关预印本已发布于 bioRxiv(10.1101/2025.11.08.686890v3)。
推荐理由:该预印本提出跨组织传播扰动效应的生成模型,为空间语境下的扰动响应预测提供参照。
天津医科大学张真发等通过单细胞与空间转录组学分析CheckMate 816试验标本,发现新辅助化疗免疫治疗无应答肺腺癌中CHCHD3上调,其将cGAS螯合于线粒体、削弱STING信号。敲除CHCHD3可恢复CXCL5/CXCL1产生、减少M2样巨噬细胞并促进CD8+T细胞浸润;虚拟与功能药物筛选鉴定出小分子TN4510,在临床前模型中与化疗免疫治疗协同抑制肿瘤生长。
Fabian Theis在西班牙Sitges开幕的ESSB2026(逾700名科学家参加)作开场主旨演讲,主题为“Closing the loop: from single-cell perturbations to spatial interventions”。
Valence Labs 回顾 ICML 2026,AI for biology 与健康方向论文占全部接收论文的 2.5%,在主题领域排名第 5。会议聚焦模型效率与转录组扰动预测,PerturbDiff、scBIG 等采用流匹配报告了当前最优性能,PerturbODE 则借助神经常微分方程推断基因调控网络。
Biohub正以工程化思路开发5种测量炎症的新方法,目标是在人体组织中实时观察免疫细胞活动。具体包括基于质谱的活组织蛋白质组与代谢组非侵入检测、可对免疫细胞基因做CRISPR扰动并读出影响的功基因组平台,以及用高通量T细胞/抗原筛选结合AI解码细胞识别、预测免疫细胞决策的Decoder工具。