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11月3日周二
  1. 水木分子42

    [量子位] 央视严选「中国AI创业十骏」,唯一AI制药公司水木分子是清华系

    水木分子入选央视「中国AI创业十骏」,是名单中唯一AI制药公司。其以对话式药物研发平台ChatDD连接专家经验与AI,自研自身免疫领域双特异性抗体管线从立项到确认PCC仅用七个月,对比传统方法12-24个月。公司称2026年为商业放量阶段,预计今年收入为去年的3至4倍。

  2. DeepTech深科技67

    AI从700亿分子中发现9种新型抗生素候选物,MIT团队向超级细菌发起挑战

    麻省理工学院教授Regina Barzilay和James J. Collins获得2026年普利兹克AI科学研究卓越奖,其Antibiotics-AI Project已用AI虚拟筛选超过700亿个分子、对超过3.8万个分子开展抗菌实验,发现或设计出9种新型抗生素候选物。

    推荐理由:梳理MIT团队从虚拟筛选到生成式设计抗生素的多年路径,并点出合成与临床环节的落差。

  3. Corin Wagen58

    Corin Wagen:GPT-6.1 Sol 用 OrbMol 神经网络势在约 48 小时内复现显式溶剂 QM 自由能结果

    Corin Wagen 表示,当年团队仅能勉强用显式溶剂 QM 自由能计算证明此前的隐式溶剂机理有误;如今 GPT-6.1 Sol 借助 OrbMol 神经网络势,在约 48 小时内以更少近似完全复现了该结果。他未披露具体体系、计算设置与误差对照。

    推荐理由:作者以亲历者视角对比当年显式溶剂 QM 自由能计算与 GPT-6.1 Sol 复现,呈现计算化学工作方式的变化。

  4. Corin Wagen20

    Sol 完成多项反应轨迹分析

    Sol 还跑了我当时想做的各种有趣分析:收敛性分析、沿反应坐标的溶剂配位变化、反应性轨迹动力学、静电稳定化等等……

  5. Corin Wagen58

    Corin Wagen 用约250美元算力在 Modal 完成无人工代码的分子模拟项目

    Corin Wagen 称其最终项目在 Modal 上花费约250美元,且不涉及任何人工编写的代码。他随后发布完整写作,认为分子模拟正在发生变化,可以模拟更多体系并更具雄心,并附上关于羰基-烯烃复分解建模的博客链接。

    推荐理由:作者以约250美元算力成本完成无人工编写代码的分子模拟项目,为评估自动化建模的可行性提供了一手参照。

11月2日周一
  1. AI-Protein Design63

    《Nature》报道GTAC双特异性抗体经TfR1诱导内吞降解7种GPCR

    《Nature》2026年9月30日刊发研究,提出GPCR–TfR1靶向嵌合体GTAC,通过双特异性抗体把目标GPCR拉近组成型内化的TfR1,强制其进入内吞与溶酶体降解途径。

    推荐理由:研究用双特异性抗体把GPCR拉向TfR1内吞降解,为难以占位拮抗的受体提供另一种调控路径。

  2. AI蛋白质74

    牛津大学推出SAbDab2结构抗体数据库,含2.2万抗体实例与ML级训练测试拆分

    牛津大学团队在NAR发布SAbDab2,为机器学习时代重新设计的结构抗体数据库,截至2026年10月9日收录来自11,660个PDB编号的22,543个抗体实例,归为6,945个唯一SAbDab2编号。

    推荐理由:介绍牛津团队为机器学习重设计的抗体结构数据库,含标准化训练测试拆分与统一标识符,便于复用与比较。

  3. AI药物设计实验室74

    Prompteina 用自然语言设计蛋白质:89 个受测设计中 9 个结合 GM2A

    华盛顿大学等机构提出 Prompteina,以自然语言描述整体形状、局部结构和结合界面,联合生成蛋白质全原子结构与序列。团队构建 Prompteina-Data,含约 180 万个蛋白结构条目和 5240 万条文字描述,基于 Complexa 加入全局与残基级文本条件通路。

    推荐理由:预印本用自然语言条件生成蛋白结构与序列,并在 GM2A 上给出 SPR 结合数据,可看文本接口的控制边界。

  4. 予路乾行40

    从博士同窗到创业伙伴:予路乾行五年,合作研发管线突破100条

    予路乾行在成立五周年之际披露,截至2026年10月已与全球60余家生物医药企业合作,累计参与合作研发管线超过100条,其中8条已推进至临床开发及后续阶段。公司以“AI+物理模拟”双平台提供Hit-to-PCC阶段早期药物发现与合作研发服务,合作项目包括已完成Ⅲ期临床并进入新药上市申请阶段的GLP-1/GIP双受体激动剂BGM0504。

  5. Alex Zhavoronkov18

    英矽智能ARDD2026探讨迷你蛋白肽递送

    迷你蛋白肽的口服与吸入给药途径,为长寿资产仍难以攻克的递送难题开辟了新路径。Yan Lei 在 #ARDD2026 上分享。照片:https://agingpharma.org/photos2026

  6. 药化猩球58

    用RFdiffusion从零设计靶向KRAS G12D pMHC的纳米抗体:Challenge 5实战流水线记录

    作者记录了Anthropic × Adaptyv蛋白设计大赛Challenge 5的轨道B方案:用RFdiffusion-Ab在h-NbBCII10人源化VHH骨架上生成500条CDR骨架,经ProteinMPNN生成2000条序列,再用RF2打分筛选出20条提交,全部在单块RTX 5080上耗时约68小时。

    推荐理由:记录从500条RFdiffusion骨架到20条提交的完整计算流水线,并给出运行耗时与踩坑细节,可供同类设计复用。

  7. BioTender78

    MolRSI:自进化分子发现智能体以跨任务经验优化工作流,抗菌筛选命中率15.9%

    东北大学、Broad研究所等机构在arXiv预印本中提出自进化分子发现智能体MolRSI,把模型选择与组件组合等工作流作为优化对象,并用跨任务记忆积累可复用经验。

    推荐理由:研究把分子发现工作流本身作为优化对象,并用抗菌筛选与pMHC结合蛋白两条湿实验路线检验其产出。

  8. 智药局62

    一位哈佛传奇科学家,把最难的靶点交给了中国AI

    DoveTree研发总裁Lihua Yu与晶泰科技主任科学家邹俊杰在闭门交流会上首次复盘双方2025年8月宣布的战略合作,该合作总价值达数十亿美元,覆盖肿瘤、免疫、神经、代谢等领域多个难成药靶点,目前已有项目进入IND-enabling研究阶段。

    推荐理由:复盘晶泰与DoveTree围绕难成药靶点的战略合作,披露从签约到IND-enabling的推进节奏与平台能力细节。

  9. BioTender65

    全原子模型密集涌现,AI 蛋白设计迎来新一轮技术竞赛

    BioTender 汇总2026年9—10月收录的19个全原子建模与设计项目,覆盖结构生成、复合物预测、结构编码与设计优化,认为竞赛焦点正从生成结构延伸到控制功能。

    推荐理由:梳理19个全原子建模项目的路线差异,并指出评测口径与开放程度决定成绩可比性。

  10. 智药邦74

    Anthropic公布Claude加速药物开发早期进展

    Anthropic于2026年10月27日发布文章,介绍Claude加速药物开发的早期进展,过去数月与BigHat Biosciences、BMS、Divergence Labs、Enveda、Generate Biomedicines与The Column Group六家机构达成深度研究合作,并启动自主药物发现项目。

    推荐理由:Anthropic披露与六家药研机构及BMS的合作细节,展示Claude在抗体设计、文档审核等环节的具体产出。

  11. 王初课题组63

    Nat. Chem. Biol. | 基于蛋白质组发现并缓解雄激素受体降解剂的肝毒性

    阿斯利康团队在Nature Chemical Biology发表研究,用DIA蛋白质组流程筛查204个雄激素受体异双功能降解剂(AR-HBD),将肝毒性定位至线粒体复合体Ⅰ,并据此改造出低毒性化合物3号。

    推荐理由:研究用DIA蛋白质组与机器学习把AR降解剂肝毒性定位到线粒体复合体Ⅰ,并据此改造出低毒性候选化合物。

  12. 下一分子58

    AI制药日报|2026-11-02

    下一分子11月2日AI制药日报头条介绍生物活性基础模型PSICHIC+,基于约8200万条蛋白-配体记录训练,可从蛋白序列与配体SMILES在毫秒级预测结合亲和力,在无靶点特异性训练数据的零样本虚拟筛选基准中富集效果优于回归和分类方法,并与领先的基于结构的方法表现相当。

  13. 医药魔方25

    中国源头创新,缺的不是好Science

    Science to Startup(S2S)首届中国研讨会在杭州西湖大学举办,让中国顶尖科学家与全球生物医药创投直接对接。会上展示的项目包括郭天南团队的ProteinTalks,其在501例乳腺癌患者回顾性队列中验证预后风险分层,并对3000种化合物做虚拟筛选、经患者来源肿瘤类器官验证。会议数据称2025年中国76个创新药获批上市,高于2024年的48个。

11月1日周日
  1. AI蛋白质74

    浙大/北大团队发布GlycoWeave,蛋白-糖链复合物结构预测精度较AlphaFold 3提升近4倍

    浙江大学药学院联合北京大学、深圳先进技术大学团队在预印本发布专为糖链设计的扩散生成框架GlycoWeave,用于蛋白质-糖链复合物三维结构预测。

    推荐理由:该预印本用内部坐标扩散约束糖链立体化学,并在698个复合物上给出与AlphaFold 3的直接对比。

  2. 下一分子36

    AI制药日报|2026-11-01

    bioRxiv预印本在569个已上市药物上评测35种毒性预测读出,发现没有任何学习表征优于普通指纹,毒性专用工具中仅一种高于随机,且无一能匹敌仅凭批准年份的预测器。作者认为瓶颈在于分子结构作为输入本身的局限,进展或需纳入暴露与代谢信息。

  3. 下一分子38

    AI制药月报|2026年10月

    下一分子10月月报收录33项进展,蛋白质设计重点从生成候选延伸至功能验证,虚拟细胞数据规模继续扩大,产业合作聚焦递送与蛋白疗法。月报以时间线梳理Baker Lab及IPD的14项研究,涵盖模型工具、功能设计与可开发性。其他进展包括RFdiffusion3正式发表、RFD4开源,以及剂泰与礼来就LNP递送达成合作,首付款逾千万美元、里程碑最高11亿美元。

  4. Sam Rodriques60

    Sam Rodriques 发布 ChefNMR2:从 NMR 谱图推断分子结构

    Sam Rodriques 发布 ChefNMR2,这是一个与普林斯顿 Ellen Zhong 合作训练的模型,可从 NMR 谱图推断分子结构,现已上线 Kosmos。在 2,031 个分子上,该模型 top-1 准确率为 82%,而单独使用 Claude Opus 5 为 52%。作者称这让天然产物结构推断更容易,从而减少药物发现中的一个瓶颈。

    同一新闻,精选展示《ChefNMR2:结合生成模型与推理智能体从 NMR 谱图解析小分子结构》