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11月8日周日
  1. 智药邦58

    Atlas Bio完成1250万美元融资,用AI模拟预测药物应答替代动物试验

    瑞士巴塞尔初创企业Atlas Bio走出隐匿模式,完成1250万美元融资,其中Creandum领投1000万美元种子轮,First Momentum Ventures与LEA Partners此前领投250万美元种子前融资。

    推荐理由:融资事件同时交代了RNA表达谱训练数据、12周模拟周期与FDA非临床研究新规,可对照其替代动物试验的定位。

11月6日周五
  1. 下一分子36

    AI制药日报|Nature发表RNA基础模型structRFM、OriBench-AutoLAB初步闭环...

    中国科学技术大学、浙江大学等机构在Nature发表RNA基础模型structRFM,预训练中通过结构引导掩码语言建模同时学习序列与碱基配对关系。临港实验室与上海人工智能实验室联合推出基于OriBench的自驱动实验室平台AutoLab,打通从计算推演到实验验证的干湿闭环。

  2. 动脉网44

    补齐单点扰动的系统层缺失,AI4S虚拟器官如何找到应用场景落地?| 独家专访璨辰科技创始人李磊

    璨辰科技以全尺度时空动态建模构建系统级虚拟器官,补足单点扰动预测看不到的器官系统层面变化。其脑Visium空间基因补全将RMSE从最强基线4.1398降至3.2691、Pearson相关性从0.3303升至0.6058,大脑发育近距离外推Mean WD从5.536降至2.991(约降46%)。

11月5日周四
  1. BioTender74

    CellType推出BioSimBench细胞响应预测评测体系与BioSimGym训练环境

    CellType推出BioSimBench,用真实实验数据评测模型对药物处理、基因敲低和免疫信号等干预后基因表达变化的预测,共设四个预测赛道和一个工具型科研智能体赛道。

    推荐理由:该评测用真实实验数据考察模型对未见干预条件的基因表达预测,并给出各赛道留出设置与分数对照。

  2. BiopharmaTrend42

    CZI 扩大虚拟细胞计划至18亿美元

    10月,@biohub,即陈·扎克伯格科学组织,将虚拟生物学计划扩大至18亿美元。 这笔资金用于开放、标准化的数据,以训练虚拟细胞——即预测细胞如何对药物或基因编辑作出响应的AI模型。 https://www.biopharmatrend.com/artificial-intelligence/the-18-billion-bet-that-more-data-will-enable-progress-in-virtual-cells-1609/

  3. 医药魔方58

    Differentia Bio以IgG4-RD前瞻性预测获独立临床验证,推进虚拟人体模拟

    Differentia Bio称其针对IgG4相关性疾病(IgG4-RD)的机制预测先后获得独立人体临床研究支持:2025年4月靶向CD19+的inebilizumab获FDA批准用于该适应症,2026年1月第三方公布的dupilumab早期研究中5名患者有4名出现临床改善及血清IgG4水平下降。

    推荐理由:文章梳理了Differentia Bio先预测后获独立临床证据支持的案例,为评估AI疾病模型提供参照。

11月4日周三
  1. GEN (基因工程与生物技术新闻)34

    Recursion 计划 2027 年下半年启动 REC-4881 关键试验,II 期 FAP 数据积极

    Recursion 称,基于与 FDA 的沟通及口服 FAP 疗法 REC-4881 的积极中期数据,预计今年下半年启动该候选药的首个注册性试验。Phase Ib/II TUPELO 试验(NCT05552755)显示,治疗 12 周后 87%(13/15)患者总息肉负荷下降,中位降幅 47%,约三分之一患者降幅≥65%。

  2. Recursion58

    Recursion 发布 Q3 更新:REC-4881 新数据、赛诺菲与基因泰克合作里程碑及现金跑道延至 2029 年

    Recursion 在 Q3 更新中报告,REC-4881 在 FAP 的 TUPELO 二期数据显示,治疗 12 周后 87% 患者总息肉负荷下降,85% 可评估患者在停药 12 周后仍低于基线,两名患者较大息肉数量从 90 个以上降至 1 个。

    推荐理由:Recursion 季度更新同时披露 REC-4881 的 FAP 二期数据、赛诺菲与基因泰克合作里程碑及现金跑道,可对照其平台兑现节奏。

11月3日周二
  1. 深势科技 DP Technology74

    深势科技合作开发的虚拟细胞模型ProteinTalks登上Nature,并推进药效预测落地

    深势科技与合作团队在《Nature》发表虚拟细胞模型ProteinTalks,将大规模动态蛋白质组与神经常微分方程预训练结合,用于药物扰动响应预测。

    推荐理由:深势科技作为论文合作方,梳理了ProteinTalks在单药筛选、联用与耐药机制上的实验验证路径。

  2. LeapFun68

    Recursion用AI老药新用|武田的已有分子,赛诺菲接手的新药

    Recursion在2026年三季度进展中披露,武田原开发的MEK1/2抑制剂TAK-733经细胞表型筛选发现可改善APC缺失相关异常表型,重命名为REC-4881并推进至家族性腺瘤性息肉病;15名患者治疗12周后13人全消化道息肉负担下降,中位降幅47%,停药12周后13名可评估患者中11人仍低于基线。

11月2日周一
  1. 王初课题组63

    Nat. Chem. Biol. | 基于蛋白质组发现并缓解雄激素受体降解剂的肝毒性

    阿斯利康团队在Nature Chemical Biology发表研究,用DIA蛋白质组流程筛查204个雄激素受体异双功能降解剂(AR-HBD),将肝毒性定位至线粒体复合体Ⅰ,并据此改造出低毒性化合物3号。

    推荐理由:研究用DIA蛋白质组与机器学习把AR降解剂肝毒性定位到线粒体复合体Ⅰ,并据此改造出低毒性候选化合物。

11月1日周日
  1. 下一分子38

    AI制药月报|2026年10月

    下一分子10月月报收录33项进展,蛋白质设计重点从生成候选延伸至功能验证,虚拟细胞数据规模继续扩大,产业合作聚焦递送与蛋白疗法。月报以时间线梳理Baker Lab及IPD的14项研究,涵盖模型工具、功能设计与可开发性。其他进展包括RFdiffusion3正式发表、RFD4开源,以及剂泰与礼来就LNP递送达成合作,首付款逾千万美元、里程碑最高11亿美元。

10月31日周六
10月30日周五
  1. DrugAI74

    Nat. Biotechnol.:单细胞多组学动力学模型DynaVelo预测B细胞功能缺失与恢复的扰动效应

    研究人员开发了基于神经常微分方程的生成式深度动力学模型DynaVelo,联合单细胞RNA表达与转录因子结合基序可及性重建细胞状态转变向量场,并模拟基因功能缺失与挽救扰动。

    推荐理由:该研究用单细胞多组学动力学模型预测基因功能缺失与挽救,并在小鼠B细胞中做了双杂合突变验证。

10月29日周四
  1. 智药局58

    Flagship 合并 Cellarity、Etiome、Empress 成立 AI 制药公司 Etcelera

    Flagship Pioneering 于 10 月 29 日宣布整合 Cellarity、Etiome、Empress Therapeutics 三家公司的平台技术,成立新型药物发现公司 Etcelera,由 GSK 老将 Adrian Rawcliffe 任 CEO,莫德纳联合创始人 Noubar Afeyan 为联合创始人。

    推荐理由:Flagship 将三家平台公司合并为 Etcelera,其细胞状态与扰动数据整合方式为观察 AI 制药平台组织提供了案例。

  2. DeepTech深科技58

    Formation Bio设立6亿美元基金,收购10~15个一二期临床资产用AI加速开发

    Formation Bio宣布设立规模6亿美元的药物开发加速器基金,计划未来3~5年收购10~15个处于一期、二期临床阶段的药物资产,用自建AI系统和临床运营团队在2~4年内推至关键临床节点后转售或联合大药企完成后期开发。

10月28日周三
  1. BioAIDesign70

    北大等团队在bioRxiv发布CellCompass:用AI智能体设计细胞动力学模型

    北京大学周沛劼、加州大学欧文分校Qing Nie等团队在bioRxiv发布CellCompass,一套围绕实验数据选择、改写和检验细胞动力学模型的科学智能体系统。

    推荐理由:预印本提出用智能体按实验线索选择与改写细胞动力学模型,并在模拟基准和四类真实数据上给出对照结果。

  2. LeapFun60

    UCL与剑桥团队在Cell Reports Medicine发表三阴性乳腺癌肿瘤数字孪生研究,疗效预测准确率74%

    伦敦大学学院联合剑桥大学在Cell Reports Medicine发表研究,用符号AI基于患者基因组信息构建个性化三阴性乳腺癌肿瘤数字孪生,在PARTNER试验31名患者数据上回顾性模拟化疗及化疗联合奥拉帕利等方案,疗效预测准确率为74%。

    推荐理由:研究用符号AI为三阴性乳腺癌患者构建肿瘤数字孪生,在31例回顾性数据上给出疗效预测与联合用药假设。

10月27日周二
  1. BioArt78

    Cell发表Tahoe-100M:亿级单细胞图谱解码药物扰动下肿瘤细胞分子表型

    Tahoe Therapeutics的Johnny Yu与Hani Goodarzi团队在Cell发表Tahoe-100M,构建覆盖50株肿瘤细胞系、379种小分子药物、约1100组药物-剂量条件的亿级单细胞药物扰动转录组图谱。

    推荐理由:该图谱以亿级单细胞数据刻画药物扰动表型,并揭示同靶点药物的周期效应差异,为扰动预测模型提供训练资源。

  2. Ginkgo Datapoints · Updates62

    VCPI 发布 ReFRAME 化合物库 DRUG-seq 图谱,覆盖 12,949 个化合物并以 CC BY 4.0 开放

    虚拟细胞药理学计划(VCPI)发布其迄今最大规模的数据集,为 ReFRAME 药物重定位化合物库提供阵列式 DRUG-seq 转录组图谱,覆盖 12,949 个化合物。数据在 THP-1 细胞中以 10 μM 剂量、每孔一个化合物进行筛选,注册用户可在 thevirtualcell.com 免费获取,并以 CC BY 4.0 开放。

    推荐理由:该发布提供覆盖近1.3万临床阶段化合物的转录组扰动数据,可作为药物响应与虚拟细胞研究的公开数据资源。

  3. BioTender69

    预印本《Plausibility Is Not Prediction》指出虚拟细胞扰动预测的评测漏洞

    Xinyu Yuan、Xixian Liu 等人的预印本《Plausibility Is Not Prediction》检验细胞扰动二分类差异表达预测,发现忽略扰动身份的 Gene-prior Voting 基线在 C32 黑色素瘤任务总体 AUROC 仍达 0.990,但改为同基因内比较扰动的 macro-per-gene 评测后该基线 AUROC 只有 0.500。

    推荐理由:研究用分基因评测揭示总体 AUROC 高分可能绕开扰动区分,为虚拟细胞扰动预测的评测方式提供参照。

10月26日周一
10月25日周日
  1. 木可AI探索笔记43

    细胞图谱能白嫖,唯独扰动数据,必须自己攒

    单细胞表征数据已成公共品,CZ CELLxGENE 的 Census 构建版收录2.18亿个细胞,可免费训练细胞基座模型;但扰动配对数据因单细胞测序的破坏性、公共扰动库浅或小、组合空间巨大而必须自采。Recursion 内部 RPI-93M 含9276万张显微图像、覆盖395.7万个扰动,其开源的 RxRx3 不到内部数据1%;Insitro 与 Xaira 同样以自建湿实验生产配对数据。

  2. DrugAI62

    Nat. Methods 发表 CauTrigger:用分层因果分解识别生物状态转变驱动因子

    研究人员在 Nature Methods 发表 CauTrigger,一个融合因果推断与深度潜在变量建模的分层因果分解框架,用于从观测组学数据中识别状态转变的上游驱动因子并预测扰动响应。

    同一新闻,精选展示《陈洛南团队在Nature Methods发表CauTrigger,用层级因果分解解析生物系统状态转变与导航》

10月24日周六
  1. 智药局62

    投入近75亿美元!千亿巨头BMS狂押AI制药,一日连曝三起合作

    百时美施贵宝(BMS)在10月23日公布三起AI相关合作,包括领投Pathos的2.37亿美元E轮融资(投后估值约30亿美元),并与Pathos、Tempus联手研究阿尔茨海默病等神经系统疾病。

    推荐理由:梳理BMS一日内三笔AI合作的分工与金额结构,可看清药企以数据授权加股权投资布局AI的具体方式。

10月23日周五
  1. GEN (基因工程与生物技术新闻)58

    多组学研究揭示MSS结直肠癌的可靶向弱点

    RCSI与英国癌症研究院领衔的国际团队整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学、单细胞与临床数据,开发AI工具iPhenMap构建肿瘤生物学图谱,识别出MSS结直肠癌此前未被发现的弱点。在实验室模型中,靶向药trametinib与其他药物联用可显著抑制肿瘤生长并延长生存,研究结果发表于Cancer Cell,仍属临床前阶段。团队称该结果可为现有药物重定位和新药开发提供路线图,并可能推广至其他瘤种。

    推荐理由:研究整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学与单细胞数据,为MSS CRC的联合用药与老药新用提供临床前线索。