药化猩球· Claude C o de·· 6 天前精选AI 评分58
用RFdiffusion从零设计靶向KRAS G12D pMHC的纳米抗体:Challenge 5实战流水线记录
第五关思路分享:用 RFD4从零设计靶向 KRAS G12D pMHC 的纳米抗体
AI 导读
作者记录了Anthropic × Adaptyv蛋白设计大赛Challenge 5的轨道B方案:用RFdiffusion-Ab在h-NbBCII10人源化VHH骨架上生成500条CDR骨架,经ProteinMPNN生成2000条序列,再用RF2打分筛选出20条提交,全部在单块RTX 5080上耗时约68小时。
推荐理由
记录从500条RFdiffusion骨架到20条提交的完整计算流水线,并给出运行耗时与踩坑细节,可供同类设计复用。
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