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10月29日周四
  1. 王初课题组58

    Nat. Chem. Biol. | Tryptoline立体探针结构拓展发现GRPEL1–HSPA9复合物抑制剂

    Scripps研究所的Bruno Melillo与Benjamin F. Cravatt团队在Nat. Chem. Biol.发表研究,通过改造Tryptoline丙烯酰胺探针的C6/C7远端结构,在Ramos细胞中定量超过24,000个半胱氨酸位点,筛出95个可被立体选择性标记的位点。

    推荐理由:研究用立体探针扩展半胱氨酸配体图谱,并借GRPEL1案例展示结构预测在非正构位点的识别局限。

  2. 下一分子34

    AI制药日报|2026-10-29

    原字节跳动Protenix核心成员肖文之团队开源生物分子基础模型Mol-1并公开39页技术报告,基于Protenix技术体系提升抗体、分子胶与多肽结构预测能力。晶泰科技自研肠道限制性高选择性pan-TRK抑制剂KQTD-126获FDA IND许可,临床前pan-TRK抑制活性IC₅₀<1 nM,肠道组织与血液暴露量比值超过1000:1,拟用于IBS与IBD相关慢性肠道疼痛。

  3. 下一分子74

    Molence开源生物分子基础模型Mol-1,VHH单靶点结合命中率最高63%

    前字节跳动Protenix核心成员创立的Molence Bio于10月28日发布开源生物分子基础模型Mol-1,公开39页技术报告,代码以Apache 2.0开放、基础版权重可下载,约束版权重未同样开放。

    推荐理由:报道梳理了Mol-1的结构预测与VHH设计数据,并逐项标注队列不匹配与早期checkpoint等证据边界。

  4. Oxford Protein Informatics Group · Blog50

    Atom14 与 Atom37:蛋白质设计模型如何记录原子

    文章解释 Atom14 与 Atom37 两种将蛋白质原子坐标压入固定张量的布局,并比较 RFdiffusion3、BoltzGen 和 La-Proteina 在序列未知的从头设计中如何处理原子槽位。RFdiffusion3 为每个残基保留 14 个点,用虚拟原子填充未用槽位并统一去噪,序列随后由 ProteinMPNN 或 LigandMPNN 设计。

  5. LeapFun74

    侯廷军团队推出PartiDesign:统一生成框架用于蛋白与环肽设计

    侯廷军团队推出可控生成框架PartiDesign,将结构与序列或化学身份在同一次Flow Matching生成中协同,覆盖蛋白、DNA、RNA和小分子。在ProtDBench普通MPNN单序列协议下,其估算合格候选产出约为RFD3的4.9倍,加入α螺旋引导后约7.6倍;AME原子级催化基序骨架搭建中常规与α引导配置分别约为RFD3的8.6倍和12倍。

    推荐理由:介绍统一生成框架在蛋白与环肽设计上的产出效率,并给出与RFD3、BoltzGen的基准对比及计算筛选边界。

  6. Genesis Therapeutics 官网资讯74

    Genesis 与 Caltech 提出离散扩散在线适应框架,分子优化用 86 次评估追平 Beam Search 约 5000 次评估表现

    Genesis Molecular AI 与 Caltech 合作的 NeurIPS 2026 论文研究离散扩散分子生成模型在测试时如何分配算力,其在线适应框架仅用 86 次 oracle 评估即追平最强推理期搜索基线 Beam Search 约 5000 次评估的表现。

    推荐理由:研究系统拆解在线适应式分子优化的四个设计选择,并给出何时值得用在线适应而非推理期搜索的判据。

  7. Endpoints News10

    阿斯利康艰难夏季为2027年增添压力

    阿斯利康药物Wainua在7月一项重大晚期心脏病试验中失败,对这家以研发见长的药企构成明显挫折。该报道将这一夏季挫折与公司2027年面临的压力联系起来,正文其余内容需订阅后阅读。

  8. 智药局58

    Formation Bio 推出6亿美元药物开发加速基金,计划收购10至15个管线

    美国 AI 制药公司 Formation Bio 于10月28日宣布推出规模6亿美元的药物开发加速基金,专门收购有潜力的候选药物,再借助自家 AI 平台和开发团队推进临床。

    推荐理由:Formation Bio 以项目为单位收购临床期候选药,为平台型与 AI 药企提供管线出口,呈现 AI 制药下游开发的新组织方式。

  9. Alex Zhavoronkov28

    Insilico体内单细胞筛选图谱

    在药物项目锁定之前,Mosaic体内筛选结合单细胞读出,绘制每个靶点跨器官的效应图谱。@MartinBJensen 于 #ARDD2026。照片:https://agingpharma.org/photos2026

10月28日周三
  1. 瞪羚社51

    产能翻10倍,AI4S订单又爆了

    瞪羚社文章认为,Anthropic与OpenAI相继收购药物开发相关公司并披露Claude药物发现合作成果,正把AI制药推向商业化兑现节点。文章援引金斯瑞在高盛非交易路演中的信息称,其AIDD客户已超100家,1H26收入约4000万美元、同比增长105%,2H26指引升至逾1亿美元,并计划到2027年底实现超10倍产能扩张。

  2. DeepTech深科技72

    Anthropic 买下一家“OPC药企”:只靠一个人、一个Claude,推进两款罕见病药物研发

    Anthropic 于 10 月 27 日披露 Claude 与六家生物医药机构的合作早期成果,并公布今年 7 月收购罕见遗传病药企 Mithril Medicine,后者被收购前仅有一名全职员工。

    推荐理由:Anthropic 收购一人药企并披露 Claude 在抗体设计、文档审核等环节的早期合作数据,呈现大模型介入药物研发流程的具体边界。

  3. BioAICraft73

    arXiv论文提出ResiDPO并微调LigandMPNN得到EnhancedMPNN

    悉尼科技大学、华盛顿大学、伊利诺伊大学厄巴纳—香槟分校和浙江大学研究者在arXiv发布论文,提出残基级可设计性偏好优化方法ResiDPO,用它微调LigandMPNN得到EnhancedMPNN。

    推荐理由:论文把AlphaFold2逐残基置信度反馈用于微调LigandMPNN,为序列设计筛选通过率提供了可比较的提升数据。

  4. Corin Wagen58

    Corin Wagen 评 Rowan 自动生成合成中间体对 FEP 的改进

    Corin Wagen 表示,自动生成合成中间体是 Rowan 已加入的体验改进之一,与自动扭转角重拟合、收敛检测等功能并列。他引用的 @manntis4 内容称,在测试小分子辅因子支持 FEP 时发现,把合成中间体配体加入 RBFE 图可改善与实验结合亲和力的相关性,示例为 KRAS-G12D。Wagen 认为稳健的智能体驱动 FEP 还需要更多此类能力。

    推荐理由:Rowan 团队以 KRAS-G12D 为例说明合成中间体配体如何改善 RBFE 与实验亲和力的相关性,并列出自动化改进方向。

  5. 木可AI探索笔记58

    17亿次实测 vs 一次造出10¹⁶个抗体:把AI制药"数据荒"卷成护城河的两种活法

    文章对比Terray与Jura Bio两条自产数据路线:Terray用自研高通量硬件累计超过4200亿次测量、折算逾170亿个靶标-分子互作数据点,Jura Bio则用变分合成一次造出10¹⁶个抗体序列。作者认为两者分别拆解干湿循环的合成端与筛选端,Terray已签吉利德、BMS、Odyssey合作并预计2026年有内部药物进入临床试验,但数据规模本身不等于成药。

    推荐理由:文章把Terray与Jura Bio两种自产数据路线放在干湿循环两端对照,便于理解数据瓶颈的不同解法。

  6. Jason Kelly28

    Formation Bio设6亿美元药物开发加速基金

    恭喜@BenjamineYLiu!! 构建生物技术公司的流程正在发生变化。Ben多年来一直引领这一思考,所以看到他获得更多资源支持真是太棒了!🙌🙌 (引用推文核心内容:今日宣布成立6亿美元的Formation Bio药物开发加速基金。@lintaho和我创办@FormationBio,是因为我们相信将新药带给患者的最大瓶颈不是药物发现,而是药物开发。随着AI大幅加速发现,这一瓶颈只会更加严峻。如果没有资金和能力将 promising drugs 推进临床试验,大部分进展将无法转化为患者的药物。我们的新基金汇集专项资本、药物开发专业知识和AI驱动的开发能力,以收购有前景的药物并推进其通过临床。)

  7. Alex Zhavoronkov18

    ARDD 2026:传统生物学与AI驱动发现交汇

    @ArkadyMazin 在 https://Lifespan.io 上谈波士顿 ARDD 2026:传统生物学与 AI 驱动发现相遇。代谢、时钟、AI 资产、虚拟细胞、表观遗传修复。 https://lifespan.io/ardd-2026-traditional-biology-to-ai-driven-breakthroughs/ #ARDD2026

  8. Drug Discovery World30

    AI智能体在药物发现中的演进

    AI智能体在药物发现中的演进 https://www.ddw-online.com/the-evolution-of-ai-agents-in-drug-discovery-44231-202610/ 关注DDW;面向全球科学界的商业洞察 #DrugDiscovery

  9. BioAICraft78

    EPFL 团队在 bioRxiv 发布 SPARC:AI 从头设计光控蛋白开关

    EPFL Bruno Correia 团队等人在 bioRxiv 发布论文,报道计算设计的光控蛋白开关系统 SPARC,将视黄醛结合、光诱导构象变化与短肽识别整合到同一蛋白中。

    推荐理由:该预印本展示如何把视黄醛异构化的几何变化转化为可设计的蛋白构象开关,并给出多状态序列设计流程。

  10. LeapFun68

    Anthropic已下场做药:6家合作伙伴,7个研发案例

    Anthropic于10月27日发布Claude用于药物研发的阶段性进展,联合百时美施贵宝(BMS)、Generate Biomedicines、BigHat Biosciences、Enveda等6家机构,覆盖抗体设计、CAR-T工程、先导优化、CMC与临床开发。

    推荐理由:Anthropic联合6家机构披露Claude在抗体设计、CAR-T工程与CMC等环节的阶段性结果,并已收购药物研发项目。

  11. 机器之心 · AI4Science74

    Anthropic药物研发新进展:合作六家制药机构,收购「一人药企」

    Anthropic 于 10 月 27 日公布生命科学团队与 Generate Biomedicines、Divergence Labs、BigHat Biosciences、Enveda、The Column Group 等六家机构的药物研发合作进展,并披露收购 Mithril Medicine 后推进的内部项目。

    推荐理由:Anthropic 披露与六家机构及收购标的的早期药物研发合作,呈现 Claude 在分子设计与文档审核中的具体用例。