奥泊生科技术顾问徐罡与复旦大学马剑鹏团队以ESM-2为起点做跨模态迁移，先后开发ProtRNA和ProtmRNA，用于RNA结构预测与mRNA密码子优化。ProtRNA于2025年发表于Cell Systems，在bpRNA测试集上结构预测F1为0.646，对比RiNALMo的0.594，且RNA训练阶段只调整约八分之一参数、使用六分之一RNA数据。
推荐理由：奥泊生科团队讲述如何把蛋白质语言模型迁移到RNA与mRNA设计，并解释干湿闭环为何依赖实验经验回传。
文章简述了近期国外代表性AI药物研发工具/平台：Isomorphic Labs的IsoDDE可预测蛋白质与药物、抗体相互作用，在Runs N' Poses最难任务上准确度达AlphaFold 3两倍以上。
工信部等十部门9月18日联合发布《医药工业发展“十五五”规划》，将深化人工智能赋能升级纳入重点任务，并设“AI制药高价值应用场景培育”专栏，涵盖智能靶点筛选与药物发现等五类场景。德睿智药称其自研AI制药引擎MAP与生命科学基座模型体系Intera与规划方向契合，其GLP-1 RA口服小分子MDR-001从立项到启动Ⅲ期临床用时约4.5年，Ⅲ期研究正在推进。
科学之美与影响力竟出人意料地相关
很高兴与@Nature讨论在衰老研究中使用和评估AI的机遇，并重点介绍@biogerontology在@CellCellPress上发表的最新论文，该论文为衰老生物学中的AI引入了开放基准和语言模型 https://www.nature.com/articles/d41586-026-02913-7
Anthropic 在 Science Blog 中称，Claude 为 30 多个用于分子结构建模、类药分子设计和基因突变效应预测的开源模型优化推理，平均提速 4 倍，部分通过编写 GPU 定制软件实现，并将全部优化代码开源。Roshan Rao 转发该内容并称，Anthropic 的工作显示折叠与结合剂设计可大幅加速；他所在团队也将 Claude 用于此类问题，模型训练 MFU 提升一倍。
推荐理由：Anthropic 用 Claude 为 30 多个开源生物分子模型优化推理，并开源优化代码，可作为评估模型推理加速路径的参照。
深势科技与国家人工智能应用中试基地（医疗）·北京建设运营方北京医疗健康大模型有限公司签署战略合作协议，将围绕共建AI4S药物设计计算平台及药物研发智能体、靶点发现、医药医疗高质量语料库与循证模型等五大方向联合攻关。
途深智合在2026闵行区生物医药生态推介会上分享了从AI蛋白设计走向Autonomous AI Biopharma Foundry的技术路径，核心平台ToursynClaw连接自研蛋白生成与优化模型、科学智能体及自动化实验系统，形成干湿闭环。
Orbis Medicines于2026年9月17日与Novo Nordisk达成多靶点战略合作，利用nGen平台针对心血管代谢疾病开发口服大环药物，协议含首付款、研发及商业里程碑，总潜在金额最高14亿美元，另有分级销售特许权使用费，Novo同时将对Orbis进行战略股权投资。
推荐理由：梳理Orbis的融资、nGen平台与Novo合作条款，可对照其口服大环从动物暴露走向人体PK的待解环节。
途深智合凭ToursynClaw大分子药物设计科学超智能体平台获第六届“海聚英才”大赛“产业价值奖”。该平台融合自研蛋白大模型、科学智能体与全自动机器人实验产线，公司称可实现约1.5个月完成抗体设计及功能实验验证，半年内推动16条抗体药管线完成PCC阶段验证。
如果是真的，那可就厉害了
Amir Shanehsazzadeh 报告，Claude 在不到 4 周内优化 30 多个开源生物分子模型，涉及自定义 GPU kernel、超过 10,000 token 的结构建模及低于 200 美元的结合物设计，并开放代码。帖子同时宣布与 Adaptyv 合办五项挑战，计划实验验证 5,000 多个设计。模型推理优化是相较竞赛总公告的新增内容。
推荐理由：Anthropic 公布用 Claude 优化 30 余个生物分子开源模型推理并开源代码，同时联合 Adaptyv 举办蛋白设计竞赛。
德睿智药于2026年9月18日发布生命科学基座模型体系Intera，并公布首个模型InteraFold-Chem的技术报告，该模型聚焦蛋白质与小分子的结合构象预测。
推荐理由：德睿智药公布InteraFold-Chem在445个测试样本上的结合构象预测成功率，并给出与Protenix-v2、Chai-1、Boltz-2的对照结果。
Adaptyv Bio 宣布与 Anthropic 合作发起蛋白质设计竞赛，设五个针对特定疾病或生物机制的挑战，分专家设计者、生命科学学术界与产业研究者、公众三条赛道。
推荐理由：Adaptyv Bio 与 Anthropic 合办蛋白质设计竞赛，公开全部湿实验数据，可供观察 AI 设计在自动化实验中的实际命中情况。
Mohammed AlQuraishi 表示，团队与 Apheris 合作，在五家药企内部的蛋白-配体复合物数据库上训练了 OpenFold3p2。由于 PDB 中类药化合物相对稀少，这批数据使相关结构数据量增加 3-4 倍，并带来精度显著提升。作者称训练数据未离开各药企内部环境。
推荐理由：作者披露 OpenFold3p2 在五家药企私有蛋白-配体结构上联合训练，给出数据规模与精度变化的具体参照。
要解码生物学，我们希望理解干预（遗传或分子层面）如何改变细胞状态。 挑战在于规模：约有10⁶⁰种类药分子，我们希望理解它们在许多不同细胞背景下的效应。 即便在最先进的实验室中，覆盖如此大的搜索空间也是不可行的。 但充分的数据多样性对于训练能够泛化的扰动预测模型至关重要。 那么，我们该怎么做？
成都先导通过香港全资子公司HitGen (HK) Ltd.与奥博资本亚洲基金、LAV、盘古资本等共同投资肿瘤领域新型小分子药物企业Connexus，Connexus同步完成A轮融资。成都先导以分阶段技术授权形式获取Connexus创始股权，后者将自建团队独立运营并承接新药项目后续开发，其在研项目均处于临床前阶段。
百奥几何BioGeometry启动校招，招募Bio-AI跨界人才，目标是打造自进化微观世界模型，用“硅基的计算智能”解码“碳基的生命密码”。招聘面向具备生物与AI交叉背景的优秀人才，具体岗位、人数与流程未在材料中披露。
第六届“海聚英才”全球创新创业大赛首次设立AI4S专项赛，30个项目从上海200余个科学智能项目中选出，在生命科学、物质科学与新材料、工程技术三大赛道角逐。途深智合展示ToursynClaw科学超智能体平台，打通AI分子设计与自动化湿实验闭环，称约1.5个月完成抗体设计及功能实验验证，半年内推动16条抗体药管线完成PCC阶段验证。
分子之心2027届校园招聘正式启动，面向青年人才招募，方向为AI蛋白质设计。原文未披露具体岗位、招聘人数与工作地点等信息。
ColabFold 1.6.3 发布，作者称速度提升 2.5 倍，并支持通过 pip install colabfold[alphafold] 安装。该版本新增 ipSAE 与 pDockQ2 评分，作者在推文中致谢 Choonghwan Lee、Marielle Russo、Gyuri Kim、Martin Steinegger、Milot Mirdita 等贡献者。
予路乾行项目负责人徐戚轩在访谈中讲述从计算化学工程师到项目负责人的成长，并复盘一项分子胶研究：计算方法构建分子胶体系的准确度已接近晶体结构，可更快捕捉关键相互作用位点。该工作借助自研DIVAMICS平台从三维结构叠加时间维度刻画结合机理，论文发表于JCIM，投稿修改意见累计近100条。
EMBL-EBI 研究负责人 Julio Saez-Rodriguez 等人在一篇 Perspective 文章中讨论生物医学基础模型的基准评测，提出数据质量、模型仓库与评测框架三个相互关联的支柱，并主张将性能评估与方法开发隔离、由独立方在未见数据上评测。
推荐理由：EMBL-EBI 研究负责人系统梳理生物医学基础模型基准评测的三角框架与独立评测原则，为理解模型评测争议提供参照。
Inductive Bio 于 9 月 17 日发布 Beacon-2，该系统可直接从小分子化学结构预测人体有效剂量，先预测吸收、分布、代谢、排泄与毒性等决定剂量的性质并估算效力，再通过药代动力学机制模型整合。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可从结构计算的指标，并给出在真实药物项目与公开化合物上的验证范围。
Inductive Bio 发布 Beacon-2，这是对 Beacon 系列模型的重大更新，可在 ADMET 之外直接从化学结构预测分子的有效人体剂量，由 ADMET-PK、效力与 PK/PD 三个可配置模块组成。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可计算目标，并用 Indy 智能体的对照实验展示只优化效力会出现的偏差。
Ignota Labs发布白皮书，用SAFEPATH平台在CYP3A4活性低（i18F）和高（i30F）的两株女性iPSC来源肝细胞中，以五个吉非替尼浓度做RNA-seq，两株均抑制globo鞘脂代谢，独立复现此前的PRKD1/PRKD3-鞘脂机制。
推荐理由：同一机制在两种CYP3A4活性不同的肝细胞模型中收敛，但下游毒性通路分化，为解释吉非替尼肝毒性的人群差异提供了可检验假设。
作者把雄性果蝇中枢神经系统连接组 MaleCNS（38,128 个神经元、300 万个突触）接入一个刚性对接模拟器，让果蝇“操控”星形孢菌素进入 CDK2（PDB 1AQ1）的结合口袋。仅训练边缘两层、约十万次强化学习后，果蝇从包括 9 Å 外且倒置的各个起始位置把分子对接到晶体构象 2 Å 以内。作者明确表示这并未解决药物发现，且模拟物理为自制、连接组本身未经训练。
2026年9月16日，安科生物与深势科技签署战略合作协议，围绕抗体偶联药物（ADC）载荷分子的设计与优化开展合作。双方将依托深势科技在分子模拟、自由能计算、定量构效关系分析及ADMET预测等方面的能力，开展载荷候选分子的结构生成与虚拟筛选、关键理化性质预测及转运体外排相关耐药风险评估，并通过计算设计、实验验证、数据回流闭环改进预测模型与分子设计。
推荐理由：合作聚焦ADC载荷分子的设计与成药性优化，并规划计算与实验数据回流闭环，可作为AI4S落地具体研发课题的观察样本。
分子之心2027届校园招聘正式启动，面向青年人才招募，方向为AI蛋白质设计。原文未披露具体岗位、招聘人数与工作地点等信息。
剂泰科技承担的北京市科技计划重点项目“LNP非病毒载体递送CDMO关键平台”通过北京市科委和中关村管委会组织的专家结题验收，项目总投资1.65亿元，2023年9月启动。
推荐理由：剂泰科技披露LNP递送CDMO平台的产能、工艺指标与GMP审计结果，可了解AI递送走向临床样品生产的工程化环节。
私下列出的我接下来需要的东西……
天鹜科技将参加9月17-19日张江药谷大会与9月17-18日石油石化行业人工智能技术交流大会，分享MatwingsVenus™（晓鹜™）在AI大分子药物设计与蛋白质设计中的实践，并展示废弃PET低碳循环产业成果。该干湿闭环平台由轻量级AI生物设计平台和AI黑灯实验室组成，其基座模型VenusREM在哈佛医学院ProteinGym榜单长期位居榜首。
Ginkgo Datapoints 宣布与 Lilly TuneLab 合作，为 TuneLab 内的生物技术公司提供小分子 ADME 和抗体可开发性数据生成服务。其机器学习就绪的结果可直接接入 TuneLab 的预测模型，目标是缩小 AI 模型与实验室数据之间的差距。
推荐理由：该合作把 ADME 与抗体可开发性数据生成接入 Lilly TuneLab，展示了实验数据与预测模型对接的一种路径。
科迈生物入选长城战略咨询发布的 2026「科创未来之星」企业榜单，公司称该入选认可其在 AI 抗体设计、抗体工程优化与干湿结合研发方面的能力。公司构建功能导向的 AI 抗体设计体系，围绕生物学机制与特定/困难表位开展从头设计，称核心任务进入小时级、优选候选可达 pM 级亲和力。
Ridge Biotechnologies 新增投资后累计融资约 3800 万美元，本轮种子轮由 Dimension Capital 领投，Sutter Hill Ventures 与 Overlap Holdings 参投。
BioMap百图生科在BIOHK2026论坛上总结其2123天进展：已构建数十万亿tokens的AI-ready数据、模型参数达数千亿，使前沿AI建模平均数据消耗降低90%。公司称已赋能数十个first-in-class项目，并计划在北京、上海建设高通量实验室，终极目标是建立覆盖分子到人体尺度的“生命科学世界模型”以部分替代临床试验。
临港实验室元生·开物发布新版本，上线协作空间与OriBench Structure Viewer，支持多人多Agent协作、蛋白结构叠合与靶点注释，并开放自定义套件能力。
推荐理由：临港实验室发布元生·开物工作台升级，展示多模型配置在BiomniBench-DA上的对照结果与协作功能。
我们已开始将我们的AI-Immunology™平台应用于自身免疫疾病，从而扩大了我们的治疗重点，并实现了公司2026年的又一里程碑。 更多内容见我们的新闻稿：https://evaxion.ai/investors/press-releases/?press_release_id=11321 #EVAX
百图生科与华大智造于 2026 年 9 月 11 日签署战略合作协议，将依托百图生科的虚拟细胞模型与华大智造的实验设备，联合构建专属虚拟细胞大模型，并面向虚拟细胞和虚拟扰动搭建高质量数据基础设施。
分子之心自主研发的反应性原子建模平台QuantaMind相关研究发表于《Science Advances》，论文报告其在17,792原子PET水解酶体系上完成6纳秒反应性分子动力学模拟并覆盖完整催化循环。
推荐理由：论文报告反应性机器学习力场在近1.8万原子酶体系中完成完整催化循环，并给出与DFT对照的精度数据。