AI制药日报｜2026-10-28
David Baker团队与苏黎世联邦理工学院等合作在Nature发表从头设计半胱氨酸蛋白酶研究，用RFD2-MI、ProteinMPNN和AlphaFold 3从Ulp1最小催化基序出发设计，69个实验设计中有13个出现肽键切割活性。
#分子之心
下一分子AI 评分3232 药化猩球AI 评分2525 分子之心许锦波：从RaptorX到AlphaFold，二十年蛋白质预测探索与MoleculeOS、MMDesign创业路
分子之心创始人许锦波开发的RaptorX-Contact在2016年CASP12蛋白质结构预测比赛中夺得第一，首次将深度残差卷积神经网络用于预测氨基酸残基间相互作用。他于2022年创立分子之心，推出AI大分子优化与设计平台MoleculeOS，并于2026年6月发布AI生物药从头设计平台MMDesign。公司称已完成逾亿美元A轮系列融资。
下一分子精选AI 评分7474 分子之心MMDesign技术报告：19个设计项目18个获实验确认结合分子
分子之心在Zenodo发布扩展版MMDesign技术报告，覆盖18个靶点、19个设计项目，涉及VHH与大环肽两类模态，报告称18个项目获得实验确认的结合分子，项目成功率94.7%。
推荐理由：报告汇总19个设计项目的湿实验命中情况，并区分项目成功率与候选命中率，为评估生成-过滤-验证流程提供具体参照。
分子之心MoleculeMind精选AI 评分7474 分子之心MMDesign技术报告：19个项目成功率94.7%，六个GPCR靶点全部命中
分子之心发布MMDesign最新技术报告，在覆盖18个靶点、纳米抗体与大环肽两类模态的19个项目中，18个获得实验确认的结合分子，项目成功率94.7%，单项目仅测试9—50个候选。
推荐理由：技术报告以19个项目的湿实验数据展示少量候选下的跨靶点设计成功率，并给出GPCR与跨轮次优化的具体结果。
分子之心MoleculeMind精选AI 评分6262 分子之心与引加生物达成战略合作，共建蛋白研发“周级”闭环
分子之心与引加生物宣布达成深度战略合作，将分子之心的AI蛋白质生成式设计与引加生物的微量高通量无细胞蛋白表达、全自动化筛选及工艺放大能力结合，构建从AI设计到产业化交付的“周级”闭环。
推荐理由：分子之心与引加生物把AI设计与无细胞表达、自动化筛选对接，展示了蛋白研发缩短验证周期的合作路径。
分子之心MoleculeMindAI 评分3838 “十五五”规划定调AI制药系统化落地，分子之心以NewOrigin、QuantaMind与MoleculeOS构建AI生物研发基础设施
针对“十五五”规划将医药垂类大模型、智能体等列为核心方向，分子之心以蛋白质基础大模型NewOrigin、分子动态反应模拟引擎QuantaMind和AI原生研发操作系统MoleculeOS构建AI生物研发基础设施。
途深智合AI 评分3333 转载｜“海聚英才”大赛首次设立AI4S专项赛，AI正在“读懂”生命的源代码
第六届“海聚英才”全球创新创业大赛首次设立AI4S专项赛，30个项目从上海200余个科学智能项目中选出，在生命科学、物质科学与新材料、工程技术三大赛道角逐。途深智合展示ToursynClaw科学超智能体平台，打通AI分子设计与自动化湿实验闭环，称约1.5个月完成抗体设计及功能实验验证，半年内推动16条抗体药管线完成PCC阶段验证。
分子之心MoleculeMindAI 评分88 分子之心2027届校园招聘正式启动
分子之心2027届校园招聘正式启动，面向青年人才招募，方向为AI蛋白质设计。原文未披露具体岗位、招聘人数与工作地点等信息。
分子之心MoleculeMindAI 评分88 分子之心2027届校园招聘正式启动
分子之心2027届校园招聘正式启动，面向青年人才招募，方向为AI蛋白质设计。原文未披露具体岗位、招聘人数与工作地点等信息。
分子之心MoleculeMind精选AI 评分7272 分子之心QuantaMind登《Science Advances》：以反应性分子动力学模拟酶催化
分子之心自主研发的反应性原子建模平台QuantaMind相关研究发表于《Science Advances》，论文报告其在17,792原子PET水解酶体系上完成6纳秒反应性分子动力学模拟并覆盖完整催化循环。
推荐理由：论文报告反应性机器学习力场在近1.8万原子酶体系中完成完整催化循环，并给出与DFT对照的精度数据。
分子之心MoleculeMindAI 评分4040 分子之心荣膺「AI生物智造领航者」：以AI蛋白质技术推动生物产业创新
分子之心在第八届CMC-CHINA中国制药工业博览会期间获「2026未来药物物种FNS101」评选的「AI生物智造领航者」奖，并分享AI蛋白质设计在创新药与合成生物制造中的实践。其Fab-to-scFv工程化项目经AI首轮设计后亲和力提升约8倍至0.6nM，表达量提升至>0.5g/L，纯度提升至91.5%。在代糖生产相关工业酶项目中，酶熔解温度提高15°C，半衰期由2.3小时提升至近200小时。
分子之心MoleculeMind精选AI 评分6565 分子之心披露纳米抗体与环肽设计实验结果，并推出MoleculeOS平台
分子之心在7月31日深圳“AI+新药研发研讨会”上披露，其AI从头设计的纳米抗体和环肽在TNFα、PD-L1、MDM2等十几个靶点上获得阶段性湿实验命中：TNFα的14个纳米抗体中7个显示结合活性，最优亲和力51皮摩尔；PD-L1的30个候选纳米抗体中26个命中；MDM2的21个候选环肽中16个显示可检测结合，最佳KD为13.7微摩尔。
推荐理由：分子之心披露纳米抗体与环肽的湿实验命中数据及表达量结果，呈现AI从头设计从结合走向可开发性的阶段进展。
望石智慧AI 评分2828 望石智慧成为海淀区“智药创新7S加速营”首批全球创新合伙人
望石智慧在首届医药协同创新大会上获授牌，成为“海淀智药创新7S加速营-AI4DD一站式公共服务平台”首批全球创新合伙人。公司将向平台开放靶点验证、分子设计、筛选评估等端到端AIDD能力，平台覆盖新药研发全链条七大板块的30个关键环节。其多模态AI 3D分子生成模型Lingo3Dmol阳参复现率已从超33%优化至超60%。
分子之心MoleculeMind精选AI 评分6565 分子之心MMDesign环肽从头设计获湿实验验证，p53-MDM2首轮21条中16条命中
分子之心在WAIC 2026公布MMDesign环肽从头设计结果：针对p53-MDM2靶点首轮设计并测试的21条候选环肽中16条实验命中，命中率超过70%，最优候选KD为13.7微摩尔，优于同期实验阳性对照；PD-L1靶点首轮19条候选中有6条经SPR确认结合，最佳KD接近40微摩尔。
推荐理由：分子之心公布MMDesign在p53-MDM2与PD-L1两个PPI靶点的环肽首轮湿实验命中数据，可与纳米抗体结果对照看平台跨模态能力。
分子之心MoleculeMindAI 评分4242 分子之心MoleculeOS先锋伙伴体验计划开启：AI原生生物经济操作系统开放试用
分子之心开启MoleculeOS先锋伙伴共创体验计划，面向创新药研发、生物制造、合成生物学等领域开放浏览器接入试用。该系统以多模态蛋白质基础大模型NewOrigin（达尔文）与全原子结构预测模型MMFold为底层，可理解研发意图并自动编排结构预测、亲和力评估等任务。公司称典型抗体优化项目从序列分析到候选推荐由传统数天压缩至几分钟计算时间。