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10月10日周六
  1. 智药邦58

    Basecamp Research完成1.4亿美元C轮融资,将训练新一代EDEN模型

    Basecamp Research于2026年9月23日宣布完成1.4亿美元C轮融资,由S32领投,NVIDIA、Menlo Ventures旗下Anthology Fund等参投,资金将用于训练新一代EDEN模型并推动AI设计疗法管线进入临床开发。

    推荐理由:融资信息之外,材料还交代了EDEN模型与DNA写入技术结合的体内重编程路径及临床前进展。

  2. Rohith Krishna72

    KingLab 发布预印本:用全原子方法设计糖基化从头蛋白

    KingLab 在 bioRxiv 发布预印本,报告多种结构编码的寡甘露糖型糖蛋白,提出糖基化可作为从头蛋白设计的可设计参数。作者 Rohith Krishna 转发该预印本并指出,多数蛋白设计只使用 20 种氨基酸,而糖基化等翻译后修饰在生物功能中必不可少。预印本链接为 https://bit.ly/4s2qK4M。

10月9日周五
  1. Recursion40

    Recursion:合成约300个化合物推进候选分子

    Recursion称其各项目在仅合成约300个化合物后即推进了高质量新候选分子,比行业平均少约90%。其AI原生引擎已产出逾10个开发候选分子,设计依托整合数百个机器学习与物理模型的Centaur平台,从靶点性质出发做生成式从头设计,并通过计算与实验的持续反馈循环迭代更新模型。

  2. Fabian Theis76

    LabCompass预印本:用生成式逆向设计指导细胞实验

    Fabian Theis团队发布预印本LabCompass,将实验设计的生成模型与细胞响应的前向模型耦合,在连续设计空间中按目标表型生成候选实验条件,并逐轮用实验测量反馈。

    推荐理由:研究把细胞响应预测模型反过来用于设计实验,并在原代造血细胞中做了实验验证,为虚拟细胞的实验指导能力提供了参照。

  3. ClickMab 科迈生物25

    Click.mAb. 多智能体 AI 抗体设计平台:AI 参与抗体设计会碰撞出怎样的新可能?

    ClickMab 科迈生物打造 Click.mAb. 多智能体 AI 抗体设计平台,让多个 AI Agent 协同完成靶点研究、抗体结构分析到特定表位抗体从头设计。用户只需提出研究目标,平台即可规划任务、调用工具并执行分析,一键实现特定表位抗体从头设计。

  4. Drug Discovery World18

    信息学如何将数据转化为疗法

    信息学:将数据转化为疗法 下载阅读或收听: https://info.edifydigitalmedia.com/ebook-informatics-transforming-data-into-therapeutics 关注 DDW;面向全球科学界的商业洞察 由 Inotiv 赞助 #Therapeutics

  5. Drug Discovery World15

    GPCR检测预测能力提升网络研讨会

    提升GPCR检测的预测能力:揭示隐藏的药理学 立即注册! 10月29日,太平洋夏令时上午8点 / 美国东部夏令时上午11点 / 格林尼治标准时间下午3点 / 中欧时间下午4点 https://hubs.li/Q04yqFfv0 关注DDW;面向全球科学界的商业洞察 #药理学

  6. 英灵殿科技Valhalla73

    英灵殿科技提出 OFAntibody:单抗与双抗联合生成的全原子抗体设计框架

    英灵殿科技团队提出 OFAntibody,一个以抗原结构、指定表位和预定义抗体框架或双抗构型为输入、生成 CDR 全原子结构的统一框架,支持纳米抗体单抗及 tandem VHH、diabody、CODV-like 等双抗构型的联合设计。

    推荐理由:该研究把双抗两个结合臂与连接区放在同一全原子框架中联合生成,并给出与独立拼接的碰撞对比。

  7. 奶牛猫的CADD实验室62

    Martini 3 结合自由能误差从 5.7 降至 1.2 kcal/mol,配体排序中位相关仅 0.32

    一篇预印本在 15 个靶点、172 个配体上评估 Martini 3 粗粒化模型的绝对结合自由能计算,发现模型系统性低估结合强度,按口袋带电残基数做线性校正后平均绝对误差从 5.7 降至 1.2 kcal/mol。

    推荐理由:解读预印本对Martini 3结合自由能误差的分解,说明整体偏移校正与配体排序能力为何是两件事。

  8. AI药物设计实验室78

    Nature Communications 2026:高通量蛋白质组学与AI折叠发现靶向VAV1的分子胶

    2026年发表于《Nature Communications》的研究用高通量DIA全球蛋白质组学在Jurkat细胞中筛选出可经CRBN诱导VAV1降解的苯基-戊二酰亚胺类分子胶,关键降解元件定位在VAV1 C端SH3-2结构域的RDxS基序(796–799位点)。

    推荐理由:研究把高通量蛋白质组学与AI三元复合物折叠串成分子胶发现链,并给出FEP与细胞降解效力的相关性参照。

  9. 晶泰科技62

    晶泰科技与暨南大学在JMC发表RET抑制剂研究,打通专利数据到小鼠药效的研发链路

    晶泰科技联合暨南大学在《Journal of Medicinal Chemistry》发表回顾性案例研究,以两款已上市RET抑制剂的专利数据为基础,仅合成3个化合物即得到RET激酶IC₅₀为0.48 nM的候选分子Cpd-31。

    推荐理由:晶泰科技与暨南大学在JMC发表回顾性案例,展示从专利数据解析到小鼠药效验证的连续研发链路,可作为端到端小分子早期研发流程的参照。

10月8日周四
  1. Valence Labs38

    预测结合亲和力:物理还是AI?

    要预测结合亲和力,你会选择借鉴物理学的经验还是AI的经验? 无论你选哪个选项,你都不太可能到达你想去的地方。 来看看Daniel Ramirez的评论文章,他在文中提出了第三种选项,这一选项有潜力比任何单一领域走得更远。 评论文章链接:https://valencelabs.substack.com/p/chasing-the-grail-a-history-of-binding?r=1ttm57&utm_campaign=post&utm_medium=web

  2. Valence Labs 官网资讯58

    Valence Labs 回顾药物发现中结合亲和力预测的历史

    Valence Labs 的 Daniel Ramirez 撰文梳理靶向药物发现中结合亲和力预测的两条路线:基于物理的对接与分子动力学方法可泛化到新靶点和新化学型,但速度慢且需要起始结构;Boltz-2、Nesso-1 等共折叠模型速度快、无需起始结构,却会在训练数据之外无预警失效。

    推荐理由:梳理结合亲和力预测从物理模拟到共折叠模型的两条路线,并说明两者互补的融合方向。

  3. LeapFun74

    诺和诺德等团队发布Proton-PottsMPNN,将质子化状态写入AI蛋白设计

    丹麦技术大学、MIT与诺和诺德团队在bioRxiv发表预印本,提出Proton-PottsMPNN,通过显式设计氨基酸质子化状态生成酸性条件下结合PD-L1的候选蛋白。

    推荐理由:该预印本把可滴定残基的质子化状态纳入序列设计目标,为条件响应型结合剂设计提供了可复用的建模思路。

  4. AI蛋白质85

    DeepMind发布AlphaProtein Novo:从头设计酶在哌啶合成与DEHP降解中超越自然序列挖掘

    Google DeepMind团队在预印本平台发布AlphaProtein Novo(AP Novo)机器学习流水线,报告从头设计酶在哌啶合成和DEHP降解两个挑战性反应上超越自然序列或突变体筛选。

    推荐理由:该预印本报告从头设计酶在哌啶合成与DEHP降解中超过天然序列筛选,并给出序列集合评分这一可迁移方法。

  5. 途深智合63

    途深智合ToursynClaw完成CLDN18.2第二轮DBTL迭代,Hit Rate从3.4%升至16.0%

    途深智合公布ToursynClaw在CLDN18.2抗体项目中完成第二轮DBTL迭代,25个候选抗体中形成4个优选Hit,Hit Rate由第一轮的3.4%(1/29)提升至16.0%(4/25),相对提升约364%。

    推荐理由:两轮DBTL迭代的命中率与亲和力数据,为评估实验数据回流能否改善抗体设计提供具体参照。

  6. 水木分子38

    水木分子CEO王卓智:AI智能体ChatDD赋能大分子创新药,临床前候选分子研发周期缩短至10个月以内

    水木分子CEO王卓智在2026网易未来大会上称,依托自研AI智能体ChatDD,抗体类大分子药物临床前候选分子研发周期由传统18至24个月缩短至10个月以内。ChatDD覆盖立项调研、靶点评估、分子设计、优化筛选及临床前设计等环节,公司已服务50多家海内外药企和机构,2026年订单数预计增长200%以上。

  7. 晶泰科技58

    晶泰科技在《JACS》报道锑基手性催化剂设计,以计算先行实现92% ee

    晶泰科技在《JACS》发表研究,针对环氧化物与苯胺的不对称开环反应,设计五价锑催化剂并锁定CAC-10,在5 mol%用量、甲苯室温条件下以99%收率和92% ee得到手性β-氨基醇,底物覆盖33种环氧化物与苯胺组合。

    推荐理由:借诺奖手性放大机理切入,介绍晶泰科技用DFT与非线性效应实验设计锑基手性催化剂的工作。

  8. Corin Wagen42

    LLM 逆折叠能力引热议

    Ishaan 在这里做了很酷的工作。这似乎是一个有趣的“临界能力”案例:零样本逆折叠(IF)并不真正奏效,但给出几个示例(以及一些迭代)后,模型就具备了不容小觑的能力。 很期待看到这一方向如何发展。把 LLM 整合进蛋白质设计流程的想法有些奇怪,但也许目前(或不久的将来)相当合理?

10月7日周三
  1. Oxford Protein Informatics Group · Blog70

    OpenBind启动首届盲测挑战:预测寨卡NS2B-NS3蛋白酶与400个化合物的结合构象

    OpenBind联合OpenADMET与ASAP Discovery Consortium于2026年10月14日启动首届OpenBind盲测挑战,要求参赛者预测400个化合物与寨卡病毒NS2B-NS3蛋白酶形成的蛋白-配体复合物,化合物从小片段到类先导分子不等。

    推荐理由:首届OpenBind盲测挑战以寨卡NS2B-NS3蛋白酶为靶点,用更严格的构象与物理有效性标准比较对接与共折叠方法。

  2. CHARM Therapeutics68

    CHARM Therapeutics 宣布 CHM-029 治疗急性髓系白血病的 I/II 期临床试验完成首例患者给药并完成首队列入组

    CHARM Therapeutics 宣布其 menin 抑制剂 CHM-029 在复发或难治性急性髓系白血病(AML)患者的 I/II 期试验(NCT07751991)中完成首例患者给药,并完成首队列入组,初步数据预计 2027 年公布。

    推荐理由:CHARM 的 CHM-029 进入临床,是蛋白-配体共折叠模型设计分子首次推进到人体试验的案例。

  3. 晶泰科技38

    从AI预测到干湿闭环:AI for Science 正在跨越临界点

    晶泰科技自2021年起自建机器人实验室,已建成超300台机器人实验工站的实验集群,整体实验效率较传统人工模式提升5至8倍。该体系由AI生成候选分子与实验方案,机器人完成合成、筛选与测试,实验数据再反哺模型迭代,形成猜想—验证—迭代闭环。其援引的《AI in Science: Early Insights》报告显示,41%受访科学家积压的待测试假设比三年前更多。

  4. Rohith Krishna78

    AlphaProtein Novo 发布从头酶设计流程,结合原子扩散与序列扩散

    Google DeepMind 与 Frances Arnold 团队合作推出从头酶设计流程 AlphaProtein Novo(AP Novo),将原子扩散与离散序列扩散结合用于生成酶。引用内容称,该流程在两个基准反应上取得新骨架(novel-scaffold)活性方面的 SoTA,并设计出用于合成药物基元哌啶和降解环境毒素 DEHP 的酶。相关预印本与代码已发布在 bioRxiv 和 GitHub;转发者评价酶设计仍处早期。

  5. Pranam Chatterjee71

    PepRePs:用pLM生成肽引导重定向磷酸酶实现可编程去磷酸化

    Pranam Chatterjee团队提出PepRePs(peptide-retargeted phosphatases),即用肽引导重定向磷酸酶,目标是实现对任意靶点的可编程去磷酸化。该工作延续其用蛋白语言模型生成肽引导E3(uAbs)和DUB(duAbs)的思路,相关预印本已发布于bioRxiv。

    推荐理由:作者团队把肽引导策略从E3、DUB扩展到磷酸酶,为可编程去磷酸化提供了一条新的设计思路。

  6. BioAge Labs58

    BioAge与诺华在ARDD公布Project APEx靶点发现合作首批结果

    BioAge与诺华在2026年ARDD会议上公布靶点发现合作Project APEx的首批结果,该合作聚焦运动与衰老。报告内容包括心衰诊断前近二十年的血液分子信号、阿尔茨海默病抗性人群的蛋白特征、区分十年体能保持与衰退者的蛋白,以及合作识别的一个新靶点,其证据覆盖心脏、代谢、肌肉和体能性状。APEx结合BioAge基于数十年纵向分子谱与健康寿命指标构建的发现平台和诺华的运动会生理数据。

    推荐理由:BioAge与诺华公开靶点发现合作的首批结果,展示纵向人群分子数据如何指向衰老相关疾病信号。

10月6日周二