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研发方向

AI虚拟细胞(AIVC) 最新动态

AI 虚拟细胞、遗传与药物扰动、细胞状态动态、药物响应/组合及跨条件泛化;与普通分子虚拟筛选分开,不把注释成绩当作响应预测能力。

134 条精选近 30 天 91 条共收录 314 条

更新

精选归档 · 第 4 页

10月23日周五第 61–80 条
10月22日周四
  1. LeapFun73

    OpenAI与PerturbAI、Scripps用约1946个智能体并行解读小鼠全脑CRISPR扰动图谱

    OpenAI、PerturbAI与Scripps Research以约1946个GPT-Rosalind智能体在约32分钟内并行解读小鼠全脑体内CRISPR扰动图谱,并合成可检索的推理图谱、给出可检验假设。

    推荐理由:该预印本用近两千个智能体并行解读小鼠全脑CRISPR扰动图谱,并给出与专家分析对齐的量化结果。

  2. SandboxAQ58

    SandboxAQ 与 Apheris 在柏林推出 Virtual Cell Network,联合药企训练 AQCell

    SandboxAQ 与 Apheris 在柏林宣布推出 Virtual Cell Network,目标是建成由药企主导的最大虚拟细胞网络。成员用自有数据训练 SandboxAQ 的 AQCell 以扩展其适用范围,再针对自身项目微调,原始数据不离开各公司环境;Apheris 负责运营网络并通过其平台交付模型,同时运行 co-folding、ADMET 和抗体可开发性联邦网络。

    推荐理由:药企可在自有数据不出域的前提下联合训练虚拟细胞模型,为跨公司数据协作提供了一种组织方式。

  3. bioRxiv · Bioinformatics59

    ConcuRx:跨异质CRISPR药筛数据稳健识别药物机制相关基因

    作者提出统计框架ConcuRx,用于跨异质CRISPR药物响应筛选数据的整合与基因优先级排序,其基因排名比单数据集分析更稳定。在ATR与PARP抑制剂联合用药的CRISPR药筛数据上,ConcuRx强化了对已发表研究中15个经实验验证假设的支持,包括未纳入该分析的其他独立研究支持的机制。作者称该方法能找回被平均法和重叠法忽略的生物学相关基因,但结果基于预印本摘要报告的计算分析。

    推荐理由:面对异质CRISPR药筛数据,该框架用跨研究变异建模替代简单重叠取交集,为药物机制基因优先级提供可迁移的整合思路。

10月21日周三
  1. NewLimit · Progress Blog58

    NewLimit 披露 2026 夏季进展:首个重编程药物候选推进临床前放大与监管沟通

    NewLimit 在 2026 夏季进展中称,其首个重编程药物候选(LNP-RNA 递送重编程因子 RNA 至肝细胞)已完成放大生产工艺,单批产量超过 2025 年全年总和,制造规模较年初提升 314 倍、部分质量指标提升 13 倍,并在最相关非临床模型中观察到肝脏递送。

    推荐理由:NewLimit 披露首个重编程药物候选的放大生产、动物递送与监管沟通进展,并给出载荷筛选与细胞年龄预测模型的具体提升幅度。

  2. Valence Labs58

    Valence Labs 提出 trajectory replay 持续学习技术,用于 flow matching 与扩散模型

    Valence Labs 提出 trajectory replay,一种面向 flow matching 和扩散模型等连续时间生成模型的持续学习技术,通过用前一模型生成路径的速度场重训模型来提醒其已学内容,全程不生成完整样本。

    推荐理由:该方法用前一模型生成路径的速度场重训,避免生成完整样本,为连续时间生成模型的持续学习提供更省成本的替代方案。

  3. bioRxiv · Bioinformatics68

    免疫世界模型结合多智能体编排用于多肽疫苗设计

    作者提出一个免疫世界模型,用独立的疫苗分支与肿瘤分支、终点特异证据和多智能体编排,把疫苗诱导的致敏与肿瘤天然呈递抗原的识别连接起来。在公开树突状细胞数据上,上下文排序器在供体与抗原来源两种留出设置下分别取得 Recall@20 0.483 和 0.333;结构信息受体预测提供候选排序证据,并在合成条件实验中把交叉呈递系数集中到已知值附近。

    推荐理由:该预印本提出分疫苗与肿瘤两支的免疫世界模型,用多智能体编排把分子预测与天然识别约束连起来。

10月20日周二
  1. bioRxiv · Genomics73

    Bolero模型从DNA预测跨物种细胞状态特异性基因调控

    研究团队开发序列到功能模型Bolero,以图谱规模细胞状态嵌入和额外生物变量为条件,从DNA预测细胞状态特异性染色质可及性与转录本丰度。模型在六大哺乳动物33个数据集共1070万个细胞上训练,在专门模型对比中达到或超过其表现,并能区分皮层区域与发育梯度等相近细胞状态。

    推荐理由:该模型把细胞状态嵌入作为条件输入,使同一DNA序列可在不同细胞状态与物种间查询调控差异。

10月19日周一
  1. LeapFun63

    AI 制药这一周的两条裂缝:现金买发现、市场罚兑现

    LeapFun 复盘 2026 年 10 月中旬 AI 制药的两类信号:阿斯利康与 insitro 签下首付 4000 万美元、最高约 15 亿美元的合作,用 Virtual Human 推进 MASH 与心肌病靶点到 development candidate;Iambic 以 16 美元发行价登陆纳斯达克,毛募资约 1.5 亿美元。

    推荐理由:文章把同周阿斯利康与 insitro 合作、Iambic 上市与生成式设计进展并置,拆出发现端定价与临床兑现之间的落差。

  2. bioRxiv · Bioinformatics63

    DCAF:统一数据有效性、评测有效性与预测建模的单细胞扰动模拟框架

    DCAF 是一个统一单细胞扰动模拟框架,同时处理数据有效性、评测有效性与预测建模。其 DCAF-data 用熵正则最优传输重建扰动前后状态,DCAF-criterion 以非沉默基因的 log fold change 评估模型误差,DCAF-model 结合 JEPA 与显式调控动力学建模。

    推荐理由:该框架把数据重建、评测准则与预测模型统一起来,并在跨基因、跨细胞类型与跨区域设置下与深度模型及简单基线比较。

  3. bioRxiv · Bioinformatics74

    研究审计单细胞扰动模型的置信度校准基准

    研究构建了单细胞扰动模型评测框架,覆盖 Norman 2019 与 Replogle 2022 两个数据集、六种数据集-划分组合、scVI、CPA 与线性 Ridge 三个模型及 MC dropout、分位数回归、分裂共形预测三种不确定性量化方法,再用此前未纳入的零基线审计该框架。

    推荐理由:该预印本审计单细胞扰动模型评测框架,揭示指标名与实际测量对象不符的六类失效模式。

  4. 动脉网58

    粒曼生物完成数千万元天使轮融资,布局虚拟细胞扰动数据基础设施

    粒曼生物于2026年10月完成数千万元天使轮融资,由上海弘晖领投,兴华鼎立和杭州润苗基金跟投,川越周期担任财务顾问。公司专注高通量细胞编辑与扰动样本数据生产,已完成覆盖人类19,883个基因的阵列式扰动文库建设与湿实验验证。

    推荐理由:融资事件同时披露了已开源扰动数据集的使用规模,可观察虚拟细胞上游数据供给的产业化路径。

  5. BioArt78

    Arc Institute团队在Cell发表scBaseCount:AI智能体构建5.02亿细胞单细胞转录组数据库

    Arc Institute的Yusuf H. Roohani和Hani Goodarzi团队在Cell发表scBaseCount,用AI智能体SRAgent从SRA挖掘并标准化重分析10× Genomics单细胞数据,汇集超过5.02亿个细胞、覆盖27个物种和75种组织。

    推荐理由:该研究用AI智能体从SRA挖掘并统一重分析单细胞数据,为细胞基础模型训练提供了可比较的数据规模与扰动识别增益。

10月18日周日
  1. BioTender58

    《Molecular Cell》推出AI分子生物学专题,14篇内容聚焦预测与实验验证边界

    《Molecular Cell》第86卷第20期于2026年10月15日推出“Artificial intelligence in molecular biology”专题,共14篇内容,包括1篇社论、5篇Insights、6篇综述和2篇原创研究,覆盖蛋白、RNA、基因编辑和单细胞。

    推荐理由:专题把蛋白设计、RNA与单细胞预测放进同一证据框架,并逐项标出计算预测与实验验证的边界。

  2. BioArt58

    GenBio AI 团队在 Cell 提出虚拟细胞世界模型框架

    GenBio AI 的 Eric Xing(邢波)与 Le Song(宋乐)团队在 Cell 发表观点文章,提出虚拟细胞世界模型(VCWM)的操作定义与架构,将其描述为多模态、多尺度、动态且有状态的计算系统。

    推荐理由:GenBio AI 团队在 Cell 提出虚拟细胞世界模型的模块划分与评测路线,为理解细胞模拟器的架构与数据需求提供框架。

10月17日周六
  1. bioRxiv · Bioinformatics58

    MOFI 框架从配对多组学快照重建连续细胞命运转变

    作者提出多组学命运推断框架 MOFI,从多个时间点的配对多组学快照重建连续细胞命运转变,并联合建模各模态状态动态、跨组学对应关系与群体增长。

    推荐理由:该框架把离散配对多组学快照重建为连续命运轨迹,并在类器官与造血体系中给出扰动响应预测。

  2. 木可AI探索笔记58

    Evo团队新公司Radical Numerics获5000万美元种子轮,预览基因组模型Omnii

    由Evo和Evo 2原班人马创立的Radical Numerics于2026年6月15日公开亮相,并宣布5000万美元种子轮,由Emergence Capital领投,Obvious Ventures、Triatomic Capital、Factory、First Spark Ventures跟投。

    推荐理由:梳理Evo团队新公司押注基因组基础模型的路线差异,并指出Omnii尚未开源、数字待独立复现的边界。

10月16日周五
  1. PLOS Computational Biology60

    CLIMB与CLIFF框架通过单细胞到bulk转录组映射计算解卷积药物敏感性

    【摘要级】研究提出两步机器学习框架CLIMB与CLIFF,先将bulk RNA-seq解卷积为细胞类型组成与表达,再把bulk药物敏感性测量解析为细胞亚型和单细胞特异的谱。

    推荐理由:该框架把 bulk 药物敏感性拆解到细胞亚型与单细胞分辨率,并在急性髓系白血病数据上给出可对照的验证。