bioRxiv · Genomics· Liu, H., Mao, S., Gallent, T., Chen, Y., Yan, Z., Vogel, I., Traunmuller, L., Zhang, R., Buenrostro, J. D., Zhou, J., Greenberg, M. E. ·· 20 天前精选AI 评分73
Bolero模型从DNA预测跨物种细胞状态特异性基因调控
Predicting cell-state-specific gene regulation from DNA across species
AI 导读
研究团队开发序列到功能模型Bolero，以图谱规模细胞状态嵌入和额外生物变量为条件，从DNA预测细胞状态特异性染色质可及性与转录本丰度。模型在六大哺乳动物33个数据集共1070万个细胞上训练，在专门模型对比中达到或超过其表现，并能区分皮层区域与发育梯度等相近细胞状态。
推荐理由
该模型把细胞状态嵌入作为条件输入，使同一DNA序列可在不同细胞状态与物种间查询调控差异。
来源：bioRxiv · Genomics · biorxiv.org