bioRxiv · Bioinformatics· Xia, T., Lei, C., Chen, N., Hou, H., Zhang, H., Qin, H., Wang, D., Li, Q., Zhang, Y., Fang, S., Li, Y. ·· 21 天前精选AI 评分63
DCAF:统一数据有效性、评测有效性与预测建模的单细胞扰动模拟框架
DCAF: Unifying Data Validity, Evaluation Validity and Predictive Modeling for Single-cell Perturbation Simulation
AI 导读
DCAF 是一个统一单细胞扰动模拟框架,同时处理数据有效性、评测有效性与预测建模。其 DCAF-data 用熵正则最优传输重建扰动前后状态,DCAF-criterion 以非沉默基因的 log fold change 评估模型误差,DCAF-model 结合 JEPA 与显式调控动力学建模。
推荐理由
该框架把数据重建、评测准则与预测模型统一起来,并在跨基因、跨细胞类型与跨区域设置下与深度模型及简单基线比较。
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