Antiverse播客谈AI抗体设计
欢迎收听我们最新一期#FODD节目,嘉宾是诺和诺德抗体设计高级数据科学家Rahmad Akbar。 我们聊了#人工智能如何为抗体设计创造新可能。 https://hubs.la/Q02Nm3Ny0 #antibodydiscovery
欢迎收听我们最新一期#FODD节目,嘉宾是诺和诺德抗体设计高级数据科学家Rahmad Akbar。 我们聊了#人工智能如何为抗体设计创造新可能。 https://hubs.la/Q02Nm3Ny0 #antibodydiscovery
为什么靶点特异性抗体库对处理具有挑战性的靶点有用? 尽管预测准确性仍然有限,AI设计的抗体库提供了一种开始攻克“不可成药”靶点(如GPCR和离子通道)的途径。 #biotech #machinelearning #antibody
↓ 如何为具有挑战性的靶点发现抗体 ↓ 我们开发了一个AI驱动的抗体设计平台,用于GPCR及其他具有挑战性的靶点。通过这些简短的图文面板了解更多关于我们技术工作原理的信息。 #人工智能 #生物制品 #科技生物
HotSpot Therapeutics 将于 2024 年 ESMO 大会以口头报告形式公布口服选择性 CBL-B 抑制剂 HST-1011 的首次人体 1 期临床数据,重点为单药剂量递增部分的安全性、暴露与药效学指标。该报告编号 991O,安排在 9 月 13 日 investigational immunotherapy 专场。
不久的将来,抗体发现会是什么样? 欢迎查看我们最新发布的文章……⭐️ https://www.linkedin.com/posts/antiverse_antibodydiscovery-biotechnology-machinelearning-activity-7217161258129633280-nmhT?utm_source=share&utm_medium=member_desktop
DeepLife 带来激动人心的消息!🚀 我们开启了 CENTURI Hackathon 2024! 我们的 CTO Jean-Baptiste Morlot 展示了我们用于重建细胞数字孪生的突破性生成式 AI。衷心感谢我们团队和合作伙伴的支持!🙌 #Innovation #AI #BioTech #Deeplife
寻明生科在WAIC 2024入选“Future Tech 100未来之星”,并作为AI+制药领域两家入围企业之一参与Future Tech创新项目路演,介绍生成式AI与高通量数字生物学助力抗体设计。公司成立于2023年,结合高通量单细胞功能筛选、蛋白超突变进化和结构启发的生成式AI大模型,打造干湿闭环智能大分子药物发现平台。成立一年内已与10家跨国药企和知名biotech达成合作。
Ignota Labs与Broad Institute合作在《Journal of Chemical Information and Modelling》发表研究,提出先预测九项代理DILI标签、再与化学结构特征结合预测药物性肝损伤的DILIPredictor模型。
推荐理由:该研究把体外与体内代理指标并入特征,比较其对DILI预测的提升,并给出可复用的公开模型。
HotSpot Therapeutics 在第四届 AACR 恶性淋巴瘤国际会议展示 MALT1 支架抑制剂 HST-1021 的临床前数据,该候选化合物在体外强效抑制 NF-kB 与 AP1 活性。与 MALT1 蛋白酶抑制剂不同,HST-1021 未观察到对蛋白酶活性或 T 细胞功能的影响,且未在体内耗竭 Treg 细胞。公司称其抗肿瘤活性比 MALT1 蛋白酶抑制剂更显著、更广。
AlphaFold 3 对抗体发现意味着什么?👩🔬🤖 来看看我们在 LinkedIn 上的简要解读 🔗https://www.linkedin.com/feed/update/urn:li:activity:7209480125375991810
寻明生科与碧迪医疗(BD)启动合作项目,将利用寻明生科生成式AI赋能的抗体发现与工程平台开发高性能科研试剂。寻明生科称其结合超高通量单细胞功能筛选、酵母自主超突变与结构感知生成式AI模型,用于双特异性抗体、ADC及难成药靶点药物研发。
带着友谊的益处做科学,或许反过来也一样!超级有趣的一篇……一如既往,与无可匹敌的 @aa_petruzzella 和 @elisa_oricchio 合作
A-Alpha Bio 获美国国防部追加 1450 万美元资助,用于开发快速预测针对潜在生物威胁的治疗方案的机器学习模型。资金来自 JPEO-CBRND,将扩大其与劳伦斯利弗莫尔国家实验室在 GUIDE 项目下的合作。此前两年合作中,A-Alpha 的 AlphaSeq 数据被用于训练预测抗体-抗原结合的机器学习模型,合作范围从冠状病毒扩展到多个未披露的病原体家族。
推荐理由:该资助延续 A-Alpha Bio 与 LLNL 的抗体-抗原结合预测合作,并扩大病原体范围。
HotSpot Therapeutics宣布将在6月19-22日于费城举行的第4届AACR恶性淋巴瘤国际会议上展示其MALT1项目的更多临床前数据,报告题为“以MALT1支架抑制剂靶向CBM信号体治疗非霍奇金淋巴瘤”(PO-036)。该MALT1项目被公司称为高度差异化,其Smart Allostery™平台结合计算方法与AI驱动的大规模数据挖掘,用于发现靶向蛋白“天然热点”的口服小分子变构药物。
蛋白质设计越来越奇特……也越来越有功能了!这些设计非常奇特! https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.07.592871v1 与 @karla_mcastro @_JosephWatson @jueseph @UWproteindesign 的有趣合作
Ignota Labs 首席数据科学官兼联合创始人 Layla Hosseini-Gerami 在《The Biochemist》撰文,讲述其从利兹大学化学专业、Optibrium 计算化学实习到剑桥大学化学信息学博士的历程。她于2022年2月与 Jordan、Sam 共同创立 Ignota Labs,公司2023年10月起全职运营,专注用可解释 AI 方法预测、理解并扭转药物发现中的安全性问题。
Ignota Labs 用数据驱动的计算机模型识别药物毒性根因,为科学家改善药物安全性提供信息,其专有平台名为 SAFEPATH。该公司称,临床药物开发失败率高达 90%,安全性是主要因素之一,而体外试验和动物模型并不总能很好地转化到人体。相关访谈在 ELRIG Research and Innovation 2024 活动上进行。
太棒了!希望你们讨论它的乐趣,和他写它时的乐趣一样多! (引用推文:今天的期刊俱乐部由 @CasperGoverde、@MartinPacesa 等人展示,来自 @befcorreia 实验室,主题是膜蛋白可溶性类似物的计算设计。)
我们实验室在小分子设计方面的一次有趣探索 https://rdcu.be/dErPa 很高兴与一群很棒的人合作,让这件事成为可能 @igashov @HannesStaerk @rneschneuing Clemence Vignac @vgsatorras @pafrossard @wellingmax @mmbronstein
Ignota Labs与Broad Institute合作,基于美国FDA的DICTrank数据集构建药物诱导心脏毒性(DICT)预测分类器,成果发表于《Journal of Chemical Information and Modelling》。
推荐理由:研究基于FDA的DICTrank数据集构建公开分类器,比较化学与生物特征对药物心脏毒性的预测能力。
Ignota Labs 从伦敦迁至剑桥科学园并启用新设施,公司凭借 AI 平台 SAFEPATH 专注于挽救存在安全性问题的药物。SAFEPATH 利用因果知识图谱梳理导致药物不良反应的关系与通路,以识别和缓解潜在安全性问题。该公司近期获得 OxbridgeAI Challenge 奖项。
Eikon Therapeutics在第42届J.P. Morgan医疗健康大会上公布管线进展:TLR 7/8共激动剂EIK1001获FDA IND许可,已启动联合帕博利珠单抗加化疗治疗晚期肺癌的2期试验;高选择性PARP1抑制剂EIK1003已在美进入1/2期试验并招募患者。
HotSpot Therapeutics在第65届ASH年会上以口头报告公布MALT1支架功能抑制剂HST-1021的临床前数据,该候选分子经Smart Allostery平台设计,选择性抑制MALT1支架功能而保留其蛋白酶功能。
Ignota Labs 于12月8日赢得首届 Oxbridge AI Challenge 奖,联合创始人兼 CDSO Dr Layla Hosseini-Gerami 表示将把奖金用于为 AI 模型获取实验室验证。该竞赛旨在识别、支持和资助有前景的 AI 初创想法,公司称正用深度学习扭转有潜力但失败的药物。
寻明生科与苏州康宁杰瑞签署合作协议,将结合前者单细胞功能筛选、合成生物学与AI技术平台和后者药物开发经验,联合推进first-in-class和best-in-class药物发现。寻明生科将获得首付款开展研究,并在项目后续获得里程碑付款和销售分成。
寻明生科(Aureka Biotechnologies)宣布加入英伟达初创加速计划(NVIDIA Inception),将获得英伟达硬件、软件、深度学习工具及行业专业知识支持。这家AI驱动药物发现公司专注于双特异性抗体、ADC和难成药靶点药物的设计与优化,通过融合多模态制药数据与结构感知生成式AI模型开展研发。
干得漂亮,伙计们!!!! 引用推文核心内容:我们非常激动地分享,我们的综述论文《深度学习赋能蛋白质设计的新时代》现已上线!https://doi.org/10.1016/j.cels.2023.10.006 与 @rneschneuing @igashov @CasperGoverde @mmbronstein @befcorreia 的出色团队合作
Bruno Correia 转发介绍与 Sailan Shui 合作的蛋白质设计项目,相关成果发表于 Nature Chemical Biology,通过设计受体在细胞中实现多种带通滤波行为。作者本人仅表示在细胞中工程化非平凡行为很有乐趣,未披露具体性能数据。
推荐理由:该工作用蛋白质设计构建化学响应带通滤波器受体,为细胞行为工程提供可参考的设计思路。
HotSpot Therapeutics在2023 SITC年会上公布CBL-B项目临床前数据,其CBL-B抑制剂在体外和体内实验中使磷酸化ZAP70、Notch1和IGF1R呈现稳健的剂量依赖性效应,支持其作为HST-1011临床评价的近端生物标志物。
HotSpot Therapeutics 将于2023年12月9-12日在圣迭戈举行的第65届 ASH 年会上以口头报告公布其 MALT1 项目的临床前数据,该首创小分子选择性抑制 MALT1 支架功能而非蛋白酶功能。公司称该支架抑制剂相较传统 MALT1 蛋白酶抑制剂可能具有更优的疗效与安全性,并计划于2024年为开发候选药物 HST-1021 提交 IND 申请。
我们跑得不错!但看起来继任者们干劲十足!!!!未来几年只会越来越好
比 Netflix 还便宜!!!!!
太有意思了!!!! (引用推文:@mmbronstein 发布了我与 @befcorreia 关于蛋白质生成模型的对话录像——@vant_ai 研讨会系列)
HotSpot Therapeutics 将于2023年11月1-5日在圣地亚哥举行的SITC年会上以海报形式展示其CBL-B项目的临床前数据,报告聚焦人外周血单个核细胞中CBL-B抑制的近端生物标志物(摘要编号55)。
A-Alpha Bio 宣布扩大与 Amgen 自 2022 年开始的合作,进一步推进分子胶的理性发现。过去六个月中,A-Alpha Bio 在 Amgen 选定的靶点与一组 E3 泛素连接酶之间发现若干弱相互作用,提示或可通过小分子增强结合来诱导靶点降解;Amgen 随后对新识别的连接酶-靶点配对进行了验证。双方现将扩大合作,进一步研究选定配对,以期为分子胶降解剂的理性设计提供依据。
推荐理由:A-Alpha Bio 与 Amgen 在已有合作基础上扩大分子胶发现合作,披露了从弱相互作用筛选到靶点降解验证的推进路径。
Eikon Therapeutics 完成 TLR 7/8 共激动剂项目整合,其与 Impact Therapeutics 合作的高选择性 PARP1 抑制剂 IMP1734 获 FDA IND 许可,计划第四季度启动 Phase 1。
A-Alpha Bio 完成 2240 万美元 A2 轮超额认购融资,由现有投资方 Perceptive Advisors Xontogeny Ventures 领投,Madrona 等现有投资方跟投,Breakout Ventures 新加入。资金将用于推进其蛋白-蛋白相互作用数据平台并加速内部管线开发,公司称平台已在生物制剂和分子胶内部项目中取得早期进展。
A-Alpha Bio 宣布与 Gilead Sciences 合作,利用其合成生物学与机器学习专长发现治疗 HIV 的长效生物药。合作将先用 AlphaSeq 平台表征候选药物与 HIV 抗原变体之间的结合亲和力并产生大量数据,再输入机器学习平台 AlphaBind 预测具有更强结合广谱性和抗病毒逃逸能力的蛋白。双方目标是开发高交叉反应性的生物药,以中和多种突变形式的 HIV。
推荐理由:A-Alpha Bio 与 Gilead 合作开发长效 HIV 生物药,展示了 AlphaSeq 与 AlphaBind 双平台在结合广谱性优化上的应用路径。
太美了,也太重要了……真是百看不厌! ⚛️蛋白质结构是阐明细胞过程分子细节的关键。#AlphaFold2 等工具揭示了数百万个三级结构,但这些蛋白质的四级结构在很大程度上仍是个谜。以下是如何弥合这一差距。线程👇 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.06.09.544317v1
Eikon Therapeutics 通过三笔交易获得多项早期至中期资产权益,包括从 Seven and Eight Biotherapeutics 引进已在逾150名晚期难治性实体瘤患者中测试的 TLR7/8 激动剂免疫调节剂全球开发与商业化权利。