研发方向
AI 辅助治疗性单抗/双抗从头设计、CDR 构型优化、亲和力成熟、抗体人源化与成药性评估。
141 条精选近 30 天 73 条共收录 286 条
BindCraft2 v1.0.4 已发布，作者称该版本显著改进了 VHH、scFv、ARP 和诱导契合靶向能力，同时提升了运行速度与代码稳定性。作者建议此前困难的结合剂设计任务可再次尝试，并致谢 Erik Mäeots、Leonardo Tredese 和 Elizaveta Chernova 的工作。
推荐理由：BindCraft2 新版本针对 VHH、scFv 与诱导契合靶向改进，为结合剂设计流程提供了可复用的更新参照。
研究提出关系感知图-超图网络RA-GHN，将基于图的成对建模与生物物理超图结合，用于抗体CDR的序列-结构协同设计。其异质超图使用表位-互补位相互作用斑块、空间结构簇和高连接度枢纽结构，双通路架构在保持SE(3)等变性的同时整合关系感知等变图网络与等变超图编码器。作者还提出结构-序列解耦指数以平衡结构可靠性与序列新颖性，摘要称其在标准基准和亲和力优化任务上优于现有基线。
推荐理由：该预印本用图与超图联合建模抗体界面多体相互作用，为CDR序列-结构协同设计提供可迁移的建模思路。
文章介绍上海交大团队与 Jordi Marti 等 2026 年发表的 Mimotope-Guided Molecular Dynamics 方法，用噬菌体选出的 mimotope 经微秒级分子动力学精修抗体结合姿势，再用 Folddisco 映射回抗原以定位功能表位。
推荐理由：文章把几何接触面与功能热点的区别讲成可执行流程，并给出四套晶体体系的命中率与对照结果。
研究利用实验解析的 bNAb/HIV-1 Env 复合物结构与能量描述符构建机器学习模型，预测多个 HIV-1 分支的结合自由能（∆G）和解离常数（KD），其中 XGBoost 表现最佳，训练与测试 R2 分别为 0.92 和 0.658。
推荐理由：研究用实验解析的 bNAb-Env 复合物结构特征训练模型，预测不同 HIV-1 分支的结合自由能差异，为免疫原设计提供定量参照。
动脉网分析指出，Chai Discovery成立两年、无自研管线，靠蛋白与抗体设计模型在9个月内与礼来、辉瑞、诺华、argenx、百时美施贵宝、GSK签下7笔合作，2026年7月完成4亿美元融资、估值约38亿美元。
推荐理由：以Chai与六家药企的合作为切口，梳理药企从买管线转向买模型使用权，以及失败数据成为AI制药新筹码的变化。
牛津 OPIG 的 Gemma Gordon 在博士项目中开发了 Therapeutic Nanobody Profiler（TNP），用 6 项针对纳米抗体特性的指标，将候选纳米抗体的结构与理化性质对照 36 个临床阶段样本进行基准评估。
推荐理由：作者介绍其博士项目开发的纳米抗体可开发性评估工具，说明指标构成、临床参照集与配套实验数据来源。
牛津 OPIG 团队发布天然适应性免疫受体数据库系列的最后一项 OAS-nano，收录 7300 万条 VHH 序列，并配有可检索网页应用。该库整合了迄今所有公开释放原始全长纳米抗体 NGS 数据的文献，在相同去冗余过滤下规模为此前最大资源的 5 倍。
推荐理由：该数据库把公开纳米抗体测序数据统一处理并标注扩增方案差异，为免疫库语言模型训练提供可追溯的数据基础。
10月14日，Vir Biotechnology宣布与吉利德达成合作和许可协议，共同发现和开发3款针对实体瘤相关抗原的双掩蔽T细胞衔接器（TCE）。Vir将用其dAIsY平台和PRO-XTEN掩蔽技术负责发现、设计和优化候选物，吉利德拥有独家许可并负责后续开发、制造和商业化。
推荐理由：协议把前期对价、临床前里程碑与后续开发里程碑分开列出，可看清TCE平台合作的付款结构。
丹纳赫于2026年10月7日宣布计划推出旗下首个AI驱动自主实验室，用于加速定制抗体及其他分子工具的发现，预计2027年初实现规模化运营。
推荐理由：丹纳赫披露自主实验室的整合方式与产能目标，可作为抗体发现自动化的产业参照。
研究从合成单域抗体库中筛选出靶向IL-12 p40亚基的候选2F3，其预测表位与Briakinumab、Ustekinumab相同。作者基于AI预测的IL-12/sdAb复合物结构理性设计11个点突变，其中3个提升结合亲和力，组合后亲和力较原始先导克隆提高8倍。该结果基于预印本摘要报告，亲和力数据来自结合实验而非细胞或临床验证。
推荐理由：研究用AI预测的IL-12/单域抗体复合物结构指导定点突变，为合成库低亲和力结合剂的理性优化提供参照。
研究构建基于 bulk 与单细胞 RNA 表达特征的排序框架，在六种实体瘤中对 4,532 个候选表面蛋白靶点按肿瘤特异性、正常组织安全性和血液 Sink 特征打分，并以已进入临床的肿瘤相关抗体靶点作回顾性验证。
推荐理由：研究用单细胞与 bulk RNA 表达特征回溯排序已进入临床的抗体靶点，为靶点优先级评估提供参照。
研究人员在Science Advances报告了一套整合多重荧光酵母展示、深度测序与AlphaFold 3复合物预测的VHH纳米抗体发现框架，以长链三指型α-神经毒素为对象。
推荐理由：研究把酵母展示筛选与AlphaFold 3结构优选串成一条VHH发现流程，并给出精确率与召回率的实测权衡。
韩国科学技术院（KAIST）的 Hyosoon Jang、Taewon Kim 和 Sungsoo Ahn 在 arXiv 预印本 Co-folding with a Soup of Representations 中提出 SoupFold。
推荐理由：该预印本把多个结构模型的成对表征融合后重新生成结构，并给出抗体抗原与分子胶基准上的对照结果。
英灵殿科技团队提出 OFAntibody，一个以抗原结构、指定表位和预定义抗体框架或双抗构型为输入、生成 CDR 全原子结构的统一框架，支持纳米抗体单抗及 tandem VHH、diabody、CODV-like 等双抗构型的联合设计。
推荐理由：该研究把双抗两个结合臂与连接区放在同一全原子框架中联合生成，并给出与独立拼接的碰撞对比。
【全文总结】作者开发AutoHMD自动化流程，用升温分子动力学（310–390 K）评估抗体-抗原复合物界面稳定性，以区分高质量与错误结合姿态。在来自AbSet的30个PDB条目对接姿态上，平均iRMSD在2.52 Å阈值下对高质量与错误姿态分类准确率90.0%（MCC=0.80），外部重对接集准确率95.2%；该阈值直接迁移到Boltz-2生成的12个模型时区分度下降且存在重叠。
推荐理由：研究用升温分子动力学区分抗体-抗原对接与Boltz-2模型的结合姿态质量，并给出可迁移的iRMSD阈值。
途深智合公布ToursynClaw在CLDN18.2抗体项目中完成第二轮DBTL迭代，25个候选抗体中形成4个优选Hit，Hit Rate由第一轮的3.4%（1/29）提升至16.0%（4/25），相对提升约364%。
推荐理由：两轮DBTL迭代的命中率与亲和力数据，为评估实验数据回流能否改善抗体设计提供具体参照。
Adaptyv Bio 宣布 Anthropic x Adaptyv 蛋白设计竞赛第二期，目标是设计优于现有药物的 TNF-α 结合剂，并能在细胞内体 pH 6.0 条件下选择性释放以改善药物半衰期。设计要求还包括同时结合人源和小鼠 TNF-α，以便在临床前模型中测试同一设计。
推荐理由：比赛把 TNF-α 结合剂设计放到 pH 6.0 选择性释放和跨人鼠结合的双重约束下，可观察设计如何兼顾亲和力与可开发性。
Xaira 的 Justas Dauparas 介绍团队开发的 X-Design，称其能针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规发现方法攻克。相关细节见 Xaira 官网新闻页，推文未披露具体靶点、实验数据或验证结果。
推荐理由：Xaira 员工披露 X-Design 针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规方法发现。
Absci 公布其计划中的 2 期 STORYLINE 临床试验的关键设计细节，该试验评估 AI 设计的抗体 ABS-201 治疗子宫内膜异位症相关疼痛。ABS-201 靶向催乳素受体，拟提供非性激素的新疗法路径；公司称全球约 1.9 亿女性受子宫内膜异位症影响，现有 FDA 批准的药物治疗均为影响雌激素的性激素疗法，手术切除病灶五年内复发率接近 50%。
推荐理由：Absci 披露 AI 设计抗体 ABS-201 的 2 期试验设计细节，为观察非性激素类子宫内膜异位症疗法提供参照。
Generate:Biomedicines 与 Roswell Park 合作开发 GB-5267，这是一款针对卵巢癌、经 AI 设计识别肿瘤锚定 MUC16 的 CAR T 疗法。公司博客以“Engineering CAR T-Cells to Function Where Others Fail”为题说明其设计思路，并提出一期临床需要回答的问题。
推荐理由：Generate:Biomedicines 与 Roswell Park 公布 AI 设计的 MUC16 CAR T 候选物，并说明其设计思路与一期临床待解问题。