bioRxiv · Bioinformatics· Wei, J., Zhang, S., Duan, H., Wei, L., GUO, J. ·· 22 天前精选AI 评分58
RA-GHN：关系感知图-超图网络用于抗体序列-结构协同设计
Relation-Aware Graph-Hypergraph Networks for Antibody Sequence-Structure Co-Design
AI 导读
研究提出关系感知图-超图网络RA-GHN，将基于图的成对建模与生物物理超图结合，用于抗体CDR的序列-结构协同设计。其异质超图使用表位-互补位相互作用斑块、空间结构簇和高连接度枢纽结构，双通路架构在保持SE(3)等变性的同时整合关系感知等变图网络与等变超图编码器。作者还提出结构-序列解耦指数以平衡结构可靠性与序列新颖性，摘要称其在标准基准和亲和力优化任务上优于现有基线。
推荐理由
该预印本用图与超图联合建模抗体界面多体相互作用，为CDR序列-结构协同设计提供可迁移的建模思路。
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