Chai Discovery两年估值38亿美元，9个月与6家药企签下7笔合作
动脉网分析指出，Chai Discovery成立两年、无自研管线，靠蛋白与抗体设计模型在9个月内与礼来、辉瑞、诺华、argenx、百时美施贵宝、GSK签下7笔合作，2026年7月完成4亿美元融资、估值约38亿美元。
推荐理由：以Chai与六家药企的合作为切口，梳理药企从买管线转向买模型使用权，以及失败数据成为AI制药新筹码的变化。
研发方向
蛋白质设计 最新动态
蛋白、结合剂与治疗相关大分子设计及模型；结构预测、实际表达、结合、功能与可开发性分别判断，不将预测直接当作实验成功。
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动脉网精选AI 评分7171 Bioinformatics (Oxford)精选AI 评分7070 Seq2Pocket：基于ESM-2微调与口袋平滑的蛋白结合位点预测
【全文总结】Seq2Pocket 以微调的 ESM-2（3B）为残基级预测核心，加入基于嵌入的口袋平滑分类器和表面聚类后处理，在 LIGYSIS 通用结合位点与 CryptoBench 隐蔽结合位点评测中取得所比较方法里最好的 DCCtop-N 和 DCCtop-(N+2)。
推荐理由：研究展示训练数据扩充与后处理对结合位点预测的影响，并指出聚类碎片化会虚高口袋级指标。
Oxford Protein Informatics Group · Blog精选AI 评分6565 OPIG 发布 Therapeutic Nanobody Profiler 纳米抗体可开发性评估工具
牛津 OPIG 的 Gemma Gordon 在博士项目中开发了 Therapeutic Nanobody Profiler（TNP），用 6 项针对纳米抗体特性的指标，将候选纳米抗体的结构与理化性质对照 36 个临床阶段样本进行基准评估。
推荐理由：作者介绍其博士项目开发的纳米抗体可开发性评估工具，说明指标构成、临床参照集与配套实验数据来源。
DeepTech深科技精选AI 评分8383 David Baker团队在Nature连发两篇论文，AI从头设计蛋白酶最高催化加速超100亿倍
华盛顿大学David Baker团队10月14日在Nature发表两篇论文，用RFdiffusion、ProteinMPNN和AlphaFold 3从头设计半胱氨酸蛋白酶与金属蛋白酶。
推荐理由：两篇 Nature 论文报告从头设计半胱氨酸与金属蛋白酶的实验成功率与催化加速，并给出与天然酶的差距。
bioRxiv · Bioinformatics精选AI 评分5858 BCell-Epitope-Prediction：本地可复现的多表位疫苗设计流程及PDB复合物结构验证
作者发布BCell-Epitope-Prediction，一个本地运行、无需联网的多表位疫苗设计流程，整合14个外部工具、分8个主要阶段，并用内容自缓存。
推荐理由：该预印本把四种B细胞表位预测引擎的逐残基打分融合，并在17个PDB抗原抗体复合物上做结构验证，为多表位疫苗设计流程提供可复现参照。
bioRxiv · Bioinformatics精选AI 评分5858 E3 Ligase Ligandalyzer 1.0 发布：面向E3连接酶招募配体选择的结构优先平台
作者发布 E3 Ligase Ligandalyzer Version 1.0，一个可免费访问的网页平台，用于比较探索实验解析的 E3 连接酶与招募配体复合物。
推荐理由：该平台把已解析的E3连接酶与招募配体复合物整理成可比较的化学与结构视图，为降解剂设计选配体提供参照。
bioRxiv · Bioinformatics精选AI 评分6363 为何BindCraft2的627条轨迹未产出任何结合剂
作者用BindCraft2（v1.0.3）针对人乳酸脱氢酶A（LDHA）浅表K81乳酰化表位开展两轮环肽设计，627条轨迹均未获得可接受设计。
推荐理由：复盘627条BindCraft2轨迹全部失败的原因，指出筛选阈值与损失函数在环肽场景下的错配。
奶牛猫的CADD实验室精选AI 评分7171 GluePlex 提出无三元结构下的分子胶计算优化路线
发表在 Nature Communications 的 GluePlex 研究针对 VAV1 分子胶，在缺少三元复合物实验结构时用 PeSTo 预测接触区域、HADDOCK 对接生成 6 个构象簇模板，再由 Boltz-2 共折叠生成 120 个候选三元结构并按 chainpair_ipTM 筛选。
推荐理由：该研究把蛋白对接、共折叠与自由能计算串成分子胶优化流程，为缺少三元结构的项目提供可迁移做法。
智药邦精选AI 评分6363 WhiteLab Genomics完成2600万美元B轮融资，推进AI设计基因组药物
2026年10月6日，WhiteLab Genomics宣布完成2600万美元B轮融资，由AVP领投，Yaday Health、Blast Club新加入，Omnes、Debiopharm继续参投。
推荐理由：融资事件之外，材料还给出AI设计AAV载体穿越血脑屏障的体内数据，可作为基因组药物递送方向的参照。
生物药大时代精选AI 评分6666 Vir Biotechnology与吉利德达成18.75亿美元实体瘤双掩蔽TCE合作
10月14日，Vir Biotechnology宣布与吉利德达成合作和许可协议，共同发现和开发3款针对实体瘤相关抗原的双掩蔽T细胞衔接器（TCE）。Vir将用其dAIsY平台和PRO-XTEN掩蔽技术负责发现、设计和优化候选物，吉利德拥有独家许可并负责后续开发、制造和商业化。
推荐理由：协议把前期对价、临床前里程碑与后续开发里程碑分开列出，可看清TCE平台合作的付款结构。
木可AI探索笔记精选AI 评分7474 David Baker 团队推出 Prompteina：用自然语言指令设计蛋白并在 GM2A 靶点筛出 6 个结合剂
David Baker 团队发布蛋白生成模型 Prompteina，以英伟达 Complexa 为底子、用 5240 万条结构描述训练，可直接接受自然语言指令设计蛋白。据该文，它在 18 项任务中胜出 15 项，折叠架构控制指标提升到 51.1%，在 20 个靶点盲测中至少胜出 13 个。湿实验针对 GM2A 靶点挑选 90 个设计，筛出 6 个有效结合剂，最强亲和力为 107 nM。
推荐理由：介绍 Prompteina 用自然语言指令驱动蛋白生成，并给出湿实验筛出结合剂的结果，便于了解该方向的方法与证据边界。
木可AI探索笔记精选AI 评分8383 David Baker团队提出文本条件化全原子蛋白生成模型Prompteina，GM2A结合剂湿实验命中率6.7%
David Baker团队联合新加坡国立大学和AI2提出文本条件化全原子蛋白质结构生成模型Prompteina，以自然语言作为统一条件入口，基底为NVIDIA团队的Complexa。
推荐理由：梳理Prompteina如何用自然语言统一蛋白生成接口，并完整走通agent设计到湿实验命中的链条。
晶泰科技精选AI 评分6868 晶泰科技 siRNA 项目 9 个月确认 PCC，IgA 肾病候选分子展现同类最佳潜力
晶泰科技宣布其首个 siRNA 项目从立项到确认临床前候选分子（PCC）用时 9 个月，候选分子拟用于 IgA 肾病治疗。临床前研究显示，该分子体外沉默活性达亚纳摩尔级，与同靶点临床阶段参照分子相比 IC50 降低数十倍；非人灵长类动物平行对照研究中单次给药后数月内持续维持高水平靶蛋白抑制，毒理试验显示更大安全窗口。
推荐理由：晶泰首个 siRNA 项目 9 个月确认 PCC，其临床前活性与长效性数据为观察 AI 序列设计在受限靶点空间中的实际产出提供参照。
佰傲谷BioValley精选AI 评分5858 Eleven拆分出Undecimal Bio，完成1800万美元种子轮融资做siRNA肝外递送
Eleven Therapeutics将siRNA递送业务拆分为独立公司Undecimal Bio，后者已完成超额认购的1800万美元种子轮融资，由原创始人Yaniv Erlich出任CEO，主攻siRNA肝外递送配体发现。
推荐理由：从Eleven拆分出的Undecimal以DEL加AI筛选肝外siRNA递送配体，提供了一条区别于直接推管线的上游路径。
BioAICraft精选AI 评分7373 David Baker 团队预印本提出从头设计控制 N-连接糖链组成
David Baker、Neil King 等人在 bioRxiv 发布预印本，提出通过从头蛋白质设计在糖链周围构建结构遮挡、限制加工酶接近，从而控制 N-连接糖链组成。
推荐理由：解读 Baker 团队预印本如何用结构遮挡控制糖型，并给出从约1%到约47%的筛选改进路径。
智药邦精选AI 评分5858 丹纳赫推出AI驱动自主实验室，计划2027年初规模化运营
丹纳赫于2026年10月7日宣布计划推出旗下首个AI驱动自主实验室，用于加速定制抗体及其他分子工具的发现，预计2027年初实现规模化运营。
推荐理由：丹纳赫披露自主实验室的整合方式与产能目标，可作为抗体发现自动化的产业参照。
ACS JCIM (化学信息与建模)精选AI 评分5858 PDI-Spot：结合ESM-DBP与Node2Vec嵌入识别蛋白-DNA复合物能量热点
【全文总结】作者提出PDI-Spot，用ESM-DBP序列嵌入与Node2Vec网络嵌入预测蛋白-DNA界面能量热点，在411个突变、139个复合物上训练，并在与ESPDHot相同的81个突变测试集上取得AUROC 0.809、MCC 0.625，高于ESPDHot报告的MCC 0.516。
推荐理由：该研究用ESM-DBP与Node2Vec嵌入替代手工特征预测蛋白-DNA能量热点，并在与ESPDHot相同的测试集上比较。
bioRxiv · Biochemistry精选AI 评分6060 研究利用AI预测结构指导单域抗体2F3的亲和力成熟
研究从合成单域抗体库中筛选出靶向IL-12 p40亚基的候选2F3，其预测表位与Briakinumab、Ustekinumab相同。作者基于AI预测的IL-12/sdAb复合物结构理性设计11个点突变，其中3个提升结合亲和力，组合后亲和力较原始先导克隆提高8倍。该结果基于预印本摘要报告，亲和力数据来自结合实验而非细胞或临床验证。
推荐理由：研究用AI预测的IL-12/单域抗体复合物结构指导定点突变，为合成库低亲和力结合剂的理性优化提供参照。
AI蛋白质精选AI 评分7878 Baker与Neil King团队从头设计糖蛋白，用氨基酸序列编码N-糖基化位置与组成
华盛顿大学David Baker与Neil King团队开发全原子计算流程，从头设计糖蛋白，使氨基酸序列同时编码N-连接糖链的位置与组成，通过设计三维结构中的空间位阻调控糖链加工。
推荐理由：该预印本把糖链组成纳入从头设计变量，并用细菌黏附与凝集素结合实验检验设计糖蛋白的功能。
LeapFun精选AI 评分6363 12篇论文解码Orbis：AI环肽平台与诺和诺德14亿美元合作
作者梳理12篇论文，拆解Orbis如何用非天然构件大环、ⁿCycle-Forge计算搜索与自动化合成构成环肽发现体系。ⁿCycle-Forge以Boltz共折叠评分为代理目标，对两个靶点做约12万次共折叠评价并合成1472个设计，凝血酶初筛命中35/736，约为历史库的24倍，MDM2命中率约4.6%与历史定向库相近。
推荐理由：文章逐层拆解Orbis大环肽平台的计算与实验证据，并区分技术源流与公司独占资产。