ACS JCIM (化学信息与建模)· Esra Basaran, Attila Gursoy, Ozlem Keskin, Nurcan Tuncbag·· 26 天前精选AI 评分58
PDI-Spot:结合ESM-DBP与Node2Vec嵌入识别蛋白-DNA复合物能量热点
PDI-Spot: A Robust Representation Learning Framework for Identifying Energetic Hotspots in Protein–DNA Complexes
AI 导读
【全文总结】作者提出PDI-Spot,用ESM-DBP序列嵌入与Node2Vec网络嵌入预测蛋白-DNA界面能量热点,在411个突变、139个复合物上训练,并在与ESPDHot相同的81个突变测试集上取得AUROC 0.809、MCC 0.625,高于ESPDHot报告的MCC 0.516。
推荐理由
该研究用ESM-DBP与Node2Vec嵌入替代手工特征预测蛋白-DNA能量热点,并在与ESPDHot相同的测试集上比较。
来源:ACS JCIM (化学信息与建模) · doi.org