AI 制药日报 · 2026 年 11 月 2 日 · 星期一
下一分子
PSICHIC+：从序列预测结合亲和力的生物活性基础模型
研究团队开发了生物活性基础模型 PSICHIC+，基于约8200万条蛋白-配体记录、以分布目标训练，可从蛋白序列与配体 SMILES 在毫秒级预测结合亲和力。在无靶点特异性训练数据的零样本虚拟筛选基准中，其富集效果优于回归和分类方法，并与领先的基于结构的方法表现相当。
蛋白质与大分子设计
浙大/北大团队发布GlycoWeave，蛋白-糖链复合物结构预测精度较AlphaFold 3提升近4倍
浙江大学药学院联合北京大学、深圳先进技术大学团队在预印本发布专为糖链设计的扩散生成框架GlycoWeave，用于蛋白质-糖链复合物三维结构预测。
bioRxiv 预印本：从头设计微型效应因子，体积缩小约90%并提升 CRISPRa 效率
2026年10月发表于 bioRxiv 的研究提出用 AlphaFold3 映射转录激活结构域与共激活因子的相互作用界面，再经 RFdiffusion 与 ProteinMPNN 从头设计结合蛋白，构建约4万种设计的候选文库。
小分子与计算化学
ACS JCIM (化学信息与建模)一手BitBIRCH 实现活性悬崖的高效识别与规避
【摘要级】研究提出基于 BitBIRCH 聚类算法的双路径方法，既可在结构-活性景观中快速定位活性悬崖，也可规避活性悬崖并找出化学空间中活性变化最平滑的区域。作者称该方法适合分析超大规模化合物库，代码已在 https://github.com/mqcomplab/BitBIRCH_AC 公开；摘要未披露具体数据集与性能数字。
AI 虚拟细胞与扰动预测
GENESIS：单细胞扰动预测接近实验重复性
研究提出生成式框架 GENESIS（Generative ENErgy-based Single-cell Intervention Simulator），从定义实验条件的协变量直接预测单细胞响应分布，并以能量分数训练轻量神经网络。
前沿论文与基准
“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛公布7大靶点与完整规则
“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛于11月1日公布7个独立赛道的靶点与完整竞赛规则，报名和序列提交均于11月30日23:59:59截止。7个靶点分别为EGFR、TNF-α、GLP-1R、TfR1、TL1A、TNFR1和IL-7Rα，其中5个赛道设计VHH、2个赛道设计minibinder，GLP-1R赛道要求激动剂活性、EGFR赛道要求测定pH=6.0时的亲和力。