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bioRxiv · Bioinformatics· Lin, B., Lu, D. ·· 9 天前精选AI 评分72

EpiRank:仅用单链几何与理化特征的表位预测器,并提出检索式评测框架

EpiRank: partner-agnostic surface-patch retrieval for epitope prediction of protein binding interfaces

AI 导读

作者构建了不依赖结合伙伴的表位预测器 EpiRank,仅用单链几何与理化特征(170 个特征,不做序列搜索),在 HumanPPI 的 29,246 个预测人类二聚体、12,296 条目标链、418 万残基上训练,并在通过伙伴污染过滤的 3,529 条链上以检索问题评测。

推荐理由

该预印本用检索式评测揭示表位预测指标易被高估的四种具体机制,并提出替代报告口径。

来源:bioRxiv · Bioinformatics · biorxiv.org