浙江大学LynxMind项目获浙江省第十五届“挑战杯”大学生创业计划竞赛金奖
浙江大学课题组本科生沈欣领衔的“LynxMind——中枢神经药物设计领航者”项目在浙江省第十五届“挑战杯”大学生创业计划竞赛中获本科生组生物医药与健康科技赛道金奖。该项目为面向中枢神经系统疾病的新一代药物发现一体化平台，构建专属数据库并整合血脑屏障穿透性预测、分子生成与优化、可解释性分析等功能。
#小分子生成
HouMedAI 评分1818
AI4ProteinAI 评分5555 Pallatom-Ligand：全原子扩散模型设计小分子结合蛋白
上海科技大学王浩晨等人提出 Pallatom-Ligand，一款以小分子结构为条件的端到端扩散全原子模型，用于设计蛋白质-配体复合物。该模型采用 Token 级全注意力、原子级块稀疏注意力和 Token 对三角注意力三种机制，在多个小分子 Binder 蛋白设计任务上的成功率显著优于 RFdiffusionAA 和 RFdiffusion2。
Calico LabsAI 评分4242 Calico 与 Nexo 达成多靶点合作，开发衰老相关疾病小分子疗法
Calico 与 Nexo Therapeutics 宣布开展多靶点合作，针对 Calico 提名的难成药靶点共同发现和开发小分子疗法，Calico 将主导后续开发与商业化。Nexo 的 CODON 引擎结合专有共价化合物库与蛋白质组学，用于早期建立靶点特征并指导药物化学优化。
HouMed精选AI 评分7474 侯廷军团队在ChemRxiv发布LiTENexus量子化学驱动端到端AI药物发现系统
浙江大学侯廷军团队联合澳门理工大学于2026年5月15日在ChemRxiv发布LiTENexus系统，提出量子化学信息注入（QCII）机制，将势能面、电荷分布、偶极矩等规律编码进神经算子，构建端到端虚拟药物发现平台。
推荐理由：侯廷军团队把量子化学信息注入神经算子，在ADMET与分布外化学空间给出可对照的基准结果。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分2020 HotSpot Therapeutics 将在 EULAR 2026 展示小分子 IRF5 抑制剂项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 将于 6 月 3-6 日在伦敦举行的 EULAR 2026 上以海报形式展示其干扰素调节因子 5（IRF5）项目的临床前数据。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7171 Incyte 与 Genesis Molecular AI 扩大合作，120 亿美元级条款训练 GEMS 平台
Incyte 与 Genesis Molecular AI 扩大战略合作，Incyte 将共享自有实验数据用于训练 Genesis 的 GEMS 分子 AI 平台，并新增至少 5 个由 Incyte 选定的合作靶点。
推荐理由：交易条款与数据授权范围披露较完整，可观察大药企自有实验数据进入分子AI训练的具体安排。
AI4Protein精选AI 评分6767 清华与字节团队AnewOmni：跨尺度统一分子生成模型
字节AI制药团队与清华AIR团队开发统一分子生成模型AnewOmni，可设计小分子、多肽和纳米抗体，训练数据超过500万个生物分子复合物。模型支持可编程图提示，可施加化学约束、拓扑约束与几何转向，并生成非天然氨基酸、手性分子、共价结合等非标准化学结构。
推荐理由：介绍统一分子生成模型在KRAS G12D与PCSK9上的跨模态设计结果，可作为多模态药物设计的参照。
Lantern PharmaAI 评分4040 Lantern将predictBBB升级为LQM
$LTRN 将 http://predictBBB.ai 升级为大型定量模型（LQM） ✓ 仅凭单个SMILES即可进行360°分子分析 ✓ 数秒内获得99+项特征 ✓ 网页原生、实时分子智能 ✓ 已集成至 @withzeta.ai 阅读更多：https://bit.ly/4tGcVc7
Eikon Therapeutics 官网资讯AI 评分3838 单分子追踪加速优化：发现强效 RUVBL1/2 抑制剂以评估 MYC 驱动癌症靶向治疗
研究团队通过单分子追踪（SMT）驱动的构效关系优化，发现强效 RUVBL1/2 抑制剂化合物 18。活细胞高通量 RUVBL SMT assay 的效力测定与细胞活力和 MYC 降解强相关，而 ADP-Glo 生化 assay 在其实验条件下动态范围有限、重现性差。化合物 18 在 MYC 依赖性 Burkitt 淋巴瘤异种移植模型中，以显著低于 CB-6644 的剂量显示出更优疗效。
HouMed精选AI 评分7373 LaMGen：基于大语言模型的多靶点3D分子生成框架发表于Nature Communications
浙江大学康玉、侯廷军团队联合澳门理工大学刘焕香团队在Nature Communications发表LaMGen，一个仅输入靶蛋白氨基酸序列即可生成3D活性分子的多靶点药物设计框架。
推荐理由：研究用LLM从蛋白序列直接生成多靶点3D分子，并在分布外靶点对上与DualDiff比较。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分4141 Ignota Labs 入选 AI for Science Datasets RFP 十大获胜者，将构建激酶药物毒性数据集
Ignota Labs 入选 AI for Science Datasets RFP 十大获胜者，其提案是构建数据集以加深对药物毒性根源及缓解方式的理解。该公司与 Arctoris 合作，针对一批存在显著选择性挑战的癌症相关激酶，绘制分子结构微小改动引发行为显著变化、常导致意外副作用的化学边界，并称这是首个此类资源。
Mol.AIAI 评分4040 实测ETH开源算法BIMODAL：91.7%命中率，109次尝试即得100个全新化合物
对ETH Zurich Schneider团队开源框架BIMODAL的实测显示，109次生成尝试得到100个兼具有效性、新颖性与唯一性的分子，成功率91.7%。所用BIMODAL_random_512_aug_5模型经5倍数据增强，基于ChEMBL22中271,914个高活性生物分子训练，采样温度设为0.7。该结果来自生成环节的合规性与去重统计，部分分子仍需进一步确认。
HouMed精选AI 评分7474 侯廷军团队等发布全模态分子设计基座模型ODesign
侯廷军教授课题组、OTeam创始人张昊天领衔，联合临港实验室郑双佳团队、浙江大学谢昌谕团队等发布全模态分子设计基座模型ODesign，在统一框架内支持蛋白质、核酸（RNA/DNA）、小分子与离子的相互作用生成，并可在分子整体、功能基序、提示原子三种粒度下可控设计。
推荐理由：该模型把蛋白、核酸与小分子设计放进同一生成框架，并给出跨模态基准对比，便于判断多模态分子设计的当前进展。
Punit Kumar Jha精选AI 评分6969 SandboxAQ研究用合成数据改进蛋白-配体结合亲和力预测
SandboxAQ在预印本中分析合成结构数据如何增强深度学习蛋白-配体结合亲和力预测，生成约8万次绝对自由能扰动（AFEP）计算并构建SAIR-FEP与SAIR-OOD两个数据集。研究发现基于结构的模型对输入结构质量高度敏感，从Boltz-1x筛选高置信度共折叠复合物可带来可预测的性能提升，而盲目加入低质量结构会使指标饱和。合成与实验数据联合训练在CASF 2016上使RMSE最多降低8%、相关性指标提升9-11%，且仅在使用高质量合成结构时重现神经缩放规律。
推荐理由：研究用约8万次AFEP计算构建合成数据集，比较合成与实验数据联合训练对亲和力预测的影响。
Yang Zhang Lab精选AI 评分7474 Ouroboros分子基础模型：将构象空间与药效团相似性纳入表示学习
【全文节选总结】Yang Zhang Lab 提出分子基础模型 Ouroboros，采用表示、重建与性质预测三个正交模块，表示模块以构象空间药效团相似性（CSPS）和分子指纹相似性预训练，在 126248 个分子上构建约 47 亿条相似性标签。
推荐理由：该工作把构象空间与药效团相似性纳入分子基础模型预训练，并在虚拟筛选与多靶点抑制剂发现中给出湿实验证据。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分2020 HotSpot Therapeutics 将在第15届欧洲狼疮会议上展示 IRF5 小分子抑制剂项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 将于3月4-7日在里斯本第15届欧洲狼疮会议上以壁报形式展示其 IRF5 小分子抑制剂项目的临床前数据。
Nimbus TherapeuticsAI 评分2828 Nimbus Therapeutics将在第21届ECCO大会上公布新型SIK2抑制剂临床前与转化数据
Nimbus Therapeutics将于2月18-21日在斯德哥尔摩第21届ECCO大会上以两张海报公布其新型SIK2抑制剂的临床前与转化数据。该公司称，基于结构的药物设计使其高选择性SIK2抑制剂对SIK1和SIK3的选择性超过300倍，在临床前模型和人源离体模型中显示抑制炎症与促进黏膜愈合的双重机制。该SIK2项目正推进至炎症与自身免疫疾病的首次人体研究。
CellarityAI 评分4343 Cellarity公布2026年战略重点与展望：CLY-124镰状细胞病28天数据预计Q4读出
Cellarity公布2026年战略重点，其先导资产CLY-124为口服珠蛋白开关疗法，正在镰状细胞病开展全球1期概念验证研究，28天数据预计2026年第四季度读出。
Latent LabsAI 评分2020 Latent Labs 谈药物发现分子难题
“药物发现之所以困难，是因为当我们进入临床阶段时，我们仍然没有合适的分子。在 Latent，我们正致力于改变这一点。” AI 可以设计出能结合的分子。但是否具备成药性？这一直是悬而未决的问题。
Nimbus Therapeutics精选AI 评分6565 Nimbus Therapeutics 与礼来达成口服肥胖药物研发合作及许可协议
Nimbus Therapeutics 与礼来签署多年期研究合作及全球独家许可协议，针对肥胖及其他代谢疾病开发新型口服小分子药物，项目处于早期发现阶段。Nimbus 将获得合计 5500 万美元的首付款与近期里程碑付款，并有资格获得总额最高约 13 亿美元的开发、商业和销售里程碑付款及全球净销售额分级销售提成。
推荐理由：这是 Nimbus 与 Lilly 在肥胖口服小分子上的第二次合作，交易结构与前期里程碑金额可作为同类 AI 制药合作的参照。
Nimbus TherapeuticsAI 评分2828 Nimbus Therapeutics宣布NDI-219216治疗MSI-H肿瘤的1/2期临床试验完成剂量递增
Nimbus Therapeutics宣布其非共价WRN抑制剂NDI-219216治疗MSI-H肿瘤的1/2期试验完成A部分剂量递增，比计划提前约九个月。截至最高给药剂量未观察到剂量限制性毒性或严重治疗相关不良事件，未达到最大耐受剂量，药代与药效数据显示多个剂量水平下WRN靶点结合持续超过24小时。试验（NCT06898450）将进入B部分确定推荐剂量，公司称早期临床活性数据将在后续学术会议公布。
Cellarity精选AI 评分5858 Cellarity在2025 ASH年会公布镰状细胞病与骨髓纤维化细胞状态矫正管线临床前数据
Cellarity在2025年美国血液学会（ASH）年会上公布镰状细胞病与骨髓纤维化两条细胞状态矫正管线的临床前数据。镰状细胞病候选药CLY-124为口服DCN1抑制剂，临床前在胎儿血红蛋白蛋白水平与HBG1/2珠蛋白基因比例上优于羟基脲，接近近期基因治疗项目报告的水平，与羟基脲联用显示协同效应且无剂量限制毒性，目前正在健康志愿者和镰状细胞病成人中开展1期剂量递增研究。
推荐理由：公司披露镰状细胞病与骨髓纤维化两条管线的临床前数据，可对照其转录组学加AI的发现路径。
Valo Health 官网资讯精选AI 评分7171 Valo Health 与默克 KGaA 达姆施塔特合作开发帕金森病新疗法
Valo Health 与默克 KGaA 达姆施塔特于 2025 年 11 月 20 日宣布战略合作，用 Valo 的 AI 人类因果生物学平台识别和验证帕金森病及相关疾病的新靶点，并用闭环发现平台快速生成临床前化合物。
推荐理由：合作把 Valo 的人类因果生物学靶点发现与闭环化学平台接入帕金森病研发，可看 AI 平台在神经领域的落地方式。
CHARM Therapeutics精选AI 评分6868 CHARM Therapeutics 将下一代 menin 抑制剂 CHM-029 推进为 AML 开发候选
CHARM Therapeutics 宣布将 AI 发现的下一代 pan-menin 抑制剂 CHM-029 推进为急性髓系白血病（AML）开发候选，计划于 2026 年第二季度启动首次人体试验。
推荐理由：CHARM 公布其 DragonFold 平台发现的 menin 抑制剂进入开发候选，并给出耐药突变与体内药效的临床前依据。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分3333 Ignota Labs：被放弃的药物还能救命吗？
Ignota Labs在ELRIG 2025上介绍其药物“扭转”流程：用AI解析药物失败背后的机制通路，据此确定分子需要改动之处，再通过收购或合作获得药物权益并开发新临床候选物，尽快推回临床。公司称该路径可缩短开发周期、改善安全性，并较传统药物发现减少最高80%的碳排放。其策略聚焦他人放弃的已有苗头候选物，而非从零创造新药。
Numerion Labs精选AI 评分6868 Numerion Labs 与 NVIDIA 发布 APEX 协议，30 秒内筛选百亿虚拟化合物
Numerion Labs（原 Atomwise）与 NVIDIA 专家合作在 arXiv 发布论文，提出 APEX（近似但穷举搜索）计算协议，可在单块 NVIDIA GPU 上于 30 秒内从 100 亿化合物的组合合成库中检索出评分最高的 100 万个候选分子。
推荐理由：该协议把十亿级组合库的穷举式筛选压缩到秒级，为超大化学空间检索提供了可复用的方法与基准。
美中药源AI 评分3838 下一代疗法竞速：从CAR-T攻坚到AI智造，中国创新药开启全球新航程｜BIO-FORUM 2025
2025上海国际生物技术与医药研讨会分论坛上，学界、产业与资本围绕细胞治疗、AI制药、大分子药物展开讨论。英矽智能称其AI驱动IPF项目仅用18个月、260万美元确定临床候选化合物，德睿智药称AI知识图谱将口服小分子GLP-1研发周期压缩至四年半并推进至III期临床门槛。圆桌环节认为中国创新药出海已从技术授权升级为共同开发模式。
CellarityAI 评分4040 Cellarity 宣布在第67届美国血液学会年会上进行两场口头报告
Cellarity 宣布其镰状细胞病项目 CLY-124 与骨髓纤维化项目共两项口头报告入选第67届美国血液学会（ASH）年会。CLY-124 是处于1期临床评估的 first-in-class DCN1 抑制剂，报告聚焦其部分抑制 CUL3 neddylation 并诱导胎儿血红蛋白；另一报告展示利用单细胞 RNA 测序图谱与深度学习框架筛选选择性靶向 JAK2V617F 的小分子。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分3232 Ignota Labs 的 Layla Hosseini-Gerami 在 Gordon Research Conferences 研讨会分享小分子药物毒理学 AI 应用最佳实践
Ignota Labs 的 Layla Hosseini-Gerami 在 Gordon Research Conferences 研讨会介绍了小分子药物毒理学中应用 AI 的最佳实践，涵盖如何选择合适训练数据集、复杂模型与简单模型的取舍，以及结合预期用途正确评估模型。
药渡CyberAI 评分3333 药渡Cyber解析一种具有强大体内抗MASH活性的高效选择性肝脏靶向HSD17B13抑制剂的发现
广东药科大学研究团队经多参数优化发现强效选择性HSD17B13抑制剂化合物32（IC50=2.5 nM），其肝微粒体稳定性和药代动力学特征优于BI-3231并具肝脏靶向性。
药渡CyberAI 评分3333 药渡Cyber解析新型高选择性IIb型c-Met激酶抑制剂KIN-8741的发现
研究以优化亲脂效率为目标，通过基于结构的药物设计发现高选择性IIb型c-Met抑制剂KIN-8741，对D1228X、Y1230X等获得性耐药突变及L1195X/F1200X后口袋突变具广谱抑制活性。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3131 HotSpot Therapeutics 在 ESMO 胃肠道肿瘤大会 2025 公布 CBM 信号体小分子抑制剂临床前数据
HotSpot Therapeutics 在 ESMO 胃肠道肿瘤大会 2025 公布其 CBM 信号体小分子抑制剂的临床前数据，该抑制剂在多个 KRAS 驱动肿瘤模型中显示剂量依赖性抑瘤与消退。
药渡CyberAI 评分3636 药渡Cyber解析口服选择性PLK4抑制剂RP-1664的发现
Repare Therapeutics研究团队通过基于结构的药物设计优化，从Centrinone B出发获得口服选择性PLK4抑制剂RP-1664，在临床前展现优异效力、激酶组选择性及药代动力学特征。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分2222 HotSpot Therapeutics 将在2025年ESMO胃肠道肿瘤大会展示CBM信号体抑制剂项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 将于7月2-5日在西班牙巴塞罗那举行的ESMO胃肠道肿瘤大会上，以两张海报展示其CBM（CARD11-BCL10-MALT1）信号体抑制剂项目的临床前数据。海报分别报告CBM信号体抑制对KRAS突变结直肠癌的合成致死作用，以及新型CBM信号体抑制剂揭示该信号体对KRAS突变结直肠癌的必要性。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3434 HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布IRF5小分子项目临床前数据
HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布其Smart Allostery平台发现的强效选择性口服小分子IRF5抑制剂临床前数据，该类抑制剂在两种小鼠关节炎模型中实现IRF5磷酸化与核转位的完全剂量依赖性抑制，并降低干扰素响应基因、抗原特异性抗体和关节肿胀。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分2020 HotSpot Therapeutics 将在 FOCIS 2025 报告 IRF5 小分子项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 将在 FOCIS 2025 以口头报告和壁报形式公布其 IRF5 项目的临床前数据，报告题为“靶向 IRF5：选择性小分子抑制剂的发现与临床前开发”。该报告属于迟发摘要环节，定于 6 月 25 日下午在波士顿举行。IRF5 项目基于公司 Smart Allostery 平台，针对蛋白质上的“天然热点”开发口服小分子变构疗法。
Juvenescence.AI 官网资讯精选AI 评分5858 Juvenescence收购AI药物发现公司Ro5，强化AI管线并推进与M42合作
Juvenescence于2025年6月5日宣布收购AI药物发现公司Ro5，以增强其AI/机器学习药物发现能力，并作为与阿布扎比M42战略合作的核心部分。Ro5的平台基于含超8500万个节点、约4亿条关系的专有生物医学知识图谱，用于发现生物学关联和评估靶点，其AI化学平台覆盖从命中识别到先导优化的化合物发现与设计。
推荐理由：收购把Ro5的知识图谱与化学平台并入Juvenescence，可观察AI能力如何嵌入衰老相关疾病管线。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分2222 Ignota Labs 谈生物科技公司如何用 AI 挽救失败药物
Ignota Labs 首席科学官 Jordan Lane 向 Labiotech 表示，公司认为化学信息学与生物信息学的交叉才能为出问题的药物提供真正洞见。基于对安全性问题可解决的判断，Ignota 会引进该项目、开发化学结构并尽快将药物推向或重新推回临床。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分5151 Ignota Labs 完成 690 万美元种子轮融资，用于挽救失败药物
Ignota Labs 于 2025 年 2 月 26 日宣布完成 690 万美元（550 万英镑）种子轮融资，由 Montage Ventures 和 AIX Ventures 共同领投，Modi Ventures、Blue Wire Capital 和 Gaingels 参投。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3131 HotSpot Therapeutics 在第36届EORTC-NCI-AACR研讨会公布 MALT1 CBM 信号体胶降解项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 在第36届EORTC-NCI-AACR研讨会以壁报形式公布其 MALT1 CBM 信号体胶项目 HST-1021 的临床前数据。