Atom14 与 Atom37:蛋白质设计模型如何记录原子
文章解释 Atom14 与 Atom37 两种将蛋白质原子坐标压入固定张量的布局,并比较 RFdiffusion3、BoltzGen 和 La-Proteina 在序列未知的从头设计中如何处理原子槽位。RFdiffusion3 为每个残基保留 14 个点,用虚拟原子填充未用槽位并统一去噪,序列随后由 ProteinMPNN 或 LigandMPNN 设计。
文章解释 Atom14 与 Atom37 两种将蛋白质原子坐标压入固定张量的布局,并比较 RFdiffusion3、BoltzGen 和 La-Proteina 在序列未知的从头设计中如何处理原子槽位。RFdiffusion3 为每个残基保留 14 个点,用虚拟原子填充未用槽位并统一去噪,序列随后由 ProteinMPNN 或 LigandMPNN 设计。
AI加速发现;瓶颈转向临床开发,以及每一次管线决策如何为下一轮提供借鉴。Michael Lingzhi Li 在 #ARDD2026 谈 Rentosertib。照片:https://agingpharma.org/photos2026
美国 AI 制药公司 Formation Bio 于10月28日宣布推出规模6亿美元的药物开发加速基金,专门收购有潜力的候选药物,再借助自家 AI 平台和开发团队推进临床。
推荐理由:Formation Bio 以项目为单位收购临床期候选药,为平台型与 AI 药企提供管线出口,呈现 AI 制药下游开发的新组织方式。
瞪羚社文章认为,Anthropic与OpenAI相继收购药物开发相关公司并披露Claude药物发现合作成果,正把AI制药推向商业化兑现节点。文章援引金斯瑞在高盛非交易路演中的信息称,其AIDD客户已超100家,1H26收入约4000万美元、同比增长105%,2H26指引升至逾1亿美元,并计划到2027年底实现超10倍产能扩张。
OpenAI 公布内部模型证明任意维度挂谷猜想、证伪指数时间假说并给出四维量子色动力学严格存在性证明,成果交由领域专家牵头核查且不申请学术署名。
文章对比Terray与Jura Bio两条自产数据路线:Terray用自研高通量硬件累计超过4200亿次测量、折算逾170亿个靶标-分子互作数据点,Jura Bio则用变分合成一次造出10¹⁶个抗体序列。作者认为两者分别拆解干湿循环的合成端与筛选端,Terray已签吉利德、BMS、Odyssey合作并预计2026年有内部药物进入临床试验,但数据规模本身不等于成药。
推荐理由:文章把Terray与Jura Bio两种自产数据路线放在干湿循环两端对照,便于理解数据瓶颈的不同解法。
准备活到150岁,我在@FoxNews @SatAmericaFNC上对Brian Yennis说。我们的IPF药物rentosertib在一项为期12周、71名患者的2a期试验中,在衰老时钟生物标志物上显示出3-6年的衰老逆转。早期数据,3期正在进行中,尚未获批。英矽智能,AI设计。#ARDD2026
很高兴看到这个。尤其对“一人生物科技公司”感到兴奋。拥有可供智能体使用的API的CRO,比如@ginkgo的Datapoints服务,再加上类似“生物科技版cursor”的东西,真的可能改变创办生物科技初创公司的成本。
你可以从头设计出能结合全反式视黄醛、并响应光照发生构象变化的蛋白质! @befcorreia
Anthropic 官宣收购 2024 年 12 月成立、全职员工仅一人的生物科技公司 Mithril Medicine,交易实际于今年 7 月完成,金额未披露。
Anthropic 于 2026 年 10 月 27 日集中公布六家机构使用 Claude 推进药物研发的早期案例,并宣布收购罕见病公司 Mithril Medicine。
推荐理由:梳理六家机构用 Claude 做药物研发的早期案例,逐项标出体外数据、对照缺失与验证边界。
Anthropic于10月27日发布Claude用于药物研发的阶段性进展,联合百时美施贵宝(BMS)、Generate Biomedicines、BigHat Biosciences、Enveda等6家机构,覆盖抗体设计、CAR-T工程、先导优化、CMC与临床开发。
推荐理由:Anthropic联合6家机构披露Claude在抗体设计、CAR-T工程与CMC等环节的阶段性结果,并已收购药物研发项目。
英矽智能创始人兼CEO Alex Zhavoronkov在Fast Company“影响力委员会”专栏撰文称,AI有潜力倍增人类寿命,但这只是愿景而非近期可验证的科学预测。
Anthropic 公布 Claude 参与的六个药物研发合作与一个自有项目,并宣布收购由一人运营的 Mithril Medicine。
推荐理由:按证据强度分层梳理 Anthropic 七项药物研发动作,并指出分子设计项目缺少对照基线这一关键缺口。
Thrive Capital、ARCH Venture Partners、Foresite Capital 和 Dimension Capital 被评为当前 AI 药物发现领域顶级投资者。
分子之心创始人许锦波开发的RaptorX-Contact在2016年CASP12蛋白质结构预测比赛中夺得第一,首次将深度残差卷积神经网络用于预测氨基酸残基间相互作用。他于2022年创立分子之心,推出AI大分子优化与设计平台MoleculeOS,并于2026年6月发布AI生物药从头设计平台MMDesign。公司称已完成逾亿美元A轮系列融资。
Anthropic于10月26日向美国SEC公开递交S-1注册文件,拟在纳斯达克上市,股票代码ANT,招股书把生物学和医学列为AI最有望改善人类生活的四大方向之首。
推荐理由:梳理Anthropic招股书中的生命科学布局,并区分客户覆盖与AI制药收入、早期发现与药物候选。
英矽智能称其现有40余个项目,其中35个已过PCC/DC,并含新机制药物,强调项目质量与数据室深度才是关键。公司正与Grok Bot、xPharma.ai合作开发项目级端到端推理与数据室工具,并认为前沿实验室将大规模收购有产出的生物技术公司。
作者拆解 RFD4-Proteina,指出该模型用一套 32 维隐变量把蛋白、核酸、磷酸化等六种语境纳入设计,使偶联位点和糖基化从设计第一步就被考虑。以 HER2 纳米抗体为例,模型可直接以靶点结构为背景、指定热点生成结合骨架,并预留非天然氨基酸位点供后续偶联。作者提到官方湿实验数据显示亲和力达皮摩尔级,但强调这些数字来自开发方、尚无独立复现,且测试基于蛋白-蛋白基准,用于纳米抗体仍需重新测试。
推荐理由:作者拆解 RFD4-Proteina 的多语境隐变量设计思路,并指出其湿实验数据尚未独立复现。
作者逐行核对 Mol-1 发布宣传中的四项数字,发现 FoldBench-AB 75.0%、VHH 命中率 63%、SPR 亲和力 KD 43 pM 及单张 H20 跑 60k token 在公开仓库 molence/Mol-1 中均无对应数据,IsoDDE 75.58% 的对比出处标注为 Coming soon。
推荐理由:作者逐条核对 Mol-1 宣传数字与开源仓库,指出基准对比和湿实验数据均无法在代码中复现。
前OpenAI首席产品官兼科学副总裁Kevin Weil联合创办的Warp Sciences结束隐身状态,宣布完成2.15亿美元融资,由Lightspeed领投,Premji Invest、Mayfield、IVP、Lux等参投。
推荐理由:融资事件之外,文章把按交付计费的本土化学CRO模式与离岸外包放在同一成本维度上比较。
剂泰科技10月19日宣布与礼来达成战略合作,用其AiLNP可离子化脂质发现与优化平台研究组织特异性递送的新型脂质纳米颗粒方案,礼来提供药物发现、开发和商业化专长。
OpenAI于2026年10月20日宣布收购Orchestra Bio,并将其团队与技术并入生命科学工具品牌Rosalind。Orchestra Bio的能力是让科学家与AI智能体协作监测和跟踪药物开发项目,识别生产批次失败等事件影响的工作与时间线,而非靶点发现或分子生成。此次交易未披露收购金额、支付方式、客户名单与整合上线时间,公告中的场景属功能描述,没有对照数据。
推荐理由:收购把竞争焦点从科研推理推向药物项目协调与执行层,但金额、客户与成效均未披露。
投资者愿意支持那些明确聚焦应用场景、拥有高保真人类数据、并具备降低资产风险的清晰路径的虚拟细胞项目。Manish Sharma 在 #ARDD2026 上发言。照片:https://agingpharma.org/photos2026
Anthropic 于 2026 年 10 月 27 日披露收购 Cody Tranbarger 创办的一人公司 Mithril Medicine,技术报告注明交易实际发生在 7 月。
推荐理由:报道拆解了这次收购背后的顾问与CRO网络,并逐项列出小鼠肌力数据的统计与时间混杂缺口。
Molence 于 2026 年 10 月公开 Mol-1 技术报告与模型,作者以 Protenix 2025 年 1 月开放训练流程到 Mol-1 亮相约 21 个月的时间差为线索,讨论前字节系团队创业的技术先发能否转化为公司优势。
同一新闻,精选展示《Molence 发布开源生物分子智能模型 Mol-1》
我真的很惊讶,最新的编程智能体竟然都无法重新实现所有这些模型……也许我们写论文的方式里缺了点什么。
BioAge首席商务官Peng Leong在温哥华CTGN第三届年会上介绍公司如何将纵向人类衰老队列转化为药物候选:平台从数十年连续留存的样本、健康记录和功能测量中识别与功能衰退、疾病风险和生存相关的分子变化,再针对这些通路开发药物。两个项目分别为处于两项2期试验的口服NLRP3抑制剂BGE-102,以及处于IND申报准备阶段的APJ激动剂运动模拟项目。
Anthropic 于 2026 年 10 月 26 日向 SEC 递交 S-1 招股书,拟登陆纳斯达克,股票代码 ANT,首次完整披露其 AI 制药布局。
推荐理由:梳理招股书披露的 AI 制药四条布局线,并对照其中缺失的科研产出与收入数据。
虚拟细胞世界模型一旦点明哪些生物学问题变得可检验,就具备了可合作性。Le Song(@dasongle)在 #ARDD2026 上发言。照片:https://agingpharma.org/photos2026
百图生科联合创始人兼CEO刘维预计,AI制药行业真正迎来破局点还需3–5年,并将发展划分为工具效率提升、管线赋能与研发组织变革三个阶段。他称百图生科已用虚拟细胞与干湿实验闭环平台推进20多个First-in-Class靶点发现项目,均完成早期验证,部分进入临床前研究。公司坚持基础设施定位,通过系统许可、AI模型及Agent工具赋能药企。
Basecamp Research于2026年9月23日宣布完成1.4亿美元C轮融资,由S32领投,Anthropic旗下Anthology Fund、英伟达和Menlo Ventures跟投,投后估值约8亿美元。
推荐理由:文章梳理Basecamp Research自采生物数据与EDEN模型的路径,并解释其1.4亿美元C轮融资背后的数据壁垒叙事。
当预测目标足够具体、可供尽职调查时,健康与死亡世界模型就变得可合作了。Kejun Ying(@KejunYing)在 #ARDD2026 上。照片:https://agingpharma.org/photos2026
大型制药公司正在购买超级计算机。成果在哪里? 我们将在本周的新闻通讯汇总中探讨这一问题(链接见个人简介)
途深智合创始人兼CEO王宇光在第12届BiG IMPACT年会上参与“AI前沿创新者×一线投资机构深度对话”圆桌交流,与AI领域创新者及投资机构代表探讨行业发展议题。该年会10月24日在上海张江收官,设主论坛、四大分论坛及三场闭门会,聚焦难成药靶点突破、AI虚实之辩、CNS与自免研发及BD/NewCo出海等议题。
哈佛大学化学荣休教授、DoveTree Medicines 创始人 Gregory Verdine 近日到访晶泰科技上海职场,围绕 AI+机器人技术在创新药研发中的应用、难成药靶点攻关策略及双方战略合作下一步规划展开交流。
Anthropic 于周一向美国 SEC 递交 S-1 注册声明,计划在纳斯达克全球精选市场以代码 ANT 上市,并披露将加码生命科学领域的知识、人才、合作与收购。
推荐理由:Anthropic 的 IPO 文件披露了生命科学扩张计划与财务数据,为观察通用大模型公司进入药研提供参照。
HUPO 2026 大会在新加坡汇聚 45 国 1,428 名代表,主题为“Proteomics Plus: Transforming Lives”。中国发起的 π-HuB 计划提出在三十年内投入数十亿元人民币,目标预测个体一生的蛋白质组状态;西湖大学郭天南则报告了覆盖 58 种主要组织类型、251 种细分组织类型和 25 种癌型的空间蛋白质组工作,以及针对三阴性乳腺癌的扰动蛋白质组虚拟细胞模型。
Morgan Levine 在《Biology Beyond Human Intuition》中提出,细胞类型标签、实验条件和论文叙述构成的选择性观测,会成为语言模型学习生命的边界。
药明康德在2026年第三季度报告中首次将AIDD/AI4S写入测试与生物学业务披露,前三季度营收455.37亿元、同比增长38.59%,持续经营业务在手订单767.4亿元、同比增长36.4%。测试业务称正加快HI+AI一体化和自动化能力建设,以满足全球AIDD/AI4S客户的干湿闭环研发需求;生物学业务则面向这类客户提供高通量、多样化、定制化的一体化湿实验室服务。