AI 如何改变抗体优化的第一轮：Cradle 七个多样化campaign的实测
Cradle 在七个抗体多样化campaign中，用基于进化序列数据训练的模型生成每个携带2-8个突变的多突变变体库，设计变体的结合保留率为56%-92%，其中四个campaign在未针对亲和力优化的情况下出现2倍至350倍亲和力提升。
推荐理由：Cradle 用七个抗体多样化campaign的实测数据，对比单点扫描与多突变首轮的取舍，给出首轮实验设计的具体参照。
#功能验证
Cradle Bio Blog精选AI 评分6767
Nabla Bio精选AI 评分7474 Nabla Bio 发布 JAM-2 报告：零样本设计多特异性抗体与 KRAS G12 双变异结合剂
Nabla Bio 发布 JAM-2 模型报告，将零样本药物设计从结合扩展到多功能药物与胞内蛋白质组。报告称其全计算设计出针对五种肽-MHC 的多特异性抗体，T 细胞激活/杀伤 EC50 达皮摩尔级、选择性超过 100 倍；并生成靶向 KRAS G12V 与 G12C 的双变异多特异性抗体，在皮摩尔至个位数纳摩尔效力下杀伤呈递细胞且不伤野生型。
推荐理由：Nabla Bio 公开 JAM-2 在五类肽-MHC 与 KRAS G12 双变异多特异性抗体上的设计与湿实验验证细节，可作为评估零样本抗体设计的参照。
Cradle Bio Blog精选AI 评分6767 Cradle 展示零样本抗体多样化：七组实验与单突变扫描基线对比
Cradle 汇总其零样本抗体多样化流程在 SARS-CoV-2 RBD、HER2 和 EGFR 上的七组实验，其中 4/7 实验、2/3 靶点出现显著亲和力提升，弱结合剂 Ty2 的 KD 改善达 350 倍。
推荐理由：Cradle 汇总七组零样本抗体多样化实验，给出功能率与亲和力提升幅度，并对照文献单突变扫描基线。
insitro · Publications & Press精选AI 评分5858 insitro 在 ADA 公布 AI 发现 MASH 候选 CTRO-1013 临床前数据：抗纤维化信号部分独立于肝脏脂肪下降
insitro 在第 86 届 ADA 科学年会上公布其 AI 发现的 MASH 候选 CTRO-1013（肝靶向 IRS1 siRNA）的临床前数据，显示在标准纤维化小鼠模型中肝靶向沉默 IRS1 使 TIMP-1 降低 37%、CK-18 降低 68%（16 周，1 mg/kg，每 4 周一次），且抗纤维化信号部分独立于肝脏脂肪下降。
推荐理由：该材料披露 IRS1 靶点从人类遗传学发现到 siRNA 候选物的临床前数据链，可观察 AI 表型与遗传证据如何衔接管线推进。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3838 HotSpot Therapeutics 在 EULAR 2026 展示小分子 IRF5 抑制剂项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 在 EULAR 2026 以壁报展示其小分子 IRF5 抑制剂项目的临床前数据，该抑制剂经 Smart Allostery™ 平台发现，可剂量依赖地抑制多种人免疫细胞的细胞因子产生。
Inceptive精选AI 评分7474 Inceptive 用零样本 mRNA 序列设计对标体内 CAR-T 行业基准
Inceptive 称其基础模型在不足一个月、极少 CAR-T 专用训练数据下零样本设计 mRNA 序列，在 PBMC 表达与杀伤实验中与行业领先的抗 CD19 CAR 序列相当，并结合 Mana.bio 的被动靶向 LNP 在体内实现接近完全的 B 细胞清除。
推荐理由：Inceptive 称零样本设计的 mRNA 序列在体外与体内 CAR-T 指标上对标行业基准，展示了基础模型跨靶点迁移的一种路径。
MindWalk / ImmunoPrecise Antibodies精选AI 评分5858 MindWalk 公布登革热临床前数据，支持 HYFT 计算预测
MindWalk 公布登革热临床前数据，称基于 HYFT 预测靶点设计的免疫原在动物中诱导出针对全部四种登革热血清型抗原的交叉反应抗体，并在两次独立实验中重复。公司称 HYFT 在免疫前计算优先选出泛血清型靶点，打乱序列的对照未产生相应识别，CEO Jennifer Bath 称这是该疫苗平台上首次记录到从预测到结果的闭环。该结果属临床前结合层面证据，完整数据见公司新闻稿。
推荐理由：公司披露登革热免疫原在动物中诱导四血清型交叉反应抗体，并给出两次独立实验的对照结果。
FutureHouse精选AI 评分7474 FutureHouse在Nature发表Robin多智能体系统，用于干性年龄相关性黄斑变性药物重定位
FutureHouse在Nature发表其首篇论文，介绍多智能体系统Robin，该系统将新假设生成与实验数据分析整合进同一连续工作流。研究团队将Robin用于干性年龄相关性黄斑变性，由其提出药物重定位假设并在实验室验证，包括在原代人视网膜色素上皮（RPE）干细胞中验证。
推荐理由：该工作展示多智能体系统从假设生成到湿实验验证的完整链路，为AI驱动发现提供可参照案例。
Medra 官网资讯精选AI 评分5858 Medra 发布自主实验室 Medra Lab 001，称覆盖设计-制造-测试-分析全流程
Medra 宣布建成 Medra Lab 001（ML001），称其为美国最大的自主实验室，面积 38,000 平方英尺、部署数百台机器人并 24/7 运行，在 90 天内建成。
推荐理由：Medra 公布其自主实验室的规模与在产合作范围，为观察物理 AI 科学家的落地形态提供参照。
Eikon Therapeutics 官网资讯AI 评分3838 单分子追踪加速优化：发现强效 RUVBL1/2 抑制剂以评估 MYC 驱动癌症靶向治疗
研究团队通过单分子追踪（SMT）驱动的构效关系优化，发现强效 RUVBL1/2 抑制剂化合物 18。活细胞高通量 RUVBL SMT assay 的效力测定与细胞活力和 MYC 降解强相关，而 ADP-Glo 生化 assay 在其实验条件下动态范围有限、重现性差。化合物 18 在 MYC 依赖性 Burkitt 淋巴瘤异种移植模型中，以显著低于 CB-6644 的剂量显示出更优疗效。
A-Alpha Bio 官网资讯精选AI 评分5858 Tamarind Bio与A-Alpha Bio合作，将AlphaSeq接入AI抗体设计平台
Tamarind Bio与A-Alpha Bio宣布合作，Tamarind Bio用户可将用RFdiffusion、ProteinMPNN等蛋白设计模型生成的抗体序列直接提交至A-Alpha Bio的AlphaSeq平台，获得抗体-靶点对的定量结合亲和力数据。
推荐理由：合作把计算设计的抗体序列接入高通量亲和力测量，为评估AI设计到实验验证的衔接提供参考。
LabGenius Therapeutics · NewsAI 评分5050 LabGenius Therapeutics 将在 AACR 2026 展示 LGTX-101 临床前数据
LabGenius Therapeutics 宣布将在 AACR 2026 展示其选择性增强的 Nectin-4 x CD3 T 细胞衔接器 LGTX-101 的临床前数据。
Cradle Bio BlogAI 评分4242 Cradle Bio 用桑基图可视化多属性蛋白质优化中的权衡
Cradle Bio 将桑基图用作多属性蛋白质生成项目的核心可视化，展示序列在活性、表达、稳定性、安全性和可开发性等约束下的通过或失败流向，以定位设计瓶颈。这些结果均为预测，序列尚未合成或经湿实验验证。两个虚构示例中，将次要安全性约束放宽约10%后序列流量打开；在抗体案例中放宽次要疏水性约束后，主要活性从起始模板的1.5倍提升至2.7倍。
LabGenius Therapeutics · News精选AI 评分5858 LabGenius 发表 3in1 噬菌体展示筛选法，一天完成全部筛选轮次
【摘要级】LabGenius 提出 3in1 噬菌体展示生物淘选方法，采用非变性洗脱并跳过中间噬菌体扩增步骤，在一天内完成全部淘选轮次。作者称该方法比传统淘选快五倍，获得的独特命中化合物最多多六倍且亲和力范围较广，并将先导化合物发现时间缩短一周、减少耗材与废弃物。该方法在针对多种靶点的天然合成库和免疫库中展示适用性，材料仅为论文摘要。
推荐理由：该方法把多轮噬菌体展示筛选压缩到一天，并报告了命中多样性与亲和力范围的对照结果。
Latent LabsAI 评分5050 Latent Labs与GenScript验证Latent-X2
很高兴看到@GenScript团队的这项工作。 在验证Latent-X2时，我们需要快速推进抗体、纳米抗体和大环化合物的相关工作。我们的内部湿实验室能承担很多工作，但GenScript帮助我们扩大了规模，并更快地打通了计算与生物学之间的闭环。 结果是：AI设计的抗体具有类药可开发性，并在人源panel中显示低免疫原性，且已在实验室中得到验证。 感谢那些以尖端AI速度推进的合作伙伴。
Baker Lab · IPD (蛋白质设计研究所)AI 评分3838 靶向SARS病毒家族的GBP511疫苗进入人体试验
由UW Medicine团队研发、SK bioscience推进的GBP511疫苗已在澳大利亚启动临床，用于预防COVID-19及多种尚未跨种传播的沙贝病毒。该疫苗以计算机设计的纳米颗粒为核，表面展示4个来自不同冠状病毒的受体结合域，临床前研究中可保护动物抵御未直接免疫的相关病毒。
Nabla Bio精选AI 评分5858 Nabla Bio 称其为武田设计的分子获武田总裁在 JPM 公开评价
Nabla Bio 表示，其为武田设计的一个原本面临终止、无推进路径的项目交付了多个候选分子并奏效，武田总裁 Andy Plump 在 JPM 上以“浴火凤凰”形容该分子。Plump 称传统方法无法自行得到这一分子，但双方未披露适应证、分子数量细节与实验数据。Nabla Bio 还称其 JAM-2 平台与整合湿实验室已在业界数十个项目中运行，武田正将 AI 整合进其发现流程。
推荐理由：Nabla Bio 披露其为武田设计的分子被武田高管在 JPM 上公开评价，可作为 AI 设计分子进入大药企管线的合作案例参照。
Latent Labs精选AI 评分5858 Latent Labs 发布 Latent-X2：AI 生成抗体具备类药可开发性与低免疫原性
Latent Labs 在 Latent-X1 发布 5 个月后推出 Latent-X2，称其 AI 生成抗体在人体样本中表现出类药可开发性和低免疫原性，且为零样本生成。该模型目前面向部分合作伙伴开放使用，公司未披露具体实验数据与评测细节。
推荐理由：Latent Labs 公布从 Latent-X1 到 Latent-X2 的迭代，并给出 AI 生成抗体在可开发性与免疫原性上的自述结果。
LabGenius Therapeutics · News精选AI 评分8282 LabGenius 发表 EVA 平台闭环优化 HER2×CD3 多特异性抗体研究
【全文总结】LabGenius 在论文中报告其 EVA 平台通过机器学习与高通量实验闭环，在 44,160 个 HER2×CD3 T 细胞衔接器设计空间中经 5 轮设计-构建-测试-学习循环筛选 980 个候选，命中率较 Sobol 准随机基线提升 14 倍。
推荐理由：该研究把多特异性抗体的价数、拓扑与亲和力纳入贝叶斯优化闭环，并以临床基准分子作对照，展示了亲合力门控选择性的可设计路径。
Baker Lab · IPD (蛋白质设计研究所)精选AI 评分8888 Baker Lab 发布 RFdiffusion2：以提示直接生成高效酶
Baker Lab 报告开发 RFdiffusion2，可直接以活性位点原子排布为输入生成酶，无需实验室优化即具备催化活性。在 Nature Methods 研究的计算基准中，该模型解决 41 项酶设计挑战中的 41 项，此前最佳工具为 16 项。
推荐理由：RFdiffusion2 以活性位点结构为输入直接生成酶，并在计算基准中解决全部 41 项设计挑战，为酶设计提供了新的可复用工具。
Nabla Bio精选AI 评分6565 Nabla Bio 发布 JAM-2 抗体设计模型，称可从计算机直接生成成药级抗体
Nabla Bio 发布 JAM-2，称其为首个能从计算机直接生成成药级抗体的 AI 模型。公司称在 26 个靶点中有一半在每靶点测试少于 45 个设计的情况下获得皮摩尔至个位数纳摩尔级结合剂，直接针对细胞表面 GPCR 的结合剂成功率最高达 11%，超过 50% 的设计在零优化下通过核心行业可开发性标准，并称已与多家大型药企合作部署 JAM-2。上述结果来自公司自述与白皮书，尚未见独立验证。
推荐理由：Nabla Bio 公布 JAM-2 在 26 个靶点上的抗体设计成功率与可开发性数据，可供对照评估从头抗体设计的能力边界。
Baker Lab · IPD (蛋白质设计研究所)精选AI 评分8686 Baker Lab在Nature发表RFantibody：用RFdiffusion从头设计全长抗体
Baker Lab团队在Nature发表研究，用基于RFdiffusion训练的RFantibody模型在计算机上从头设计含重链和轻链的完整抗体可变区，无需动物免疫或大规模筛选。针对艰难梭菌毒素等靶点，设计抗体达到中纳摩尔级结合亲和力，转为全长IgG后保留效力；电镜解析的5个设计抗体中有4个与计算预测结构一致。RFantibody代码已在GitHub开放，供学术、个人和商业使用。
推荐理由：研究展示RFdiffusion设计全长抗体可变区并经电镜验证，为从头抗体设计的可行性提供参照。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3434 HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布IRF5小分子项目临床前数据
HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布其Smart Allostery平台发现的强效选择性口服小分子IRF5抑制剂临床前数据，该类抑制剂在两种小鼠关节炎模型中实现IRF5磷酸化与核转位的完全剂量依赖性抑制，并降低干扰素响应基因、抗原特异性抗体和关节肿胀。
A-Alpha Bio 官网资讯AI 评分2626 A-Alpha Bio 在 PEGS 2025 展示海报：通过平台整合快速工程化双特异性抗体
A-Alpha Bio 在 2025 年 Protein & Antibody Engineering Summit（PEGS）展示海报，主题为通过平台整合快速工程化双特异性抗体。原文仅提供海报展示信息与打开链接，未披露具体方法、实验数据或结果。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3333 HotSpot Therapeutics 在第四届 AACR 恶性淋巴瘤国际会议展示潜在首创 MALT1 支架抑制剂 HST-1021 临床前数据
HotSpot Therapeutics 在第四届 AACR 恶性淋巴瘤国际会议展示 MALT1 支架抑制剂 HST-1021 的临床前数据，该候选化合物在体外强效抑制 NF-kB 与 AP1 活性。与 MALT1 蛋白酶抑制剂不同，HST-1021 未观察到对蛋白酶活性或 T 细胞功能的影响，且未在体内耗竭 Treg 细胞。公司称其抗肿瘤活性比 MALT1 蛋白酶抑制剂更显著、更广。
HotSpot Therapeutics 官网资讯精选AI 评分5858 HotSpot Therapeutics在SITC 2021公布CBL-B变构抑制剂临床前数据
HotSpot Therapeutics宣布其Smart Allostery平台发现的新型CBL-B变构抑制剂在体外和小鼠中促进T细胞应答并增强NK细胞杀伤，数据将在SITC第36届年会以壁报864展示。
推荐理由：该数据展示机器学习平台如何定位蛋白调控口袋并得到口服小分子抑制剂，为不可成药靶点提供一条可参考路径。
A-Alpha Bio 官网资讯精选AI 评分6565 A-Alpha Bio 用 AlphaSeq 大规模表征抗体对 SARS-CoV-2 变异株的亲和力
A-Alpha Bio 发布预印本，用 AlphaSeq 技术对 33 种单克隆抗体与数千个 SARS-CoV-2 变异株进行结合测试，在抗体与 RBD 刺突蛋白变异体之间识别出超过 15 万对蛋白质-蛋白质相互作用。作者指出，许多抗体药物正针对 RBD 刺突开发，意外突变可能使病毒逃逸抗体治疗。
推荐理由：A-Alpha Bio 用 AlphaSeq 大规模筛查 33 种抗体与数千个变异株的结合，为变异逃逸评估提供高通量方法参照。
A-Alpha Bio 官网资讯AI 评分4242 A-Alpha Bio 完成 280 万美元种子轮融资，推出 AlphaSeq 用于药物发现
A-Alpha Bio 完成 280 万美元种子轮融资，由 OS Fund 领投，AME Cloud Ventures、Madrona Venture Group 等参投，用于验证 AlphaSeq 并启动与药企的药物发现合作。
A-Alpha Bio 官网资讯AI 评分4242 A-Alpha Bio 获盖茨基金会资助，开发针对肠道病原体的传染病药物
A-Alpha Bio 获比尔及梅琳达·盖茨基金会资助，开展一项可行性研究，用其专有“多靶点”药物发现平台 AlphaSeq 同时针对多种肠道病原体菌株测试候选药物。