Rowan NMR 工作流新增 J 耦合计算
Rowan 的 NMR 工作流现已可计算并可视化 J 耦合:
Rowan 的 NMR 工作流现已可计算并可视化 J 耦合:
当一个想法变成可用工具、多个团队几乎同时着手攻克它时,真是太酷了。开放 smiles 到 IUPAC 的翻译曾缺失了一段时间,而在两周内 @adrian_mirza_ 和 @NicholasRuncie 各自独立发布了相关工具。 这里的推动者是编码智能体!
感谢 Alexis 到访 Medra 办公室 🦾
MindWalk在旧金山AMD Advancing AI 2026大会上首次公开展示其面向AI药物发现的生物上下文层ReefIQ,运行于AMD Instinct平台。该演示被纳入AMD Instinct Demo Showcase四个定制演示短片之一,并配有通过AMD渠道分发的视频访谈。
b12 Labs 宣布向学术和非营利研究者免费开放其逆合成工具 Selenium,用户可通过 app.b12-labs.com 注册使用。该工具主打策略优先的合成路线规划,官方邀请研究者提交高难度目标分子或 AI 设计结构进行尝试。Andrés M. Bran 转发了这一开放消息并附上注册入口与博客链接。
望石智慧在BIO 2026国际大会期间与医药魔方围绕「中国创新走向世界」展开对话,并展出小分子药物研发技术平台及智能体产品。公司介绍AI 3D分子生成平台MolVado融合大语言模型与几何深度学习、依托电子云密度数据实现3D分子生成,全栈式早研智能体MolVortex可自主拆解任务、调度工具并联动湿实验室形成干湿闭环。
我们今天在Rowan上线了重写的反应建模工具包,恰逢我们在巴塞罗那计算化学GRC上就此做报告。(如果你在现场,去找Jonathon聊聊!) 我们为速度重写了一切,并添加了一堆实用功能(🧵):
许多刚接触基于结构的药物发现的科学家,能直观理解如何以及何时运行对接或共折叠,但不太确定下一步该做什么。 在我们最新的博客文章《What to Do with a Pose》中,我们提供了一份关于后续步骤的快速指南: https://rowansci.com/blog/what-to-do-after-docking
Latent Labs 宣布药物设计智能体 Latent-Y 向全球研究者开放,获批研究者每天可免费获得 250 个设计。公司同时公布早期访问研究者的首批实验室结果,包括阻断离子通道的分子、在体内杀伤肿瘤细胞的 CAR-T 细胞,以及疟原虫难以通过突变逃逸的结合剂。
推荐理由:Latent Labs 开放其药物设计智能体 Latent-Y,并给出早期用户离子通道抑制剂与 CAR-T 的实验室结果。
分子之心开启MoleculeOS先锋伙伴共创体验计划,面向创新药研发、生物制造、合成生物学等领域开放浏览器接入试用。该系统以多模态蛋白质基础大模型NewOrigin(达尔文)与全原子结构预测模型MMFold为底层,可理解研发意图并自动编排结构预测、亲和力评估等任务。公司称典型抗体优化项目从序列分析到候选推荐由传统数天压缩至几分钟计算时间。
A-Alpha Bio 推出名为 Atlas 的网页平台,提供可授权的机器学习就绪蛋白相互作用数据,并支持按需生成新的结合数据。平台由高通量平台 AlphaSeq 产生数据,采用统一实验条件与标准化对照,使不同实验的数据集可合并用于模型训练与基准评测。
推荐理由:该平台把标准化实验产生的结合数据组织成可授权数据集,为抗体设计模型的训练与基准评测提供数据来源。
期待下周在首尔@icmlconf举办的GenBio 2026研讨会。 ➡️ 高级员工ML研究科学家Pranav Murugan将展示聚光灯海报:"Few-step Cofolding with All-Atom Flow Maps",介绍DeCAF——Pearl的蒸馏版本,专为少步推理构建:https://arxiv.org/abs/2606.08375 ➡️ 关于我们自豪地联合赞助的研讨会的更多详情:https://genbio-workshop.github.io/2026/
Genesis Molecular AI 首次披露其智能体药物设计系统 Sapphire,该系统构建于其分子基础模型之上,可全天候自主迭代候选药物,对2D化学结构与3D分子构象进行推理并形成、检验假设。
MindWalk(NASDAQ: HYFT)已就围绕HYFT®模式锚点构建的多维生物表征层提交专利申请,该层为模型无关的上下文层,用于支持ReefIQ™、LensAI™及客户自选AI工作流在药物发现中检索、比较和推理可追溯的关联生物学数据。公司称该架构旨在让模型与智能体工作流保留数据来源并跨项目复用知识,此次申请意在保护HYFT®技术的核心架构。
Valence Labs 发布 AquaGen,称其为首个全原子、显式溶剂、考虑周期性边界条件的生成模型,可从玻尔兹曼分布生成分子构型。该模型用 3D 图神经网络将噪声转为药物分子与水的全原子三维排布,再以力场评估能量、以灰盒方式计算绝对水合自由能,约需数百个样本即可获得相对 MD 参考约 1 kcal/mol 误差的结果,速度约为 MD 的 10 倍。
推荐理由:介绍首个全原子显式溶剂玻尔兹曼采样模型,说明其相对分子动力学的速度与误差权衡。
Inductive Bio 宣布加入 Anthropic 生命科学生态,并发布 Model Context Protocol(MCP)连接器,让 Claude 和 Claude Science 用户可用自然语言对任意化学结构获取 ADMET 性质预测。
推荐理由:Inductive Bio 把其 ADMET 预测模型接入 Claude,为小分子设计中的性质评估提供了一种对话式调用入口。
Terray Therapeutics分享了其生成式合成规划器TerraSynth的工作,针对小分子药物发现中的合成瓶颈。该工具将合成规划纳入设计循环,而非事后处理,以减少生成模型提出难合成分子对DMTA循环的拖慢。TerraSynth已整合进其EMMI平台,帮助聚焦值得合成的分子以推进项目。
NVIDIA 发布 BioNeMo Agent Toolkit,这是一个开放的、面向智能体的工具包,为任意 AI 智能体提供蛋白质结构预测、分子对接、生成式化学和基因组分析等可调用工具。Medra 转发该消息并表示正与 NVIDIA 合作构建由智能体决定下一步运行什么、再由物理 AI 实验室执行的闭环,称期待将其投入使用。
Open Targets Platform 26.06 已上线,基线表达数据新增 Tabula Sapiens 单细胞 RNA 测序与 PRIDE 质谱蛋白组数据,可在组织层级之外浏览细胞类型层级表达。
推荐理由:该版本把单细胞与蛋白组表达数据纳入靶点优先级评分,并公开了临床挖掘与L2G管线的具体改动。
Medra 发布 Physical AI Scientist 平台的科学推理层 AI Experimentalist,可将自然语言科研目标与人工撰写的实验方案转化为可执行、可测量并迭代改进的实验。
推荐理由:该平台把自然语言科研目标转成可执行实验并闭环优化,展示了自动化实验室与推理层结合的具体形态。
Proxima借助NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit,将其AI智能体用于整合基础模型训练、化学、生物学与蛋白质组学,以更快把新生物学转化为治疗假设并推进项目。该工具包由NVIDIA Health在BIO 2026发布,Proxima称其为合作方之一。
NVIDIA 发布 BioNeMo Agent Toolkit,将十余年积累的生命科学库、工具与开放模型封装为智能体可调用的技能,覆盖蛋白结构预测、分子对接、生成式化学、基因组分析、蛋白设计与生物标志物发现。
推荐理由:英伟达把十余年生命科学库与模型封装成智能体可调用工具,并列出多家药企与平台的接入情况。
Medra 发布 AI Experimentalist,作为其 Physical AI Scientist 平台的科学推理层,与湿实验室执行层 Physical AI Lab 组成设计、执行、解读、改进的闭环系统。
推荐理由:Medra 公布 AI Experimentalist 与湿实验室闭环平台,抗体筛选案例给出周期压缩的具体路径。
Cradle 发布 Guided Rounds,把运行机器学习引导蛋白质工程轮次的最佳实践内置到平台,用户输入蛋白类型、是否有实验数据及设计或筛选目标后即可获得默认配置与分步引导。该功能今日面向所有用户上线,覆盖用户最常运行的轮次类型,并可视化数据集、模型训练、设计与审核之间的决策路径以提升可追溯性。需要逐参数控制的科学家仍可自行配置单项任务,计算科学家也可通过 API 扩展自有预测器与评分。
MindWalk 发布 ReefIQ,一个由 HYFT 驱动的生物语境层,位于客户发现数据与 AI 推理工作流之间,用于 AI 药物发现和生物制品开发。该层在 AI 工作流处理前重新连接分散在文件、格式、系统、团队和工作流中的数据,将序列、结构、检测输出、组学、文献、证据、溯源和项目历史转化为可治理、可查询的关联生物语境。
Ginkgo Bioworks旗下Datapoints与Tangible Scientific、Inductive Bio联合推出高通量ADME平台ADME-One,将五项Tier 1 ADME检测、Inductive Bio的AI人体PK预测和化合物管理整合为一项服务。
推荐理由:三家合作方把高通量ADME实验、AI人体PK预测与化合物管理打包成一体化服务,展示AI与湿实验衔接的一种落地形态。
$LTRN 公布 http://withZeta.ai 的下一阶段路线图: → ZetaSwarm™:多智能体科学推理 → ZetaOmics™:实时计算生物学 迈向肿瘤研发的AI联合科学家 了解更多:https://bit.ly/4weTdpt @withzeta
碳硅智慧于2026年4月17日发布DrugFlow 3.0产品矩阵,包括小分子发现引擎DrugFlow、大分子设计平台BioFlow、自由能计算平台Inno-FEP和SciGPT及医药数据库。
推出 Medra Lab 001。数百台机器人,不到 90 天建成。现已开放。
Medra 宣布建成 Medra Lab 001(ML001),称其为美国最大的自主实验室,面积 38,000 平方英尺、部署数百台机器人并 24/7 运行,在 90 天内建成。
推荐理由:Medra 公布其自主实验室的规模与在产合作范围,为观察物理 AI 科学家的落地形态提供参照。
唯信工坊将于2026年4月27日在北京中关村开设AI辅助大分子药物设计课程,基于WeMol平台讲解结构预测、生成式蛋白质设计、虚拟亲和力成熟、免疫原性预测与抗体人源化等内容。课程由唯信计算应用科学团队主讲,培训费1200元/人,2人8折、3人及以上7折。
浙江大学李承熙团队在《Nature Communications》发表CycloPepper,用机器学习预测治疗性环肽的环化结果并优化合成。研究基于全自动环肽合成平台CycloBot构建306个环肽数据集,采用SVC模型结合One-hot编码、氨基酸组成、二肽组成及16维理化特征,交叉验证准确率84%,实验验证一致性86%。
推荐理由:该研究用自动化合成数据训练环化位点预测模型,为环肽合成路线选择提供了可复用的在线工具。
唯信计算(Wecomput)在 NVIDIA GTC 2026 发布生物医药多智能体操作系统 WeMol Copilot,用户可用自然语言描述任务,由系统规划路径并调度底层 AI 模型与计算工具。
推荐理由:唯信计算在 GTC 2026 发布多智能体系统,展示从抗体生成到去免疫原性改造的自动化流程编排。
碳硅智慧宣布将于2026年4月17日线上举办“智能药物研发前沿交流会暨DrugFlow3.0发布会”,届时正式发布以DrugFlow、BioFlow、SciGPT、Inno-FEP为核心的产品矩阵。会议将聚焦AIDD最新学术进展与产业落地路径,设置ADMET模型、全生物分子模态从头设计、知识增强科学工具智能体等主题报告及圆桌讨论。
Cradle与UC Berkeley Keasling实验室合作,将机器学习嵌入酵母生产疫苗佐剂QS-21的酶优化流程。该实验室2024年在Nature报告用38个植物基因使酵母从简单糖类合成QS-21,但产量远低于商业化水平。
推荐理由:案例展示机器学习如何嵌入植物酶优化流程,为替代植物提取的合成生物制造提供可迁移路径。
GenSLM 发布 v0.0.6a1,修复 attention_mask 形状问题并将依赖迁移至 pydantic v2,同时合并开发分支的依赖更新与兼容性修复。该版本还更新了长序列示例图片与 install.sh,并新增 @saforem2 为首位贡献者。
今天我们宣布,与@nvidia和@nebiusai(领先的AI云服务提供商,用于训练和推理)合作部署NVIDIA Blackwell B300 GPU的成果:我们用于药物发现的生成模型实现了超过4倍的训练加速和超过60%的推理提速。
Cradle Bio 将桑基图用作多属性蛋白质生成项目的核心可视化,展示序列在活性、表达、稳定性、安全性和可开发性等约束下的通过或失败流向,以定位设计瓶颈。这些结果均为预测,序列尚未合成或经湿实验验证。两个虚构示例中,将次要安全性约束放宽约10%后序列流量打开;在抗体案例中放宽次要疏水性约束后,主要活性从起始模板的1.5倍提升至2.7倍。
David Mobley 团队发布新预印本,介绍一种用于发现蛋白-配体复合物常见模拟中采样问题的简单分析工具,其做法是统计扭转态之间的跃迁次数。作者称该方法简单但出乎意料地有用,预印本已发布于 ChemRxiv。
推荐理由:作者发布预印本,介绍一种通过统计扭转态跃迁来识别蛋白-配体复合物模拟采样问题的简单分析工具。
LLibra OS 的灵活基础设施,支撑我们整合不断演进的生物学与 AI 进展,以发现差异化的 RNAi 药物。阅读 AWS 案例研究,了解我们如何构建并扩展 LLibra OS,以支持发现和开发我们 GalOmic 药物的团队。链接见下 🔗