#非AI/通用工具

gmx_MMPBSA 1.7 系列更新：结构水、熵计算和突变扫描有哪些变化？

开源结合自由能计算工具 gmx_MMPBSA 发布 v1.7.1，与今年 9 月的 v1.7.0 共同扩展了结构水、熵估计和 AMBER 工作流支持。

英矽智能CEO评Citrini用Claude做药物设计

英矽智能CEO Alex Zhavoronkov 评价 Citrini Research 的 AI 药物设计尝试，认为其思路与团队 2019 年 GENTRL 的 Nature Biotech 论文相似，只是换成了 Claude。他指出真正的难点在小鼠、狗和猴研究，如今获得好的结合剂并不难，小分子领域更难，但投资机构能做出这样的尝试仍令人印象深刻。

英矽智能AI设计非阿片类镇痛药ISM9528临床前动物模型表现或优于吗啡

英矽智能创始人Alex Zhavoronkov称，其阿布扎比Masdar City团队用AI设计的非阿片类镇痛药ISM9528在临床前动物模型中可能比吗啡更有效，相关说法引自The National的报道。他表示下一步将推进人体研究，并称这是AI到药片流程的一次实践。

同一新闻，精选展示《英矽智能PandaOmics发现靶点、Chemistry42设计出口服非阿片类镇痛候选ISM9528》

Minerva模型接入Proto MCP

我们现已在 Proto MCP 上部署了 Minerva 语言模型及其交互头！ 以下是一个使用 @ChatGPT 重新查看非编码 RNA 现有注释的示例：https://chatgpt.com/share/6abe9cea-c494-83e9-910d-f0d91b97ca41

Collaborations Pharmaceuticals 用机器学习模型发现广谱抗病毒分子 CPI-1058，对埃博拉 Bundibugyo 病毒有亚微摩尔抑制活性

Collaborations Pharmaceuticals 利用其已发表的埃博拉抑制机器学习模型识别出小分子 CPI-1058，并经学术机构和 NIAID 资助实验室的体外合作测试，显示其对 Sudan 与 Bundibugyo 病毒均为亚微摩尔抑制剂。

不是所有工业AI都需要大模型：小模型如何进入研发闭环

创腾科技在「AI 进入研发现场」系列第三篇中提出，工业研发更需要面向具体任务的性能预测、实验代理优化与现场判别三类专用小模型，而非通用大模型。文章引用电解液配方优化、电池快充协议和液相色谱方法开发三个公开案例，说明代理模型与贝叶斯优化可在闭环中减少实验次数。

Rowan 博客：对接之后该做什么

许多刚接触基于结构的药物发现的科学家，能直观理解如何以及何时运行对接或共折叠，但不太确定下一步该做什么。 在我们最新的博客文章《What to Do with a Pose》中，我们提供了一份关于后续步骤的快速指南： https://rowansci.com/blog/what-to-do-after-docking

Eikon Therapeutics 在 Nature Methods 发表斜线扫描（OLS）技术论文

Eikon Therapeutics 在 Nature Methods 发表论文，介绍其斜线扫描（OLS）技术，该技术可与公司单分子追踪（SMT）平台结合，在活细胞中以最高每秒 14 平方微米的速度评估蛋白运动。

HotSpot Therapeutics 宣布收购 Macroceutics，将约10亿化合物DEL库整合进 SpotFinder™ 平台

HotSpot Therapeutics 宣布收购 DNA 编码化合物库（DEL）筛选技术公司 Macroceutics，获得约10亿个定制类药分子及全套 DNA 化学与筛选能力，并将其整合进预测和区分蛋白变构调控位点的 SpotFinder™ 平台。

A-Alpha Bio 获 NSF Phase I SBIR 资助开发 AlphaSeq

A-Alpha Bio 获得美国国家科学基金会（NSF）Phase I SBIR 资助 22.5 万美元，用于开发基于细胞的 AlphaSeq 平台，以高通量、定量表征蛋白质-蛋白质相互作用来加速癌症药物开发。该资助旨在扩展 AlphaSeq 筛选难处理蛋白和不溶性小分子药物相互作用的能力。