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ACS JCIM (化学信息与建模)· Ana Cristina Chang-Gonzalez, Alexis N. Campbell, Eric W. Bell, Raymond D. Blind, Jens Meiler·· 2 天前精选AI 评分60

结合对接变异性与相互作用能的化合物优先级策略识别LRH-1潜在结合剂

Computational Compound Prioritization Strategy Incorporating Docking Variability and Interaction Energies Identifies Putative LRH-1 Binders

AI 导读

【摘要级】研究提出一种化合物优先级排序策略,利用靶向物理对接与生成模型盲对接采样得到的构象,在LRH-1(NR5A2)正构配体结合口袋的多构象上训练两个多层感知机(MLP)预测结合剂或激活剂。在分布外化合物集上,MLP能识别与训练集化学结构不相似的化合物,并对单一骨架修饰敏感。将该方法用于一项前瞻性药物发现初步研究,识别出四个LRH-1潜在结合剂;评分与预测指标组合可在不同库规模下富集命中化合物。

推荐理由

该方法把两种对接采样与多构象信息用于训练排序模型,为减少结构筛选假阳性提供可迁移思路。

来源:ACS JCIM (化学信息与建模) · doi.org