Atlas Bio完成1250万美元融资，用AI模拟预测药物应答替代动物试验
瑞士巴塞尔初创企业Atlas Bio走出隐匿模式，完成1250万美元融资，其中Creandum领投1000万美元种子轮，First Momentum Ventures与LEA Partners此前领投250万美元种子前融资。
推荐理由：融资事件同时交代了RNA表达谱训练数据、12周模拟周期与FDA非临床研究新规，可对照其替代动物试验的定位。
#药物响应
智药邦精选AI 评分5858
BioTender精选AI 评分7474 CellType推出BioSimBench细胞响应预测评测体系与BioSimGym训练环境
CellType推出BioSimBench，用真实实验数据评测模型对药物处理、基因敲低和免疫信号等干预后基因表达变化的预测，共设四个预测赛道和一个工具型科研智能体赛道。
推荐理由：该评测用真实实验数据考察模型对未见干预条件的基因表达预测，并给出各赛道留出设置与分数对照。
医药魔方精选AI 评分5858 Differentia Bio以IgG4-RD前瞻性预测获独立临床验证，推进虚拟人体模拟
Differentia Bio称其针对IgG4相关性疾病（IgG4-RD）的机制预测先后获得独立人体临床研究支持：2025年4月靶向CD19+的inebilizumab获FDA批准用于该适应症，2026年1月第三方公布的dupilumab早期研究中5名患者有4名出现临床改善及血清IgG4水平下降。
推荐理由：文章梳理了Differentia Bio先预测后获独立临床证据支持的案例，为评估AI疾病模型提供参照。
Recursion精选AI 评分5858 Recursion 发布 Q3 更新：REC-4881 新数据、赛诺菲与基因泰克合作里程碑及现金跑道延至 2029 年
Recursion 在 Q3 更新中报告，REC-4881 在 FAP 的 TUPELO 二期数据显示，治疗 12 周后 87% 患者总息肉负荷下降，85% 可评估患者在停药 12 周后仍低于基线，两名患者较大息肉数量从 90 个以上降至 1 个。
推荐理由：Recursion 季度更新同时披露 REC-4881 的 FAP 二期数据、赛诺菲与基因泰克合作里程碑及现金跑道，可对照其平台兑现节奏。
深势科技 DP Technology精选AI 评分7474 深势科技合作开发的虚拟细胞模型ProteinTalks登上Nature，并推进药效预测落地
深势科技与合作团队在《Nature》发表虚拟细胞模型ProteinTalks，将大规模动态蛋白质组与神经常微分方程预训练结合，用于药物扰动响应预测。
推荐理由：深势科技作为论文合作方，梳理了ProteinTalks在单药筛选、联用与耐药机制上的实验验证路径。
王初课题组精选AI 评分6363 Nat. Chem. Biol. | 基于蛋白质组发现并缓解雄激素受体降解剂的肝毒性
阿斯利康团队在Nature Chemical Biology发表研究，用DIA蛋白质组流程筛查204个雄激素受体异双功能降解剂（AR-HBD），将肝毒性定位至线粒体复合体Ⅰ，并据此改造出低毒性化合物3号。
推荐理由：研究用DIA蛋白质组与机器学习把AR降解剂肝毒性定位到线粒体复合体Ⅰ，并据此改造出低毒性候选化合物。
DrugAI精选AI 评分7474 Nat. Biotechnol.：单细胞多组学动力学模型DynaVelo预测B细胞功能缺失与恢复的扰动效应
研究人员开发了基于神经常微分方程的生成式深度动力学模型DynaVelo，联合单细胞RNA表达与转录因子结合基序可及性重建细胞状态转变向量场，并模拟基因功能缺失与挽救扰动。
推荐理由：该研究用单细胞多组学动力学模型预测基因功能缺失与挽救，并在小鼠B细胞中做了双杂合突变验证。
DrugAI精选AI 评分7272 Nat. Methods 比较四种自监督学习模型的细胞形态扰动表征
研究人员在JUMP–Cell Painting数据集约177万张高内涵图像上预训练DINO、MAE、iTPN和DINOv2，并在独立化合物、不同细胞类型和遗传扰动数据集上比较其细胞形态扰动表征。
推荐理由：研究在统一基准上比较四种自监督模型与传统CellProfiler，为细胞形态表型分析选型提供参照。
智药局精选AI 评分5858 Flagship 合并 Cellarity、Etiome、Empress 成立 AI 制药公司 Etcelera
Flagship Pioneering 于 10 月 29 日宣布整合 Cellarity、Etiome、Empress Therapeutics 三家公司的平台技术，成立新型药物发现公司 Etcelera，由 GSK 老将 Adrian Rawcliffe 任 CEO，莫德纳联合创始人 Noubar Afeyan 为联合创始人。
推荐理由：Flagship 将三家平台公司合并为 Etcelera，其细胞状态与扰动数据整合方式为观察 AI 制药平台组织提供了案例。
BioAIDesign精选AI 评分7070 北大等团队在bioRxiv发布CellCompass：用AI智能体设计细胞动力学模型
北京大学周沛劼、加州大学欧文分校Qing Nie等团队在bioRxiv发布CellCompass，一套围绕实验数据选择、改写和检验细胞动力学模型的科学智能体系统。
推荐理由：预印本提出用智能体按实验线索选择与改写细胞动力学模型，并在模拟基准和四类真实数据上给出对照结果。
LeapFun精选AI 评分6060 UCL与剑桥团队在Cell Reports Medicine发表三阴性乳腺癌肿瘤数字孪生研究，疗效预测准确率74%
伦敦大学学院联合剑桥大学在Cell Reports Medicine发表研究，用符号AI基于患者基因组信息构建个性化三阴性乳腺癌肿瘤数字孪生，在PARTNER试验31名患者数据上回顾性模拟化疗及化疗联合奥拉帕利等方案，疗效预测准确率为74%。
推荐理由：研究用符号AI为三阴性乳腺癌患者构建肿瘤数字孪生，在31例回顾性数据上给出疗效预测与联合用药假设。
BioArt精选AI 评分7878 Cell发表Tahoe-100M：亿级单细胞图谱解码药物扰动下肿瘤细胞分子表型
Tahoe Therapeutics的Johnny Yu与Hani Goodarzi团队在Cell发表Tahoe-100M，构建覆盖50株肿瘤细胞系、379种小分子药物、约1100组药物-剂量条件的亿级单细胞药物扰动转录组图谱。
推荐理由：该图谱以亿级单细胞数据刻画药物扰动表型，并揭示同靶点药物的周期效应差异，为扰动预测模型提供训练资源。
Ginkgo Datapoints · Updates精选AI 评分6262 VCPI 发布 ReFRAME 化合物库 DRUG-seq 图谱，覆盖 12,949 个化合物并以 CC BY 4.0 开放
虚拟细胞药理学计划（VCPI）发布其迄今最大规模的数据集，为 ReFRAME 药物重定位化合物库提供阵列式 DRUG-seq 转录组图谱，覆盖 12,949 个化合物。数据在 THP-1 细胞中以 10 μM 剂量、每孔一个化合物进行筛选，注册用户可在 thevirtualcell.com 免费获取，并以 CC BY 4.0 开放。
推荐理由：该发布提供覆盖近1.3万临床阶段化合物的转录组扰动数据，可作为药物响应与虚拟细胞研究的公开数据资源。
BioTender精选AI 评分6969 预印本《Plausibility Is Not Prediction》指出虚拟细胞扰动预测的评测漏洞
Xinyu Yuan、Xixian Liu 等人的预印本《Plausibility Is Not Prediction》检验细胞扰动二分类差异表达预测，发现忽略扰动身份的 Gene-prior Voting 基线在 C32 黑色素瘤任务总体 AUROC 仍达 0.990，但改为同基因内比较扰动的 macro-per-gene 评测后该基线 AUROC 只有 0.500。
推荐理由：研究用分基因评测揭示总体 AUROC 高分可能绕开扰动区分，为虚拟细胞扰动预测的评测方式提供参照。
DrugAI精选AI 评分6262 Nat. Methods 发表 CauTrigger：用分层因果分解识别生物状态转变驱动因子
研究人员在 Nature Methods 发表 CauTrigger，一个融合因果推断与深度潜在变量建模的分层因果分解框架，用于从观测组学数据中识别状态转变的上游驱动因子并预测扰动响应。
推荐理由：该框架把多层调控拆成因果与非因果潜在变量，并在多组学数据上给出可检验的候选驱动因子。
智药局精选AI 评分6262 BMS一日敲定三起AI合作，Pathos获2.37亿美元E轮融资、Tempus获1.375亿美元数据授权
百时美施贵宝（BMS）在10月23日公布三起AI相关合作，包括领投Pathos的2.37亿美元E轮融资（投后估值约30亿美元），并与Pathos、Tempus联手研究阿尔茨海默病等神经系统疾病。
推荐理由：梳理BMS一日内三笔AI合作的分工与金额结构，可看清药企以数据授权加股权投资布局AI的具体方式。
GEN (基因工程与生物技术新闻)精选AI 评分5858 多组学研究揭示MSS结直肠癌的可靶向弱点
RCSI与英国癌症研究院领衔的国际团队整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学、单细胞与临床数据，开发AI工具iPhenMap构建肿瘤生物学图谱，识别出MSS结直肠癌此前未被发现的弱点。在实验室模型中，靶向药trametinib与其他药物联用可显著抑制肿瘤生长并延长生存，研究结果发表于Cancer Cell，仍属临床前阶段。团队称该结果可为现有药物重定位和新药开发提供路线图，并可能推广至其他瘤种。
推荐理由：研究整合约2000例结直肠癌肿瘤的多组学与单细胞数据，为MSS CRC的联合用药与老药新用提供临床前线索。
STAT News · Biotech精选AI 评分5858 Pathos 完成 2.37 亿美元 E 轮融资，估值约 30 亿美元并扩展至神经疾病
AI 药物开发公司 Pathos 宣布完成由 Bristol Myers Squibb 领投的 2.37 亿美元 E 轮融资，估值约 30 亿美元。公司同时从肿瘤扩展至神经疾病领域，借助 Tempus AI 的新数据集，并与 BMS 合作，首个方向为阿尔茨海默病治疗。
推荐理由：Pathos 完成 E 轮融资并扩展至神经疾病领域，可观察 AI 平台如何介入临床资产取舍与试验设计。
Pathos AI 官网资讯精选AI 评分6363 Pathos AI 与 BMS、Tempus AI 达成合作，以阿尔茨海默病等神经疾病为起点推进 AI 药物开发
Pathos AI 宣布与 Bristol Myers Squibb 和 Tempus AI 达成多年战略合作，为阿尔茨海默病及其他神经疾病构建专用数据集与智能体 AI 能力。
推荐理由：Pathos 与 BMS、Tempus 围绕神经疾病数据与 AI 平台达成合作，可观察 AI 平台如何介入临床开发决策。
BioTender精选AI 评分6565 Xaira 发布药物发现智能体平台 X-Scientist
Xaira 于 2026 年 10 月 21 日发布药物发现智能体平台 X-Scientist，公司报告其提名的基因干预在 HepG2 细胞实验中命中率为 7.1%，人工筛选为 6.9%，随机组为 0.9%。
推荐理由：发布文把命中率、基准增益与成本放在同一套证据里，并逐项标注了计时对象和验证方式的边界。