Schrödinger的Robert Abel谈智能体计算中人类决策
当智能体执行计算：Schrödinger的Robert Abel谈人类仍在何处做决定 https://www.biopharmatrend.com/interviews/interview-with-robert-abel-from-schrodinger/
#其他
BiopharmaTrendAI 评分3838
木可AI探索笔记AI 评分2525 boltz-2 与 rosalind 生物 token 单价差异分析：5-25 倍从何而来
按 boltz-2 一次预测折算约 200 残基生物 token 计算，其单价为 125 美元/百万 token，是 rosalind 输入价格的 25 倍、输出价格的 5 倍。原文仅提出这一折算与差异来源的疑问，未给出进一步核算或结论。
STAT News · BiotechAI 评分1818 Life Biosciences 公布细胞重编程药物青光眼研究更新
Life Biosciences 公布了其细胞重编程药物在青光眼研究中的更新，具体数据未在可获取内容中披露。该报道为 STAT+ 付费订阅内容，正文仅显示研究更新这一信息。
Drug Discovery WorldAI 评分1818 信息学如何将数据转化为疗法
信息学：将数据转化为疗法 下载阅读或收听： https://info.edifydigitalmedia.com/ebook-informatics-transforming-data-into-therapeutics 关注 DDW；面向全球科学界的商业洞察 由 Inotiv 赞助 #Therapeutics
Drug Discovery WorldAI 评分1515 GPCR检测预测能力提升网络研讨会
提升GPCR检测的预测能力：揭示隐藏的药理学 立即注册！ 10月29日，太平洋夏令时上午8点 / 美国东部夏令时上午11点 / 格林尼治标准时间下午3点 / 中欧时间下午4点 https://hubs.li/Q04yqFfv0 关注DDW；面向全球科学界的商业洞察 #药理学
Sergey OvchinnikovAI 评分88 求借用空闲AMD GPU测试移植方法
有人有闲置的免费AMD GPU可以借用吗？想测试一些移植的方法，但手头没有AMD GPU可用于测试。
Patrick HsuAI 评分33 无明确主体，无法概括
请来一杯内格罗尼，加一颗大冰块中微子
Amir ShanehsazzadehAI 评分6060 Anthropic 与 Adaptyv 蛋白设计竞赛第二题锁定 TNF-α 结合剂
Anthropic 与 Adaptyv 蛋白设计竞赛公布第二道挑战，目标是为 TNF-α 设计更优结合剂，并要求其在细胞内体 pH 6.0 条件下选择性释放以改善药物半衰期。该设计还需同时结合人源和小鼠 TNF-α，以便在临床前模型中测试同一设计；Amir Shanehsazzadeh 转发称该靶点本身对结合剂设计就很难，pH 要求进一步加大难度。
Adaptyv Bio精选AI 评分5858 Adaptyv Bio 与 Anthropic 蛋白设计竞赛第二期：设计 pH 6.0 选择性释放的 TNF-α 结合剂
Adaptyv Bio 宣布 Anthropic x Adaptyv 蛋白设计竞赛第二期，目标是设计优于现有药物的 TNF-α 结合剂，并能在细胞内体 pH 6.0 条件下选择性释放以改善药物半衰期。设计要求还包括同时结合人源和小鼠 TNF-α，以便在临床前模型中测试同一设计。
推荐理由：比赛把 TNF-α 结合剂设计放到 pH 6.0 选择性释放和跨人鼠结合的双重约束下，可观察设计如何兼顾亲和力与可开发性。
Frank NoéAI 评分33 Frank Noé 与 CecClementi 的助眠推文
如果你睡不着，就数叶羊跳过沙粒……和@CecClementi一起
BioSymetricsAI 评分2222 BioSymetrics用纵向数据识别患者表型
患者生物学如何让药物开发决策更精准？我们从纵向人体数据和机器学习出发，识别患者表型。#帕金森病 #生物标志物 #药物发现
Andrés M. BranAI 评分1212 b12Labs 预告新进展
@b12Labs 那边正在酝酿着什么 🔥 化学并不总是这么酷。但光化学常常如此！
Kevin K. YangAI 评分88 Kevin Yang预告即将展示项目
在我向你介绍的时候，应该把这个投出来
Sergey OvchinnikovAI 评分55 Sergey Ovchinnikov 发推预热
正在为今天做准备……😅
Brian HieAI 评分1818 Evo-Φ36冷冻电镜结构获PDB月度分子
很高兴我们的Evo-Φ36冷冻电镜结构在PDB 55周年的“月度分子”文章中获重点介绍！ 获得这个结构是@_David_Li @samuelhking @driscoll_cl @maxewilkinson的出色工作。 https://pdb101.rcsb.org/motm/322
Amir ShanehsazzadehAI 评分2020 蛋白质设计编辑挑战赛启动
🔥
Eric AlcaideAI 评分66 Eric Alcaide 盛赞某公告
好一则公告。多来点这样的
Martin PacesaAI 评分55 Martin Pacesa 称找到最爱新画作
我找到了我最喜欢的新画作
Patrick HsuAI 评分88 Patrick Hsu：要么整合长尾要么身处其中
你要么在整合长尾，要么就在长尾之中
Rowan ScientificAI 评分55 Rowan Scientific 推文引热议
如果是真的，那可就厉害了
予路乾行AI 评分2222 予见｜予路乾行徐戚轩：如何在真实药物研发中理解计算化学的价值？
予路乾行项目负责人徐戚轩在访谈中讲述从计算化学工程师到项目负责人的成长，并复盘一项分子胶研究：计算方法构建分子胶体系的准确度已接近晶体结构，可更快捕捉关键相互作用位点。该工作借助自研DIVAMICS平台从三维结构叠加时间维度刻画结合机理，论文发表于JCIM，投稿修改意见累计近100条。
Sergey OvchinnikovAI 评分55 Sergey Ovchinnikov 列出下一步需求
私下列出的我接下来需要的东西……
PostEra精选AI 评分5858 PostEra 两个生育适应证项目被 EMD Serono 收购
PostEra 宣布 EMD Serono（默克集团美国医疗健康业务）已收购其两个针对生育适应证的项目。公告未披露交易金额、项目代号、所处研发阶段及具体适应证。
推荐理由：PostEra 将两个生育相关项目出售给 EMD Serono，可观察 AI 制药平台资产被跨国药企收购的路径。
Hannes StärkAI 评分2020 Bill DeGrado谈蛋白质设计中的AI
“蛋白质设计之父”Bill DeGrado谈论AI在该领域的应用，还有一些人生建议 :) 值得花10分钟：https://open.spotify.com/episode/3DmHEfsGxBaWR9je4pJR8t
水木分子AI 评分3838 ChatDD 2.0（原OpenBioMedPro）提出Result as a Service：药物研发AI从回答问题转向完成任务
水木分子介绍ChatDD 2.0（原OpenBioMedPro），将产品定位从"AI即服务"推向"结果即服务"，让AI承接药物研发任务而非仅回答问题。该产品以任务负责人定义用户角色，通过Plan规划、Skill业务SOP调用、多模块执行与Memory项目工作区，输出分章节结果和Synthesis综合报告，并可转为HTML和PPT。医学、注册、专利、财务和投资等高风险结论仍须由专业人员复核确认。
北京科学智能研究院AISIAI 评分1212 北京科学智能研究院（AISI）招募AI for Science实习生，覆盖OpenLAM、质谱与材料团队
北京科学智能研究院（AISI）发布实习专辑，为大原子模型（OpenLAM）、质谱、材料、数据科学等团队招募实习生。岗位涵盖计算化学、机器学习势函数工程、蛋白质结构生成与质谱信号解析等方向，要求相关专业在读或硕士以上学历并具备Python等编程能力。
Chris GibsonAI 评分55 Recursion高管发文“全力推进”
全力推进……
Eric AlcaideAI 评分1212 数据本身值得亲自查看
其实亲自查看数据是一个人能做的最好的投资 无论你什么时候读到这句话
Rowan ScientificAI 评分3838 Rowan NMR 工作流新增 J 耦合计算
Rowan 的 NMR 工作流现已可计算并可视化 J 耦合：
PostEra精选AI 评分5656 PostEra 自建管线三年，公布 PMOS 与不孕症两个临床候选化合物
PostEra 表示其内部管线启动已满三年，已产出针对 PMOS 和不孕症的两个临床候选化合物，并将其归功于 AI 平台 Proton 与药物发现、工程团队的协作。推文未披露两个候选化合物的具体分子、靶点、临床阶段或数据。
推荐理由：PostEra 自建管线三年后披露两个临床候选化合物，可观察其 AI 平台 Proton 从算法到管线的落地路径。
Rowan ScientificAI 评分4242 Rowan推出重写反应建模工具包
我们今天在Rowan上线了重写的反应建模工具包，恰逢我们在巴塞罗那计算化学GRC上就此做报告。（如果你在现场，去找Jonathon聊聊！） 我们为速度重写了一切，并添加了一堆实用功能（🧵）：
Hannes StärkAI 评分55 猜猜这个ID :3
猜猜这个ID :3
Jason YimAI 评分1717 车库自研阿尔茨海默病新药PAC-832
“Breaking good”
Simon KohlAI 评分2020 Simon Kohl 回顾 CVPR 主题演讲
对我 CVPR 主题演讲的精彩总结。
Ali MadaniAI 评分1212 Profluent团队发布重要成果
这次发布规模巨大。 如此多令人印象深刻的结果、描述详尽的方法，以及全方位的开放科学。 真令人耳目一新。祝贺团队。你们的论文现在基本上就是教科书了。
Thomas ClozelAI 评分88 Thomas Clozel 探讨生命重要循环的表征
试图表征生命中最重要的那些循环（不是指《狮子王》）。你们怎么看？ @Neko @function @biogerontology @zavaindar @shak @bioagelabs
MedraAI 评分88 Medra AI 发布推文互动
看呐，是你！
Mol.AIAI 评分3838 药物研发效率工具：一键预测分子 AlogP，独立测试集 R² 达 0.7615
基于Mordred提取的1800余个分子描述符经筛选保留604个关键特征，超参数调优后的XGBoost模型在独立测试集上预测AlogP的R²达0.7615。特征重要性分析显示支链化程度（NsssCH）、电荷分布特性（AATSC0c）与3D饱和度（HybRatio）是影响AlogP的核心因素。
Mol.AIAI 评分2020 分子对接：c-Abl激酶与伊马替尼的重对接验证
将伊马替尼重对接至c-Abl激酶活性口袋，AutoDock Vina最优构象结合能为-13.9 kcal/mol，与晶体原配体重原子RMSD为0.895 Å（37个原子对），低于2.0 Å阈值。对接构象保留了与Met318主链、Asp381及Glu286的关键氢键相互作用，验证了格点坐标、电荷计算与加氢等对接参数设置的准确性。
Ginkgo Datapoints · Updates精选AI 评分6060 VCPI 发布首个开源转录组数据集：在 THP-1 细胞中分析 2200 余种化合物
虚拟细胞药理学倡议（VCPI）发布首个开源转录组数据集，在 THP-1 细胞中以 6 个剂量（0.03 至 10 µM）、24 小时处理约 2280 个小分子，采用阵列式 DRUG-seq 获得化合物特异的转录组谱。
推荐理由：VCPI 首次公开约 2280 个小分子的 THP-1 转录组数据，为虚拟细胞药物响应模型提供可复用训练集。