Benchling推出Science Foundries
突发：@benchling 刚刚推出 Science Foundries，从帮助科学家完成单项任务，转向用 AI 智能体团队管理整个科学流程。 https://www.biopharmatrend.com/news/benchlings-science-foundries-put-teams-of-ai-agents-in-charge-of-whole-rd-workflows-1606/
#模型/算法发布
BiopharmaTrendAI 评分4040 Insilico Medicine 英矽智能精选AI 评分5858 英矽智能在虚拟细胞论坛展示虚拟衰老细胞模拟框架
英矽智能全球AI平台负责人Petrina Kamya在虚拟细胞论坛介绍了公司的虚拟衰老细胞模拟框架，该框架基于12年自有数据与基准测试构建，覆盖分子、细胞内、细胞间、组织/器官和机体五个生物学尺度。系统在每个生物层级使用约43个专用AI智能体，以患者种子基线图谱模拟干预后的细胞状态转变。Kamya表示，公司正在全自动机器人实验室中对机制未知的新分子开展前瞻性验证，以检验预测并排除对文献的记忆。
推荐理由：英矽智能公开虚拟衰老细胞框架的跨尺度多智能体架构，并说明其正用自动化实验室做前瞻验证。
Insilico Medicine 英矽智能AI 评分4040 英矽智能免费开放MMAI ADMET模型
1个模型。28项关于你分子的预测。🧪 它会被人体吸收吗？可能有毒性吗？作为潜在药物它会有怎样的表现？ 认识MMAI ADMET，我们用于药物发现的SOTA模型家族的一员。🧪 🚀 现已免费开放试用！ 👉 https://playground.insilico.com
智药局精选AI 评分6262 Boltz小分子模型BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间
Boltz于10月13日宣布，其小分子模型BoltzMol-1可直接搜索药明康德的GalaXi虚拟化合物库，该库规模约260亿个可合成分子，已在Boltz Lab平台和Boltz API上线供全球用户调用。
推荐理由：BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间，反映AI小分子模型对可合成化合物库的依赖。
英矽智能精选AI 评分5858 Pharma.AI 2026 秋季发布回顾：以专业模型与 AI 智能体重构新药研发
英矽智能在2026年Pharma.AI秋季网络研讨会上发布MMAI Gym科学后训练与评估框架，并展示激酶活性、GPCR活性、ADMET预测、单步逆合成和治疗靶点发现五款专业模型，公司称其在70多项化学与生物学基准任务中达到或超越当前SOTA。
推荐理由：英矽智能一次性披露Pharma.AI秋季多项更新，含专业模型基准表现与逆合成对比数据，可作平台能力横向参照。
智药邦精选AI 评分5858 丹纳赫推出AI驱动自主实验室，计划2027年初规模化运营
丹纳赫于2026年10月7日宣布计划推出旗下首个AI驱动自主实验室，用于加速定制抗体及其他分子工具的发现，预计2027年初实现规模化运营。
推荐理由：丹纳赫披露自主实验室的整合方式与产能目标，可作为抗体发现自动化的产业参照。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分5858 Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon，并展示其在酶设计与科研任务上的应用
Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon，通过 API、AI Studio、Gemini 平台及 Antigravity 等入口向开发者、企业和科研人员开放，输入定价为每百万 token 2 美元、输出为每百万 token 10 美元。
推荐理由：Gemini 4 Argon 在数小时内完成丝氨酸酯酶设计，并经实验室测试确认催化活性，为通用模型参与酶工程提供了具体案例。
HouMedAI 评分1818 喜报｜双金！课题组项目荣获浙江省国际大学生创新大赛（2026）金奖！
课题组两个项目在浙江省国际大学生创新大赛（2026）获双金，其中LynxMind以高教主赛道本科生创意组人工智能+赛道第一名斩获金奖。LynxMind聚焦中枢神经系统药物发现，整合血脑屏障穿透性预测、分子生成与优化及可解释性分析；PROTACnova以自主智能体连接信息检索、分子生成、连接子优化与理化评估，面向蛋白降解药物设计。
ClickMab 科迈生物AI 评分2525 Click.mAb. 多智能体 AI 抗体设计平台：AI 参与抗体设计会碰撞出怎样的新可能？
ClickMab 科迈生物打造 Click.mAb. 多智能体 AI 抗体设计平台，让多个 AI Agent 协同完成靶点研究、抗体结构分析到特定表位抗体从头设计。用户只需提出研究目标，平台即可规划任务、调用工具并执行分析，一键实现特定表位抗体从头设计。
insitro · Publications & Press精选AI 评分6565 insitro 与礼来共建的小分子体内 PK 预测模型上线 Lilly TuneLab
insitro 与礼来合作构建的小分子体外及体内性质预测机器学习模型，现已向部分生物技术公司开放于 Lilly TuneLab。模型基于礼来数十年研究产生的多物种临床前数据训练，覆盖数十万个独特分子，并会随数据集扩展而更新；insitro 称其可作为当前从体外实验外推的行业标准方法的替代方案。
推荐理由：礼来与 insitro 用数十年多物种临床前数据训练的小分子体内 PK 预测模型进入 TuneLab，为早期筛选提供参照。
insitro · Publications & Press精选AI 评分7272 insitro 与礼来在 TuneLab 推出体内 PK 预测机器学习模型
insitro 与礼来在 Lilly TuneLab 平台上线体内 PK 预测模型，可跨小鼠、大鼠、狗和猴四种临床前物种预测血浆清除率、稳态分布容积和平均驻留时间。
推荐理由：该模型用礼来历史数据直接预测体内PK，并与体外外推法对比，为小分子成药性评估提供参照。
Justas Dauparas精选AI 评分7272 Xaira 发布 X-Design，针对真实治疗靶点从头设计抗体
Xaira 的 Justas Dauparas 介绍团队开发的 X-Design，称其能针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规发现方法攻克。相关细节见 Xaira 官网新闻页，推文未披露具体靶点、实验数据或验证结果。
推荐理由：Xaira 员工披露 X-Design 针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规方法发现。
TurbineAI 评分3030 Turbine 将携 vLab ADC 平台亮相 World ADC
Turbine 团队将赴圣迭戈参加 World ADC，并推介 vLab® ADC Intelligence 平台，可在投入湿实验资源前开展虚拟实验。该平台覆盖 113 种药物及组合（含 6 种 ADC 和 21 种 payload）、1348 个映射至患者亚型的生物样本，并支持用户自建分子与样本建模，用于适应证定位、联合方案协同性与体外结果向 PDX 模型的可转化性评估。
Isomorphic LabsAI 评分3838 Isomorphic Labs 推出药物设计引擎 IsoDDE
Isomorphic Labs 的药物设计引擎 IsoDDE 可智能搜索庞大化学空间，设计面向真实世界的功能性分子，将过去数月的实验室工作缩短为计算数天完成。其药物设计智能体从生物靶点和目标分子性质等严格设计规范出发，在 2-4 天内自主迭代生成新分子设计，公司称带来真实世界功能性进展。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分7474 Google DeepMind 推出 SynthID Bio，为 AI 生成蛋白与结构嵌入可验证水印
Google DeepMind 推出面向合成生物学的 SynthID Bio 水印方法，可在蛋白序列和 AlphaFold 3 预测的 3D 结构中嵌入可检测签名，并在实验室测试中保持生物功能。
推荐理由：介绍一种嵌入蛋白序列与预测结构的可验证水印方法，并给出湿实验与检测稳健性证据。
望石智慧AI 评分5555 望石智慧在云栖大会首发小分子医药早研智能体MolVortex
望石智慧在2026云栖大会首发全栈式小分子医药早研智能体MolVortex，以多智能体协同架构和决策罗盘数据底座覆盖情报分析、分子设计、亲和力与口袋分析、合成性与成药性评估等早期研发环节。
唯信计算精选AI 评分6363 唯信计算 WeMol 推出 AbForge 多特异性抗体全原子结构建模引擎
唯信计算在 WeMol 平台上线 AbForge，输入完整抗体 FASTA 后自动识别 Format 与结构域拓扑，按 KiH、CrossMab 等工程约束装配全原子三维模型。
推荐理由：官方展示多特异性抗体结构建模引擎与通用折叠模型在八个已上市或临床后期分子上的几何构型差异。
EMBL-EBI News精选AI 评分6868 AlphaFold 数据库新增病毒蛋白复合物预测，覆盖 2800 多种病毒
EMBL-EBI 与 Google DeepMind、NVIDIA 等合作，在 AlphaFold 数据库中开放 2800 多种病毒的 AI 预测蛋白复合物结构，优先覆盖已知感染人类的病毒科。
推荐理由：AlphaFold 数据库新增 2800 多种病毒的蛋白复合物预测结构，为疫苗与诊断靶点研究提供开放基础数据。
Isomorphic LabsAI 评分2222 Isomorphic Labs 推出药物设计引擎 IsoDDE
Isomorphic Labs 推出药物设计引擎 IsoDDE，称其可覆盖从小分子到复杂生物药的多模态药物空间。推文以保守估计的小分子化学搜索空间约 10^60 作对比，称可观测宇宙恒星数量仅约 10^22 至 10^24。公司称该引擎使其具备在这一空间中导航的能力，但未披露具体方法、验证结果或实验数据。
德睿智药精选AI 评分6868 德睿智药发布生命科学基座模型体系Intera，首推结合构象预测模型InteraFold-Chem
德睿智药于2026年9月18日发布生命科学基座模型体系Intera，并公布首个模型InteraFold-Chem的技术报告，该模型聚焦蛋白质与小分子的结合构象预测。
推荐理由：德睿智药公布InteraFold-Chem在445个测试样本上的结合构象预测成功率，并给出与Protenix-v2、Chai-1、Boltz-2的对照结果。
Mohammed AlQuraishi精选AI 评分7676 AlQuraishi 团队与 Apheris 用五家药企私有数据训练 OpenFold3p2
Mohammed AlQuraishi 表示，团队与 Apheris 合作，在五家药企内部的蛋白-配体复合物数据库上训练了 OpenFold3p2。由于 PDB 中类药化合物相对稀少，这批数据使相关结构数据量增加 3-4 倍，并带来精度显著提升。作者称训练数据未离开各药企内部环境。
推荐理由：作者披露 OpenFold3p2 在五家药企私有蛋白-配体结构上联合训练，给出数据规模与精度变化的具体参照。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分7272 Inductive Bio 发布 Beacon-2，可由化学结构预测小分子人体有效剂量
Inductive Bio 于 9 月 17 日发布 Beacon-2，该系统可直接从小分子化学结构预测人体有效剂量，先预测吸收、分布、代谢、排泄与毒性等决定剂量的性质并估算效力，再通过药代动力学机制模型整合。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可从结构计算的指标，并给出在真实药物项目与公开化合物上的验证范围。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分7373 Inductive Bio 发布 Beacon-2 模型，从化学结构直接预测人体有效剂量
Inductive Bio 发布 Beacon-2，这是对 Beacon 系列模型的重大更新，可在 ADMET 之外直接从化学结构预测分子的有效人体剂量，由 ADMET-PK、效力与 PK/PD 三个可配置模块组成。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可计算目标，并用 Indy 智能体的对照实验展示只优化效力会出现的偏差。
临港实验室精选AI 评分5555 临港实验室元生·开物发布AI原生制药工作台升级版
临港实验室元生·开物发布新版本，上线协作空间与OriBench Structure Viewer，支持多人多Agent协作、蛋白结构叠合与靶点注释，并开放自定义套件能力。
推荐理由：临港实验室发布元生·开物工作台升级，展示多模型配置在BiomniBench-DA上的对照结果与协作功能。
天鹜科技精选AI 评分7676 天鹜科技开源全原子结构预测模型VenusFold，FoldBench多类任务领先AlphaFold3与Boltz-2
天鹜科技发布并开源通用全原子生物分子结构预测模型VenusFold的代码与权重，可预测蛋白质、蛋白质-小分子和蛋白质-蛋白质复合物结构。
推荐理由：天鹜科技开源可商用的全原子结构预测模型，在统一基准下与 AlphaFold3 等模型对比接口精度，并给出训练策略改进细节。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分5858 Inductive Bio 推出 AI 化学助手 Indy，称可将药物化学家产能翻倍
Inductive Bio 发布 AI 化学助手 Indy，面向其合作项目开放，公司称已在内部合作项目中使团队产能翻倍。Indy 可解析 CRO 报告、QC 剂量响应曲线、分析历史 SAR、运行生成化学算法、搭建 FEP 计算并生成项目汇报幻灯片，并接入 Inductive 的 ADMET 与 PK 模型。
推荐理由：Indy 在真实剂量响应曲线上的准确率对比通用大模型，展示了药化专用助手与通用模型的差距。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分6262 Inductive Bio 推出药化智能体 Indy，称数据质控准确率 89% 高于 Claude 与 GPT
Inductive Bio 发布小分子药化助手 Indy，内嵌于其 Compass 平台，可做剂量响应数据质控、FEP 提交、人体剂量预测与 SAR 幻灯片生成。
推荐理由：Inductive 公开其药化智能体 Indy 与 Claude、GPT 在数据质控和常规设计动作上的对照评测，可看判断力差距落在哪。
BioMap 百图生科精选AI 评分5858 百图生科联合弘星相和推出靶点评估智能体Gnosight
百图生科与弘星相和联合推出靶点评估智能体Gnosight，上线数月已完成近百个靶点的智能化评估筛选，并称已有依托其决策选择的创新靶点项目进入PCC阶段。该智能体结合百图生科xTrimo V4生命科学大模型与弘星相和的靶点及成药性评判经验，官方称单次评估约20分钟即可形成完整报告，目前对外开放使用申请。双方同时签署战略合作协议，聚焦创新药物研发上游的靶点选择与成药性评估环节。
推荐理由：百图生科与弘星相和把审评与立项经验嵌入靶点评估智能体，并披露了试用规模与后续管线进展。
力文所精选AI 评分5858 力文所发布 Lévin™ Harness 蛋白质设计 Agent 应用
力文所发布以 Agent 为核心的蛋白质设计智能应用 Lévin™ Harness，将数据、模型、插件工具、算力和工作流整合到同一工作区。该应用内置 Mol* 三维结构查看器，使分子结构进入 Agent 上下文，并以插件形式接入 AlphaFold、ProteinMPNN、Pallatom、RFantibody 等开源工具，自动完成下载、安装与调用。
推荐理由：该产品把结构查看、开源设计模型与工作流编排收进同一 Agent 工作区，可对照现有蛋白设计工具链的碎片化问题。
BioMap 百图生科精选AI 评分5858 百图生科提出虚拟细胞原生系统三层架构并披露 BioMap Cell OS 进展
百图生科在 2026 科学智能大会上首次系统提出虚拟细胞原生系统三层技术架构，并发布 BioMap Cell OS 的阶段性进展。三层分别为原生世界模型系统、原生数据进化系统和原生应用操作系统，后者将对虚拟细胞的操作抽象为 Initialize、Perturb、Evolve、Render、Compare、Uncertainty、Trace 和 Optimize 八类操作原语。
推荐理由：百图生科把虚拟细胞从单次扰动预测扩展为含世界模型、数据进化与操作原语的三层系统架构，可供观察其技术路线。
Mohammed AlQuraishi精选AI 评分7272 AlQuraishi 团队发布 OpenBind 系列首个模型 OpenBind-0，基于 OpenFold3 偏向小分子训练
Mohammed AlQuraishi 团队发布新系列 OpenBind 的首个模型 OpenBind-0，该模型基于 OpenFold3，并优先针对小分子进行训练。作者称 OB 系列模型将定期吸收 OpenBind 联盟与 PDB 的结构，持续更新并纳入 OpenFold 的最新功能。被引用的内容提到，OpenBind 计划收集数万条蛋白-配体结构与亲和力数据，此次同时发布 OpenBind-0 和 717 个新的配体结合结构。
推荐理由：OpenBind 系列首个模型基于 OpenFold3 并偏向小分子训练，可用于了解共折叠模型与结构数据收集的衔接方式。
Valence LabsAI 评分3030 Valence Labs 推出可合成化合物生成模型 Synflownet
Valence Labs 构建了 Synflownet，用于生成最可能具有所需活性的可合成化合物，以提升活性分子搜索效率。该模型针对可购买分子数量达数十亿、无法逐一评估的问题，定位为“锁匠”式生成工具，而非逐个匹配的评估模型。
Lantern PharmaAI 评分1818 Lantern Pharma 筹备 Open-Medicine AI 发布
正在为我们的 Open-Medicine AI 发布和规模化做准备。这是我们药物开发群体的重大需求。很高兴能参与这一极其重要的使命和发布。(http://www.open-medicine.ai)
AI4Protein精选AI 评分5858 临港实验室发布AI药物研发工作台元生·开物OriBench测试版
临港实验室发布AI药物研发工作台元生·开物OriBench测试版，整合基因组学、单细胞、蛋白质组学、结构生物学、化学信息学与药理毒理学等技能，支持固定流程、智能编排和自定义编排三种长任务执行模式。
推荐理由：临港实验室把靶点发现、组学分析与分子设计整合进同一工作台，并公开了与Claude Code的基准对比。
Vilya, Inc.精选AI 评分6565 Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-2，可建模化学多样性分子界面
Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-2，称其无需模板或共进化输入，通过扩散和单一统一原子表示解析多肽与靶点复合物。公司称该模型对非经典多肽达到亚埃级精度，并准确预测 Zolucatetide、Daraxonrasib、Icotrokinra 和 Enlicitide 与各自治疗性蛋白靶点的相互作用。
推荐理由：Vilya-2 以统一原子表示建模多肽与靶点复合物，为现有工具难以处理的非经典化学体系提供参照。
MindWalk / ImmunoPrecise AntibodiesAI 评分2020 MindWalk在AMD大会首次公开展示ReefIQ
MindWalk在旧金山AMD Advancing AI 2026大会上首次公开展示其面向AI药物发现的生物上下文层ReefIQ，运行于AMD Instinct平台。该演示被纳入AMD Instinct Demo Showcase四个定制演示短片之一，并配有通过AMD渠道分发的视频访谈。
ProfluentAI 评分4242 Profluent AI设计碱基编辑器平台
一套AI设计的碱基编辑器，全部源自同一骨架。每位患者唯一不同的部分只是向导RNA。 这就是AI带来的转变：罕见病从"一次一个药物"走向平台化，旨在降低成本、惠及更多患者。 下方是我们与GEMMABio合作、现获@ARPA_H的THRIVE项目支持的更多内容。
分子之心MoleculeMindAI 评分4242 分子之心MoleculeOS先锋伙伴体验计划开启：AI原生生物经济操作系统开放试用
分子之心开启MoleculeOS先锋伙伴共创体验计划，面向创新药研发、生物制造、合成生物学等领域开放浏览器接入试用。该系统以多模态蛋白质基础大模型NewOrigin（达尔文）与全原子结构预测模型MMFold为底层，可理解研发意图并自动编排结构预测、亲和力评估等任务。公司称典型抗体优化项目从序列分析到候选推荐由传统数天压缩至几分钟计算时间。
Simon Kohl精选AI 评分5858 Latent Labs 将抗体设计智能体 Latent-Y 上线平台，开放全球免费每日额度
Latent Labs 宣布抗体设计智能体 Latent-Y 即将上线 Latent Labs Platform，面向全球研究者开放并提供免费每日额度，其核心是首次向研究者开放的抗体设计生成模型 Latent-X2。
推荐理由：Latent Labs 将抗体设计智能体接入平台并开放免费额度，可了解其从自然语言到实验可用序列的产品化路径。
AurekaBio 寻明生科精选AI 评分7272 寻明生科开源全原子生物分子基座模型 OpenDDE
寻明生科于2026年7月7日发布并开源全原子生物分子基座模型 OpenDDE，将生物分子共折叠、结构推理与规模化法则纳入同一框架。
推荐理由：寻明生科开源全原子共折叠基座模型，抗体-抗原基准成绩与规模化趋势为评估开放结构模型提供参照。