清华大学团队在Nature Communications发表可解释AI引导的可降解脂质肝脏mRNA递送研究
清华大学深圳国际研究生院颜昊、康飞宇团队在Nature Communications发表研究，建立模块化合成、高通量筛选、可解释机器学习与动物验证的两阶段框架，从520种实验脂质扩展到10,920种虚拟候选，筛出可降解可电离脂质PA97MD101。
推荐理由：研究把可解释机器学习用于可降解脂质筛选，并用独立动物实验检验体外预测的边界。
#小分子生成
BioArt精选AI 评分7373 智药局精选AI 评分5858 Flagship 合并 Cellarity、Etiome、Empress 成立 AI 制药公司 Etcelera
Flagship Pioneering 于 10 月 29 日宣布整合 Cellarity、Etiome、Empress Therapeutics 三家公司的平台技术，成立新型药物发现公司 Etcelera，由 GSK 老将 Adrian Rawcliffe 任 CEO，莫德纳联合创始人 Noubar Afeyan 为联合创始人。
推荐理由：Flagship 将三家平台公司合并为 Etcelera，其细胞状态与扰动数据整合方式为观察 AI 制药平台组织提供了案例。
智药邦精选AI 评分7474 北京大学来鲁华团队在Nat Mach Intell发表SynCraft，用大语言模型引导分子精准编辑
北京大学来鲁华教授团队提出基于大语言模型的分子可合成性优化方法SynCraft，对难合成的高价值分子做最小图编辑而非从头生成，研究发表于Nature Machine Intelligence。
推荐理由：研究用大模型推理加最小图编辑挽救难合成分子，并给出与基线方法的量化对比和失败边界。
下一分子AI 评分3434 AI制药日报｜2026-10-29
原字节跳动Protenix核心成员肖文之团队开源生物分子基础模型Mol-1并公开39页技术报告，基于Protenix技术体系提升抗体、分子胶与多肽结构预测能力。晶泰科技自研肠道限制性高选择性pan-TRK抑制剂KQTD-126获FDA IND许可，临床前pan-TRK抑制活性IC₅₀＜1 nM，肠道组织与血液暴露量比值超过1000:1，拟用于IBS与IBD相关慢性肠道疼痛。
澪乃ゆいAI 评分5858 PartiDesign 发布：统一框架同时生成生物分子三维结构与序列
PartiDesign 被开发为同时设计结构与序列的生物分子设计模型，可在同一框架中处理蛋白质、RNA、DNA 和低分子。该模型支持指定结合部位、二级结构和化学键等条件，并同时生成三维结构以及序列与化学组成。作者称来源见回复，未在正文给出评测结果。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7474 Genesis 与 Caltech 提出离散扩散在线适应框架，分子优化用 86 次评估追平 Beam Search 约 5000 次评估表现
Genesis Molecular AI 与 Caltech 合作的 NeurIPS 2026 论文研究离散扩散分子生成模型在测试时如何分配算力，其在线适应框架仅用 86 次 oracle 评估即追平最强推理期搜索基线 Beam Search 约 5000 次评估的表现。
推荐理由：研究系统拆解在线适应式分子优化的四个设计选择，并给出何时值得用在线适应而非推理期搜索的判据。
Corin Wagen精选AI 评分5858 Corin Wagen 评 Rowan 自动生成合成中间体对 FEP 的改进
Corin Wagen 表示，自动生成合成中间体是 Rowan 已加入的体验改进之一，与自动扭转角重拟合、收敛检测等功能并列。他引用的 @manntis4 内容称，在测试小分子辅因子支持 FEP 时发现，把合成中间体配体加入 RBFE 图可改善与实验结合亲和力的相关性，示例为 KRAS-G12D。Wagen 认为稳健的智能体驱动 FEP 还需要更多此类能力。
推荐理由：Rowan 团队以 KRAS-G12D 为例说明合成中间体配体如何改善 RBFE 与实验亲和力的相关性，并列出自动化改进方向。
木可AI探索笔记精选AI 评分5858 17亿次实测 vs 一次造出10¹⁶个抗体：把AI制药"数据荒"卷成护城河的两种活法
文章对比Terray与Jura Bio两条自产数据路线：Terray用自研高通量硬件累计超过4200亿次测量、折算逾170亿个靶标-分子互作数据点，Jura Bio则用变分合成一次造出10¹⁶个抗体序列。作者认为两者分别拆解干湿循环的合成端与筛选端，Terray已签吉利德、BMS、Odyssey合作并预计2026年有内部药物进入临床试验，但数据规模本身不等于成药。
推荐理由：文章把Terray与Jura Bio两种自产数据路线放在干湿循环两端对照，便于理解数据瓶颈的不同解法。
Labiotech.euAI 评分3232 特发性肺纤维化新药进展：吸入曲前列尼尔数据与AI驱动药物rentosertib首个3期试验
特发性肺纤维化（IPF）领域多项在研新药进入2期和3期试验，其中Insilico Medicine的TNIK抑制剂rentosertib启动全球首个生成式AI驱动药物的3期研究，将在320名患者中评估每日一次给药52周的疗效与安全性。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分2525 HotSpot Therapeutics 将在 ACR Convergence 2026 展示小分子 IRF5 抑制剂 HST-2011 的临床前数据
HotSpot Therapeutics 宣布将在 2026 年 11 月 6-11 日于奥兰多举行的 ACR Convergence 2026 上以海报（编号 0146）展示小分子 IRF5 抑制剂 HST-2011 的临床前数据。
iNature同新闻AI 评分6262 香港大学贾伟团队开发MetLLM，从化学空间发现新型胆汁酸
香港大学贾伟团队在Cell Metabolism发表研究，提出基于Transformer的语言模型MetLLM，学习胆汁酸修饰模式以优先筛选候选胆汁酸类似物，并构建含3900个优先候选物的计算机模拟胆汁酸化学景观MetSpace。
晶泰科技精选AI 评分6868 晶泰科技自研 pan-TRK 抑制剂 KQTD-126 获 FDA 临床试验许可
晶泰科技宣布其自主研发的肠道限制性高选择性 pan-TRK 抑制剂 KQTD-126 获得美国 FDA 新药临床试验（IND）许可，计划近期开展临床试验。该候选药物面向肠易激综合征（IBS）及炎症性肠病（IBD）相关慢性肠道疼痛，临床前研究显示其 pan-TRK 抑制活性 IC₅₀＜1 nM，肠道组织与血液暴露量比值超过 1000:1。
推荐理由：晶泰自研 pan-TRK 抑制剂获 FDA 临床试验许可，披露了肠道限制性设计与临床前活性数据。
BioTender精选AI 评分6060 AISI与SecureBio用编程智能体复现ProteinMPNN、RFdiffusion3与CMD
英国AI安全研究所AISI与SecureBio合作的ReproBAIT预印本让Claude Opus 5、GPT-5.6 Sol、Kimi K3和Qwen3.8-2.4T四个编程智能体在提供训练数据与A10G GPU的条件下限时复现三个生物AI工具。
推荐理由：研究用编程智能体限时复现三个生物AI工具，给出闭源与开源工具可迁移性的具体边界。
DeepTech深科技AI 评分5050 AI设计抗癌药进入人体试验：122名患者接受治疗，部分脑转移病灶出现缩小
Iambic公布HER2小分子酪氨酸激酶抑制剂IAM1363的I/Ib期数据，截至2026年8月31日已有122名晚期实体瘤患者接受治疗，部分患者肿瘤缩小并出现脑转移病灶缓解。
望石智慧AI 评分3636 MolVortex大师班第1期：CBL-b别构抑制剂的Hit分子发现
望石智慧在MolVortex大师班第1期展示了其全栈式小分子早研智能体MolVortex完成CBL-b别构抑制剂Hit分子发现的流程。该智能体在数十分钟内检索10+个文献源及80+个专业数据库完成靶点调研，基于8GCY、8QTK、8QNG共晶结构识别别构口袋，参照8GCY结合模式与NX-1607共享药效团生成30个全新候选分子。
LeapFunAI 评分7070 Ginkgo Datapoints开放ReFRAME化合物库DRUG-seq数据，覆盖12,949种化合物
Ginkgo Datapoints旗下虚拟细胞药理学计划（VCPI）于2026年10月27日开放ReFRAME化合物库的DRUG-seq转录组数据，覆盖12,949种化合物，采用CC BY 4.0许可允许商用，注册免费账户即可获取。
BioArtAI 评分6565 Nature：Shokat团队提出双位点激酶抑制剂设计原则并开发PonatiLink-2
美国加州大学旧金山分校Kevan M. Shokat与Kevin Lou团队在Nature发表研究，以ABL1与EGFR为模型系统梳理双位点激酶抑制剂的设计原则，并据此开发出双位点ABL1抑制剂PonatiLink-2。
BioTender精选AI 评分7373 多伦多大学等提出SELECTBENCH，评测九种生成模型难区分目标与脱靶蛋白
多伦多大学、Mila 等机构提出 SELECTBENCH，将目标与脱靶蛋白同时纳入评价，评测九种结构驱动小分子生成模型的选择性。
推荐理由：该基准把目标与脱靶口袋同时纳入评测，揭示生成模型在相近蛋白上的选择性短板与阈值取舍。
AI药物设计实验室精选AI 评分7070 俄亥俄州立大学MADDIE多智能体药物发现系统：50个靶点各交付100个候选分子
俄亥俄州立大学Xia Ning团队提出MADDIE多智能体药物发现系统，由中央Orchestrator调度HitIdentifier、LeadOptimizer、Evaluator和Synthesizer四个专职智能体，在50个蛋白靶点上均交付100个满足对接评分、类药性、合成难度、毒性预测等计算阈值的候选分子。
推荐理由：论文用50个靶点的对照与消融，说明中央调度主要减少达到同一计算目标所需的搜索量。
DeepTech深科技精选AI 评分6060 前OpenAI科学副总裁创办Warp Sciences，融资2.15亿美元做机器人化学合成
前OpenAI科学副总裁凯文·韦尔联合创办的化学研发服务公司Warp Sciences结束隐身状态，宣布完成2.15亿美元融资，投后估值8.65亿美元，由Lightspeed Venture Partners领投，OpenAI首席财务官莎拉·弗莱尔和首席研究官陈信翰以个人身份参与。
推荐理由：报道呈现了机器人合成与按化合物计价的CRO模式，并点出成本与交付数据尚未披露这一关键边界。
智药邦精选AI 评分5858 Iambic上市：投资者究竟买模型还是买药
智药邦以Iambic于2026年10月14日公布IPO定价（每股16美元、发行937.5万股、预计募资1.5亿美元）为切口，分析AI药企的平台价值应如何被检验。文章梳理其与武田、艾伯维的合作付款结构，以及口服HER2小分子抑制剂IAM1363在Ⅰ/Ⅰb期试验中53名受试者19例部分缓解（约36%，含未确认缓解）的早期数据，认为近期应看具体药物与合作交付，长期才看技术能否反复产出新资产。
推荐理由：以Iambic上市为切口，拆解AI药企的平台价值如何经由候选药物、临床数据与合作付款被逐步检验。
动脉网AI 评分4040 智宠制药完成数千万元A1轮融资，以“端到端AI+比较医学”双轮驱动宠物药研发
智宠制药完成数千万元A1轮融资，由天汇资本领投、指数资本担任独家财务顾问，资金将用于加速核心管线临床推进与端到端AI药物研发平台建设。公司自研ChemoFetch小分子与OmniFetch大分子双引擎，已在抗感染、慢病、抗衰领域布局6条以上FIC/BIC潜力管线，多条管线进入临床II期。公司称宠物药从IND到NDA成功率有望从人药小分子的约10%提升至30%–50%区间。
Insilico Medicine 英矽智能AI 评分5353 英矽智能在 Chemistry42 逆合成中推出 ChemCensor 反应可行性评分
英矽智能在 Chemistry42 逆合成模块中推出 ChemCensor，用 0-5 分的基于先例的评分判断所提反应是否化学上可行，依据是相同反应中心、相同官能团兼容性以及有真实文献先例支持。该功能在首尔 ICML 2026 上介绍，公司称其并非模式匹配，而是将化学家逻辑系统化。
智药邦精选AI 评分6868 Recursion与赛诺菲合作首个候选药物被赛诺菲纳入开发管线
Recursion宣布，其与赛诺菲多项目合作中的首个开发候选药物已被赛诺菲行使选择权纳入开发管线，该潜在first-in-class双靶点口服小分子计划于2027年启动1期临床试验。
推荐理由：赛诺菲行使选择权纳入首个双靶点候选药物，呈现AI平台合作从设计到里程碑付款的转化路径。
iNatureAI 评分3434 南京医科大学赵杨/陆茵团队发现MEKK3驱动脑海绵状血管畸形进展，AI辅助设计抑制剂DPDH
南京医科大学赵杨、陆茵团队在Advanced Science发表研究，证实内皮细胞MEKK3启动脑海绵状血管畸形（CCMs）病灶形成，小胶质细胞MEKK3则通过MEKK3–NF-κB通路加剧病灶晚期进展。借助AI辅助药物设计与结构优化，团队获得强效MEKK3抑制剂DPDH，可恢复血管屏障完整性并抑制小胶质细胞活化及对受损内皮的吞噬。研究据此提出DPDH作为CCMs候选药物的潜力。
英矽智能AI 评分5050 英矽智能在ESMO 2026官网公布AI设计泛TEAD抑制剂ISM6331的1期首次人体试验摘要
英矽智能在ESMO 2026官网公布了口服泛TEAD抑制剂ISM6331针对间皮瘤及其他晚期实体瘤的1期首次人体试验摘要，详细及更新数据将于10月25日简短口头报告环节公布。
RecursionAI 评分3838 Recursion详解自动化DMTL化学平台
Recursion在平台系列第7篇中介绍其自动化化学平台：候选分子在计算机设计后直接进入自动化DMTL实验室，可规模化执行多步药物化学合成，并自动完成后处理、纯化与数字化样品追踪。其自研AI智能体还协助科学家规划高效合成路线；公司称因设计、合成、测试在同一集成系统内完成，消除了团队间数据交接的摩擦与时间损耗。
Alex ZhavoronkovAI 评分3030 英矽智能CEO评Citrini用Claude做药物设计
英矽智能CEO Alex Zhavoronkov 评价 Citrini Research 的 AI 药物设计尝试，认为其思路与团队 2019 年 GENTRL 的 Nature Biotech 论文相似，只是换成了 Claude。他指出真正的难点在小鼠、狗和猴研究，如今获得好的结合剂并不难，小分子领域更难，但投资机构能做出这样的尝试仍令人印象深刻。
Insilico Medicine 英矽智能AI 评分5858 英矽智能与施维雅肿瘤AI合作10个月达成早期药物发现里程碑
英矽智能宣布与施维雅（Servier）的AI驱动肿瘤合作在启动10个月后达成早期药物发现里程碑，并触发施维雅的里程碑付款。英矽智能称该合作结合其生成式AI能力与施维雅的临床经验，用于加速新型小分子疗法的发现，具体金额与资产未披露。
MIT Jameel Clinic · NewsAI 评分1818 芝加哥大学公布2026年Pritzker AI科学研究卓越奖得主：Kristin Persson与Barzilay、Collins团队
芝加哥大学将2026年Pritzker AI科学研究卓越奖授予Kristin Persson，以及Regina Barzilay与James J. Collins组成的团队，各获奖者奖金5万美元。
望石智慧AI 评分2222 相约2026物理AI与世界模型大会！望石智慧于多场行业大会全方位展示AI4S技术根基与产业化成果
望石智慧在2026物理AI与世界模型大会创新专区展示物理AI与世界模型成果，并同期在2026 AsiaBIO创新峰会·华南站、中国药学会智能药物专业委员会学术年会上分享小分子药物研发实践。
iNatureAI 评分3434 Cancer Res | 天津医科大学张真发等发现线粒体隔离cGAS削弱肺腺癌免疫
天津医科大学张真发等通过单细胞与空间转录组学分析CheckMate 816试验标本，发现新辅助化疗免疫治疗无应答肺腺癌中CHCHD3上调，其将cGAS螯合于线粒体、削弱STING信号。敲除CHCHD3可恢复CXCL5/CXCL1产生、减少M2样巨噬细胞并促进CD8+T细胞浸润；虚拟与功能药物筛选鉴定出小分子TN4510，在临床前模型中与化疗免疫治疗协同抑制肿瘤生长。
BioTender精选AI 评分6363 德睿智药与三生制药达成MDR-001最高17.5亿元商业化合作，口服GLP-1减肥药已进入中国Ⅲ期
德睿智药与三生制药旗下三生蔓迪、万晟医药就AI辅助设计的口服小分子GLP-1受体激动剂MDR-001达成最高17.5亿元商业化合作，德睿保留MAH持有人身份和全部知识产权，三生方面承接获批后中国内地、香港及澳门的全渠道独家推广与经销。
推荐理由：梳理德睿智药MDR-001商业化合作中17.5亿元付款的构成与披露边界，并对照Ⅱb期两种统计口径的减重数据。
英矽智能精选AI 评分6565 世界镇痛日｜生成式AI驱动非成瘾性候选药物研发
英矽智能在2026年世界镇痛日披露，其生成式AI平台Pharma.AI发现的靶点Target Z对应的口服小分子抑制剂ISM9528已于2026年7月提名为临床前候选化合物，用于疼痛管理。
推荐理由：英矽智能披露靶向新机制的口服非阿片类疼痛候选药物临床前数据，可与现有标准治疗作对照参考。
BioTender精选AI 评分7272 Leash Biosciences 发布 Minos 工作稿：用真实湿实验构建分子搜索环境评测 AI
Leash Biosciences 的 Minos 工作稿把预先完成的 DNA 编码化合物库实测结果封装成可反复查询的分子搜索环境，模型每局最多测试 100 个分子、每批最多 5 个。
推荐理由：工作稿把已完成的湿实验封装成可反复查询的分子搜索环境，并给出结构打乱与靶标遮蔽对照，便于理解评测边界。
医药魔方AI 评分5050 AI设计的药，能不能成为更好的药？
截至发文日，医药魔方NextPharma数据库收录1,541条涉及AI辅助开发或AI设计的药物管线，AI辅助新分子设计管线421条中临床前项目270条、约占64%。
智药邦同新闻AI 评分6262 Nature Reviews Drug Discovery对话OpenBind：以开放蛋白质-小分子数据填补AI药物发现缺口
《Nature Reviews Drug Discovery》发表科学记者Asher Mullard对牛津大学教授、OpenBind项目联合负责人Charlotte Deane的访谈，讨论AI为何尚未在小分子药物发现中复制AlphaFold的成功，核心判断是瓶颈已从模型转向数量充足、分布合理且同时包含结构与结合强度的数据。
同一新闻，精选展示《Nature Reviews Drug Discovery 访谈 OpenBind 负责人 Charlotte Deane：AI 药物发现的数据鸿沟如何填补》
Alex Zhavoronkov精选AI 评分6363 英矽智能PandaOmics发现靶点、Chemistry42设计出口服非阿片类镇痛候选ISM9528
英矽智能的Alex Zhavoronkov称，靶点由PandaOmics发现、分子由Chemistry42设计，得到口服非阿片类镇痛候选ISM9528。据@TheNationalNews报道，该候选在临床前模型中表现优于吗啡，更多信息见https://antipain.ai。
推荐理由：英矽智能以自家平台串联靶点发现与分子生成，给出候选分子的临床前阶段结果，可观察其平台到管线的衔接方式。
Insilico Medicine 英矽智能AI 评分3838 Chemistry42 推出类型化排除体积
🧪 #Chemistry42 全新 #FeatureFriday：类型化排除体积 排除体积并不新鲜，但类型化的排除体积是新的。现在你不仅能封锁某片空间区域，还能精确指定那里不允许出现什么：不许有芳香环、不许有氢键供体、不许有带正电的基团，随药物化学需求而定。 在这段短片中，我们用一个真实的 B-RAF 生长向量示例进行演示。 #PharmaAI #GenerativeChemistry
Labiotech.euAI 评分2020 13 家值得关注的 AI 药物发现公司
Labiotech 列出 13 家值得关注的 AI 药物发现公司，包括 BPGbio、Chai Discovery、Compugen、Cradle、Iktos。