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下一分子聚焦AI制药
只看虚拟细胞
9月10日周四
  1. 北京科学智能研究院AISI82

    北京科学智能研究院等团队在Nature发表蛋白质组虚拟细胞模型ProteinTalks

    北京科学智能研究院与西湖大学、北京大学、深势科技、哈尔滨医科大学等单位合作，在Nature发表基于NeuralODE框架的蛋白质组虚拟细胞模型ProteinTalks，用于预测药物响应与发现耐药线索。

    推荐理由：研究用时间分辨扰动蛋白质组训练动力学虚拟细胞，并给出药效预测与实验验证的完整链路。

9月1日周二
  1. BioMap 百图生科58

    百图生科提出虚拟细胞原生系统三层架构并披露 BioMap Cell OS 进展

    百图生科在 2026 科学智能大会上首次系统提出虚拟细胞原生系统三层技术架构，并发布 BioMap Cell OS 的阶段性进展。三层分别为原生世界模型系统、原生数据进化系统和原生应用操作系统，后者将对虚拟细胞的操作抽象为 Initialize、Perturb、Evolve、Render、Compare、Uncertainty、Trace 和 Optimize 八类操作原语。

    推荐理由：百图生科把虚拟细胞从单次扰动预测扩展为含世界模型、数据进化与操作原语的三层系统架构，可供观察其技术路线。

8月27日周四
  1. Valence Labs12

    Valence 谈细胞响应预测与多模态数据整合

    衡量细胞内部发生的变化有很多种方法。 单独来看，每种测量都是不完整的。综合起来，我们才能开始预测细胞响应、了解机制，并将这些发现跨细胞类型泛化。 遗憾的是，整合不同数据模态并不像听起来那么简单。 想了解更多，请看 Ali Denton 的 Valence at the Whiteboard。 🎥 完整视频链接见下方

8月26日周三
  1. Valence Labs 官网资讯62

    Valence Labs 作者运行 Boltz-2 一亿次，检验共折叠能否模拟细胞生物学

    Valence Labs 的 Dominique Beaini 用可抢占 GPU 对 9,000 个靶点与 50 万配体运行 AlphaFold-Multimer 和 Boltz-2 共折叠及亲和力预测，累计 1 亿次，构建名为 affinity-prints 的数据集，并借助 Recursion 的表型组学图谱检验预测相互作用与细胞实验数据的对应关系。

    推荐理由：作者用上亿次共折叠预测搭建亲和力指纹，并检验其与细胞表型数据的对应关系，为共折叠与虚拟细胞的衔接提供了一套可迁移的评测思路。

  2. Biohub · News74

    Biohub 用 AI 建模肿瘤细胞状态，在 DMG 小鼠中验证双药组合延长生存

    Biohub 与哥伦比亚大学等机构的研究者开发 AI 系统，用 ARACNe 与 VIPER/metaVIPER 从单细胞 RNA 测序数据中识别控制肿瘤细胞状态的 Master Regulators，发现同一瘤种的患者共享近乎相同的恶性细胞状态集合，相关结果发表于两篇 Nature Genetics 论文。

    推荐理由：两篇 Nature Genetics 论文用单细胞数据刻画肿瘤细胞状态，并在 DMG 模型中验证组合用药的协同生存获益。

8月12日周三
  1. Valence Labs 官网资讯58

    Valence Labs 回顾表型组学演进：从监督迁移学习到生成式基础模型

    Valence Labs 的 Inside Valence 文章梳理细胞表型组学从监督迁移学习走向自监督与生成式基础模型的路径，起点是 2019 年 Recursion 的 RxRx1 Kaggle 竞赛，该任务覆盖约 1,100 个 siRNA 条件、125,510 张图像，并在 50 多个实验批次中重复筛选。

    推荐理由：梳理细胞表型组学从监督迁移学习到生成式基础模型的演进，并说明RxRx3数据集在虚拟细胞研究中的支撑作用。

7月11日周六
7月10日周五
  1. NewLimit · Progress Blog68

    NewLimit 2026年5-6月进展：先导资产放大120倍、AI系统实现跨细胞类型泛化

    NewLimit 在2026年5-6月进展更新中称，其先导重编程药物已完成生产放大超过120倍，足以支持关键非临床研究，并计划明年进入临床。其AI系统Ambrosia首次实现跨细胞类型泛化，在预测内皮细胞重编程效果时用少于三分之一的实验数据达到与谱系专用模型相当的性能。公司还发现5个可恢复衰老内皮细胞年轻基因表达与再生潜力的重编程载荷，并完成C轮融资。

    推荐理由：NewLimit 披露先导资产放大生产与跨细胞类型泛化的进展，呈现重编程药物从发现走向临床前的具体路径。

7月9日周四
  1. Biohub · News48

    Biohub 年度回顾：蛋白质世界模型、激光相位板与患者驱动科研

    Biohub 发布基于下一代 ESM 的蛋白质生物学世界模型，可预测蛋白质折叠、相互作用与功能并设计新蛋白，科学家已用其设计抗体候选物，在针对癌症和免疫相关靶点的早期实验室测试中显示积极结果。该机构还与 UC Berkeley 团队合作推出全球首个电子显微镜激光相位板，并联合多家研究机构发起 Virtual Biology Initiative，以构建人类细胞的预测性虚拟模型。

6月16日周二
5月20日周三
  1. FutureHouse74

    FutureHouse在Nature发表Robin多智能体系统，用于干性年龄相关性黄斑变性药物重定位

    FutureHouse在Nature发表其首篇论文，介绍多智能体系统Robin，该系统将新假设生成与实验数据分析整合进同一连续工作流。研究团队将Robin用于干性年龄相关性黄斑变性，由其提出药物重定位假设并在实验室验证，包括在原代人视网膜色素上皮（RPE）干细胞中验证。

    推荐理由：该工作展示多智能体系统从假设生成到湿实验验证的完整链路，为AI驱动发现提供可参照案例。

5月13日周三
  1. Biohub · News58

    Biohub 资助 15 个团队构建免疫细胞重编程工具包

    Biohub 宣布支持 15 个研究项目，与合成生物学专家共同搭建免疫细胞工程的基础工具包，包括逻辑电路、合成受体、结合剂文库和传感平台。获资助团队包括 David Baker 团队设计可读取多种生物信号并作出响应的蛋白电路、James Collins 团队构建 RNA 分子电路、Wendell Lim 团队汇编传感器与逻辑电路模块目录。

    推荐理由：Biohub 公布 15 个免疫细胞重编程资助项目，展示合成生物学工具包的模块化分工与团队布局。

4月29日周三
4月3日周五
  2. Theodoris Lab82

    Theodoris Lab 发布时序 AI 模型 MaxToki，预测细胞状态轨迹与干预靶点

    Theodoris Lab 发布时序 AI 模型 MaxToki，用于生成动态轨迹中的过去、中间与未来细胞状态，并预测诱导目标状态转变的干预。模型基于近 1 万亿基因 token 训练，覆盖约 1.75 亿单细胞转录组和约 1 亿条跨人类一生的细胞状态轨迹，采用连续数值 tokenization 与两阶段训练（上下文长度从 4096 扩至 16384）。

    推荐理由：该模型把细胞状态建模扩展到时间轴，并在人源细胞与小鼠中验证了预测的促衰老靶点。

3月27日周五
  1. NewLimit · Progress Blog60

    NewLimit 2026年1-2月进展：首个候选药物进入规模化生产，多任务Ambrosia模型使发现效率提升逾2倍

    NewLimit 将其表观遗传重编程计划中首个候选药物推进至大规模生产，生产进度达20%，并新发现一个可在衰老肝细胞中恢复多种年轻功能的 payload。

    推荐理由：NewLimit 披露重编程 payload 进入规模化生产，并展示多任务模型与实验闭环将发现效率提升一倍以上。

3月18日周三
  1. Ginkgo Datapoints · Updates60

    VCPI 发布首个开源转录组数据集：在 THP-1 细胞中分析 2200 余种化合物

    虚拟细胞药理学倡议（VCPI）发布首个开源转录组数据集，在 THP-1 细胞中以 6 个剂量（0.03 至 10 µM）、24 小时处理约 2280 个小分子，采用阵列式 DRUG-seq 获得化合物特异的转录组谱。

    推荐理由：VCPI 首次公开约 2280 个小分子的 THP-1 转录组数据，为虚拟细胞药物响应模型提供可复用训练集。

2月3日周二
  1. insitro · Publications & Press72

    insitro 用 AI 从 MRI 推导棕色脂肪表型并完成首个 BAT 全基因组关联分析

    insitro 在 Keystone Symposia 肥胖治疗会议上报告，基于 UK Biobank 影像队列（n=69,598）的 Dixon MRI 脂肪信号分数图构建 AI 推导的棕色脂肪（BAT）表型，并完成首个 BAT 全基因组关联分析，识别 81 个独立遗传位点、精细定位到 45 个基因。

1月27日周二
1月15日周四
  1. Biohub · News38

    Shana Kelley：测量炎症的5种新方法

    Biohub正以工程化思路开发5种测量炎症的新方法，目标是在人体组织中实时观察免疫细胞活动。具体包括基于质谱的活组织蛋白质组与代谢组非侵入检测、可对免疫细胞基因做CRISPR扰动并读出影响的功基因组平台，以及用高通量T细胞/抗原筛选结合AI解码细胞识别、预测免疫细胞决策的Decoder工具。

1月9日周五
11月18日周二
  1. Ginkgo Datapoints · Updates58

    Ginkgo 推出虚拟细胞药理学计划 VCPI，将公开 10 万化合物 RNA 数据

    Ginkgo 于 11 月 18 日宣布发起虚拟细胞药理学计划 VCPI，以社区协作方式构建面向 AI 药物发现的虚拟细胞数据。该计划采用高通量阵列式 DRUG-seq 筛选，依托 10 亿美元自动化设施和标准化细胞系，并将公开 10 万个高质量化合物的 RNA 谱数据，具体化合物由社区投票选择。

    推荐理由：Ginkgo 以标准化细胞系和 DRUG-seq 构建虚拟细胞药理学数据，并公开征集化合物，为数据侧建设提供参照。

10月24日周五
  1. Cellarity74

    Cellarity在Science发表细胞状态矫正药物发现框架并公开单细胞扰动数据集

    Cellarity在Science发表论文，提出整合高通量转录组与AI模型的细胞状态矫正药物发现框架，采用实验室在环的深度学习迭代，称表型活性化合物回收率较行业标准方法提升13至17倍。公司同步公开三个单细胞数据集，其中扰动转录组数据集含逾1700个样本、126万个单细胞，可用于跨细胞类型药物响应映射与扰动预测方法基准测试。平台首个候选CLY-124正针对镰状细胞病开展1期临床试验。

    推荐理由：该框架把高通量转录组与主动学习闭环结合，并公开扰动数据集，为表型筛选的评测提供参照。

10月12日周六
9月29日周日
9月21日周六
9月18日周三
7月10日周三