BioEmu2 全流程教程与实测：微软开源全原子生物分子结构与动力学模型
作者在 Linux + conda + NVIDIA RTX 4080 SUPER 上实测微软 BioEmu2 全原子扩散模型，对腺苷酸激酶 ADK 和肌红蛋白各生成 8 个初始候选、从同一起点推进 4 条轨迹，每条 20 次、每次 50 ns，覆盖 1 μs 模型时间，80 个推进端点全部通过几何检查。
推荐理由：作者在单卡上实测微软 BioEmu2 的结构预测与时间推进流程，给出可复用的参数设置与耗时数据。
#开源/工具
BioAICraft精选AI 评分6060
途深智合AI 评分1818 途深智合邀您参加 BIO-Europe 2026｜11月9–11日，相约德国科隆
途深智合将参加11月9–11日在德国科隆举办的BIO-Europe 2026。其ToursynClaw大分子药物设计科学超智能体平台融合自研蛋白大模型、科学智能体与全自动机器人实验产线，公司称可实现约1.5个月完成抗体设计及功能实验验证，并在半年内推动16条抗体药管线完成PCC阶段验证。
机器之心 · AI4Science精选AI 评分6767 至知创新研究院发布分布式计算系统Tessera，在512张GPU上完成约3070万原子分子动力学计算
至知创新研究院在论文中提出分布式计算系统Tessera，基于E2Former V2架构的UBio-MolFM模型，在512张GPU上完成约3070万原子的完整能量与受力计算，单步耗时1.684秒，扩展效率89.7%。
推荐理由：该工作把多层等变机器学习力场扩展到数千万原子，并给出弱扩展效率与千万原子轨迹的结构统计对照。
DrugAIAI 评分3838 从NVL-655专利突破到分子设计：望石智慧MolVortex如何赋能ALK四代抑制剂研发
望石智慧以ALK第四代抑制剂为例，展示MolVortex药物研发智能体如何串联项目立项、专利分析、分子生成与成药性评价。在海思科专利WO2026219300的NVL-655 Fast Follow案例中，代表性化合物49-A的ALK G1202R/L1196M酶活性IC50为0.08 nM，食蟹猴AUC@3mpk达1605 ng*h/ml，小鼠药效试验21天抑瘤率107%。
BioAIDesignAI 评分4848 产品体验 | 从蛋白设计到干湿闭环，Sciland 如何构建自进化科研工作空间？
壹索智能推出的 Sciland AI 原生科研工作空间以课题内干湿闭环和跨项目自进化闭环组织蛋白设计、实验验证与经验复用。其技术报告称，在单张 NVIDIA H800 GPU 上，20 残基多肽从头设计与双模型结构复核端到端耗时 133.6 秒，227 残基抗体人源化与三维结构建模耗时 79.9 秒。
Lila SciencesAI 评分3636 Lila与Anyscale合作长上下文训练
了解更多我们与@anyscalecompute的合作！深入细节！
临港实验室精选AI 评分7272 临港实验室与上海人工智能实验室推出元生·自驱动实验室平台AutoLab
临港实验室与上海人工智能实验室联合推出基于OriBench的自驱动实验室平台AutoLab，打通从计算推演到实验验证的干湿闭环。平台融合OriGene智能体、实验室操作系统LabOS、具身智能与科研数据体系，各组件MCP工具化，设备经ADK套件与SCP-Lab协议接入后可被智能体调度复用。
推荐理由：平台把配方设计、自动制备与数据回流串成闭环，LNP实验展示了干湿迭代的具体路径。
望石智慧AI 评分3333 MolVortex大师班第2期：高效构效关系分析助力分子设计新路径
望石智慧在MolVortex大师班第2期展示其全栈式小分子早研智能体MolVortex针对CBL-b别构抑制剂的靶点调研与分子生成流程。该流程先做知识产权全景调研与专利解析，再自动抽取分子结构与活性数据并输出构效关系分析报告，随后以五种设计模式单批生成100个有效分子，并对接靶点口袋预测结合构象与结合打分。
BioAIDesign精选AI 评分5858 BioAIDesign 解析 pLDDT、ipTM 等结构预测评估指标并实操 foldmetrics
BioAIDesign 发布结构预测评估指南，逐层解释 pLDDT、PAE、pTM、ipTM、pDockQ、pDockQ2、ipSAE 与 LIS 等指标分别回答局部可信度、链间相对位置还是与参考结构的准确度，并指出 ipTM 0.9 不能换算成亲和力。
推荐理由：文章把结构预测的置信度、准确度与结合证据分层拆开，并给出可复用的汇总工具与判读顺序。
DrugAI精选AI 评分6868 浙江大学侯廷军团队发布PROTAC-DB 4.0，整合分子胶与XTAC并引入LLM问答
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0，将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由：该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库，并给出LLM加RAG的检索架构，可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
Sam RodriquesAI 评分4242 Kosmos助力Incyte靶点识别
AI正在改变药物靶点的识别方式。我们的合作伙伴之一Incyte Corporation已将Kosmos部署到其整个靶点识别流程中，用于评估候选靶点，这带来了显著的加速和更好的决策。我们今天发布了一篇关于与他们合作的案例研究。 Incyte极度拥抱AI，正在其整个体系中快速部署AI。他们做得非常出色，却没人谈论这件事。非常看好。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分6363 Google DeepMind 为 Antigravity 推出化学信息学技能，智能体一小时完成大环设计与合成路线
Google DeepMind 为 Google Antigravity 发布 Cheminformatics Skills，基于 RDKit 并接入 ChEMBL 与 PubChem，让语言模型负责流程编排、确定性化学工具执行分子计算。
推荐理由：官方演示了智能体在真实肺癌药物数据上完成检索、配对分析与大环设计，可观察化学工作流的自动化边界。
Open Targets · Blog精选AI 评分6767 Open Targets 发布 Mira 临床数据管线，整合 23 个来源增强平台临床试验证据
Open Targets 发布临床数据挖掘管线 Mira（Multi-source Indication & Report Analytics），整合 ClinicalTrials.gov、DailyMed、PMDA、EMA 等 23 个来源，在 26.09 版本产出 289,954 条临床报告、覆盖 13 个研发阶段。
推荐理由：介绍 Open Targets 新临床数据管线如何整合 23 个来源并重估靶点临床先例，可了解其数据口径与阶段映射变化。
Corin Wagen精选AI 评分5858 Corin Wagen 用约250美元算力在 Modal 完成无人工代码的分子模拟项目
Corin Wagen 称其最终项目在 Modal 上花费约250美元，且不涉及任何人工编写的代码。他随后发布完整写作，认为分子模拟正在发生变化，可以模拟更多体系并更具雄心，并附上关于羰基-烯烃复分解建模的博客链接。
推荐理由：作者以约250美元算力成本完成无人工编写代码的分子模拟项目，为评估自动化建模的可行性提供了一手参照。
Sergey OvchinnikovAI 评分4242 LocalFold 网站新增多个模型工具
https://localfold.org 已更新，新增： - bioemu2 @FrankNoeBerlin - mol1 @MolenceBio - fastplm（用于 esmfold fast 模型的置信度模块）@Logan_Hallee - af3x crosslinks @jankosinski - 更快的扩散（指数更新与几何噪声调度）@vinay_matt
天鹜科技AI 评分3838 晓鹜®平台minibinder从头设计教程：三条路线跑完PD-L1设计全流程
天鹜科技晓鹜®平台发布minibinder从头设计教程，以PD-L1为靶点演示RFdiffusion+ProteinMPNN、BindCraft、BoltzGen三条路线，用户通过提示词即可完成靶点调研、结构裁剪、骨架与序列生成及跨工具打分筛选。
LeapFun精选AI 评分5858 Claude驱动AI Agent自主完成小鼠脑内基因治疗注射实验
Exin Therapeutics联合创始人兼CEO Gabriel Ocana-Santero公开一项实验，由Claude驱动的AI Agent从19种候选基因治疗载体中选择方案，确定外侧内嗅皮层为注射靶区，并操控自建电动定位装置完成小鼠脑内注射，人类仅负责开颅缝合与审批。
推荐理由：该实验展示AI从方案选择到设备执行的连接方式，也暴露了自主实验的安全边界问题。
Absci精选AI 评分5858 Absci 的 Origin 抗体设计平台迁移至 AMD Instinct GPU，共折叠打分提速 3 倍
Absci 宣布其 Origin 抗体设计平台已运行在 AMD Instinct GPU 上，并将 AMD 开源 Triton kernels 集成进共折叠结合过滤工具 AbsciBind，在 AMD Instinct GPU 上相较生产基线取得 3 倍加速且输出质量无损失。
推荐理由：Absci 披露 Origin 平台在 AMD GPU 上的推理加速与集群部署，可作为抗体设计算力适配的参考。
医药魔方AI 评分4343 AI4S如何赋能药物研发？星使智算亮出国产化实践答卷
星使智算在CDHC·2026峰会上展示基于自主SPONGE分子动力学与PySCF量子化学引擎的Mokda分子研发工作站和AsterFire系列产品，实现从物理层到应用层的全链路自主。
Brian HieAI 评分5555 Evo 2 ICL 上线 Proto，可在浏览器中做上下文学习
Brian Hie 表示团队已将 Evo 2 ICL 部署到 Proto，覆盖 MCP 和 Proto 工具页面，用户可直接在网页浏览器中完成上下文学习。工具入口为 https://proto.evodesign.org/tools/evo2-icl。
药明康德AI 评分4444 药明康德TidesID®平台将复杂多肽代谢产物鉴定提速约30%，9个工作日交付
药明康德DMPK团队用自主开发的TidesID®一站式化合物鉴定平台，为一家全球药企完成复杂多肽代谢产物结构解析，9个工作日交付结果。该平台已迭代至2.0版本，覆盖多肽和寡核苷酸等复杂分子；据项目实践，整体MetID项目周转时间可缩短约30%。
Corin Wagen精选AI 评分5858 Corin Wagen 评 Rowan 自动生成合成中间体对 FEP 的改进
Corin Wagen 表示，自动生成合成中间体是 Rowan 已加入的体验改进之一，与自动扭转角重拟合、收敛检测等功能并列。他引用的 @manntis4 内容称，在测试小分子辅因子支持 FEP 时发现，把合成中间体配体加入 RBFE 图可改善与实验结合亲和力的相关性，示例为 KRAS-G12D。Wagen 认为稳健的智能体驱动 FEP 还需要更多此类能力。
推荐理由：Rowan 团队以 KRAS-G12D 为例说明合成中间体配体如何改善 RBFE 与实验亲和力的相关性，并列出自动化改进方向。
天鹜科技AI 评分3838 “长江杯”AI蛋白质设计挑战赛参赛指南：晓鹜®平台提供VHH与Minibinder全套设计工具并赠送10万积分
天鹜科技为“长江杯”全球AI蛋白质设计挑战赛参赛者提供MatwingsVenus®（晓鹜®）平台10万积分及晓鹜®Token平台100元Token券，覆盖VHH纳米抗体与Minibinder设计任务。
BigHat Biosciences精选AI 评分7272 BigHat 与 Anthropic 联合演示智能体驱动的抗体工程优化
BigHat Biosciences 与 Anthropic 发布联合演示，展示用前沿 AI 驱动可被智能体接入的快速反馈湿实验，加速抗体工程难题。BigHat 构建了 Agentic Lab Control Harness，将计算与实验工作流纳入同一控制平面，并称被 Anthropic 选为首个抗体治疗合作伙伴。
推荐理由：BigHat 与 Anthropic 联合演示智能体接入湿实验闭环优化抗体，提供人机团队协作的实验流程参照。
动脉网AI 评分3838 天津大学教授段学欣创办康沃思生物，用特声波技术为AI4S打造细胞操控“手脚”
天津大学教授段学欣创办的康沃思生物，基于GHz特声波MEMS芯片开发全自动细胞悬液制备、无标记细胞分选及HyperDrop皮升级活细胞打印系统，为AI for Science提供标准化细胞实验执行端与可追溯数据。
望石智慧AI 评分3636 MolVortex大师班第1期：CBL-b别构抑制剂的Hit分子发现
望石智慧在MolVortex大师班第1期展示了其全栈式小分子早研智能体MolVortex完成CBL-b别构抑制剂Hit分子发现的流程。该智能体在数十分钟内检索10+个文献源及80+个专业数据库完成靶点调研，基于8GCY、8QTK、8QNG共晶结构识别别构口袋，参照8GCY结合模式与NX-1607共享药效团生成30个全新候选分子。
奶牛猫的CADD实验室AI 评分5252 gmx_MMPBSA 1.7 系列更新：结构水、熵计算和突变扫描有哪些变化？
开源结合自由能计算工具 gmx_MMPBSA 发布 v1.7.1，与今年 9 月的 v1.7.0 共同扩展了结构水、熵估计和 AMBER 工作流支持。
途深智合AI 评分1818 途深智合邀您参加 BioPlus-Interphex Korea 2026｜10月28–30日，相约首尔
途深智合将参加10月28–30日在首尔举行的BioPlus-Interphex Korea 2026。其ToursynClaw大分子药物设计科学超智能体平台融合蛋白大模型、科学智能体与全自动机器人实验产线，公司称可实现约1.5个月完成抗体设计及功能实验验证，并在半年内推动16条抗体药管线完成PCC阶段验证。
Insilico Medicine 英矽智能AI 评分5353 英矽智能在 Chemistry42 逆合成中推出 ChemCensor 反应可行性评分
英矽智能在 Chemistry42 逆合成模块中推出 ChemCensor，用 0-5 分的基于先例的评分判断所提反应是否化学上可行，依据是相同反应中心、相同官能团兼容性以及有真实文献先例支持。该功能在首尔 ICML 2026 上介绍，公司称其并非模式匹配，而是将化学家逻辑系统化。
AI药物设计实验室精选AI 评分7373 上海人工智能实验室等提出 DrugHarness：亲和力比较准确率从 62.2% 升至 81.1%
上海人工智能实验室、中国药科大学等机构发布预印本 DrugHarness，将 80 多项科学工具的执行与带条件的技能学习整合到同一智能体系统中。加入冻结领域技能后，Qwen3.7-Max 在 MolBench 的亲和力比较准确率从 62.2% 升至 81.1%，优化成功率从 79.5% 升至 87.2%，但虚拟筛选 Hit@3 从 60% 降至 48%。
推荐理由：该预印本把智能体的工具执行与条件式技能学习结合，并给出基准与细胞实验的对照结果。
DrugAIAI 评分7676 谷歌推进AI agents与湿实验闭环：让AI从实验中学习，找到纳摩尔级蛋白结合分子
谷歌公布实验自动化框架VERID、适配体闭环发现和蛋白质结合分子设计三项进展，目标是让AI智能体在研究人员指导下运行实验并从结果中学习。VERID在开源PyLabRobot基础上建立实验工作站的语义数字孪生，提供状态查询、快速模拟、安全执行和完整记录四项能力。
GEN (基因工程与生物技术新闻)AI 评分2525 Asimov 利用 AI 智能体与生物基础模型自动化细胞系开发中的载体设计
Asimov 将生物基础模型、AI 智能体与合成生物学结合，为每个分子定制表达载体设计，并通过其计算机辅助遗传设计软件 Kernel 自动设计优化表达载体。案例显示，AI 设计的载体优于 Asimov 此前最佳设计，快速稳定池数据改变了合作方推进多特异性先导分子的选择，模型还可预测链比例以改善正确配对且不降低滴度。
奶牛猫的CADD实验室AI 评分7676 David Baker 团队开源蛋白设计工作流框架 Chaperone
David Baker 团队于 10 月 20 日在 bioRxiv 发布预印本，开源蛋白设计工作流框架 Chaperone，提供超过 80 个已注册模块，覆盖蛋白骨架生成、序列设计、结构预测与评分。
Frank NoéAI 评分1717 微软BioEmu2开启公开预览
加入我们在欧盟或英国的团队！ https://aka.ms/bioemu_job
RecursionAI 评分3838 Recursion详解自动化DMTL化学平台
Recursion在平台系列第7篇中介绍其自动化化学平台：候选分子在计算机设计后直接进入自动化DMTL实验室，可规模化执行多步药物化学合成，并自动完成后处理、纯化与数字化样品追踪。其自研AI智能体还协助科学家规划高效合成路线；公司称因设计、合成、测试在同一集成系统内完成，消除了团队间数据交接的摩擦与时间损耗。
智药邦AI 评分7878 谷歌推进AI agents与湿实验闭环：让AI从实验中学习，找到纳摩尔级蛋白结合分子
谷歌于2026年10月16日公布实验自动化、适配体闭环发现和蛋白质结合分子设计三项研究进展，目标是让AI智能体在研究人员指导下运行实验并从结果中学习。VERID框架在开源PyLabRobot基础上建立实验工作站的语义数字孪生，跟踪空间位置、试剂身份、液体体积和吸头库存，提供状态查询、快速模拟、安全执行和完整记录四项能力。
DeepTech深科技精选AI 评分6262 Google也在推进自主湿实验室，已实现智能体与机器人闭环
Google 于 10 月 16 日发布技术博客，介绍其搭建自主湿实验室的进展：团队希望让 AI 智能体设计分子、安排实验、分析结果并据此调整下一轮方案，其中一项研究已找到能紧密结合实体瘤相关靶点的蛋白质分子，但机器人操作、分子筛选和蛋白质设计三项研究尚未全部打通。
推荐理由：Google 公布自主湿实验室进展，可与 Anthropic、OpenAI 的同类布局对照，看清 AI 进入实验台的不同路径。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分6060 Google 推出 Antigravity 智能体工作台，用 ProtNLM 挖掘抗菌肽候选
Google 发布智能体科研工作台 Google Antigravity，并用它从 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一个预测对呼吸道感染病原体有活性的新型抗菌肽候选，该先导物正在接受湿实验验证。
推荐理由：展示智能体工作台如何把跨库检索、功能注释与结构查看串成一次会话，为抗菌肽早期发现提供可迁移流程。
BioTender精选AI 评分6767 从设计分子到操作机器人，Google 正在构建自主生物实验室
Google Research 于 2026 年 10 月 16 日公布三项研究，分别用智能体闭环设计 DNA 适配体、设计蛋白结合物，以及用 VERID 数字孪生约束实验机器人操作。
推荐理由：梳理 Google 三项研究如何让智能体接受实验反馈与物理约束检验，并划清已验证与未整合的边界。
Leo ZangAI 评分5050 MBZUAI 发布 198 件可仿真化学实验仪器资产
MBZUAI 发布 ChemLab-Assets，包含 198 件可仿真的化学实验仪器，每件均带部件级几何、可动关节、可执行行为模型及记录数值含义与来源的契约。全部仪器已通过 Matterix 框架转换为 USD 并导入 NVIDIA Isaac Lab，关节由运行时状态驱动，场景中按下面板按钮可传至运行时。