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5月7日周四
4月29日周三
4月20日周一
  1. Yang Zhang Lab58

    新加坡国立大学团队发布配对蛋白语言模型PPLM,可预测蛋白互作与结合界面

    新加坡国立大学研究人员开发配对蛋白语言模型PPLM,同时从两条相互作用蛋白中学习,用于预测蛋白互作、结合强度与相互作用界面。该模型面向蛋白互作这一细胞过程基础问题,团队称其可为疾病研究与药物发现提供新线索。

    推荐理由:该模型同时读取两条相互作用蛋白序列,为蛋白互作、结合强度与界面的统一预测提供新思路。

4月8日周三
  1. ByteDance AML AI4Science Team — Protenix72

    字节 Protenix 发布 v2.0.0:464M 参数 Protenix-v2 模型上线

    字节跳动 AML AI4Science 团队发布 Protenix-v2,这是一个 464M 参数的增强容量结构预测模型,称在挑战性抗体-抗原复合物结构预测上精度显著提升,并更新了配体相关合理性。

    推荐理由:Protenix-v2 在抗体-抗原复合物结构预测上给出与 v1 的对照结果,并公开技术报告与基准细节。

4月3日周五
  1. Theodoris Lab82

    Theodoris Lab 发布时序 AI 模型 MaxToki,预测细胞状态轨迹与干预靶点

    Theodoris Lab 发布时序 AI 模型 MaxToki,用于生成动态轨迹中的过去、中间与未来细胞状态,并预测诱导目标状态转变的干预。模型基于近 1 万亿基因 token 训练,覆盖约 1.75 亿单细胞转录组和约 1 亿条跨人类一生的细胞状态轨迹,采用连续数值 tokenization 与两阶段训练(上下文长度从 4096 扩至 16384)。

    推荐理由:该模型把细胞状态建模扩展到时间轴,并在人源细胞与小鼠中验证了预测的促衰老靶点。

3月27日周五
  1. NewLimit · Progress Blog60

    NewLimit 2026年1-2月进展:首个候选药物进入规模化生产,多任务Ambrosia模型使发现效率提升逾2倍

    NewLimit 将其表观遗传重编程计划中首个候选药物推进至大规模生产,生产进度达20%,并新发现一个可在衰老肝细胞中恢复多种年轻功能的 payload。

    推荐理由:NewLimit 披露重编程 payload 进入规模化生产,并展示多任务模型与实验闭环将发现效率提升一倍以上。

3月17日周二
1月12日周一
  1. NVIDIA Healthcare & BioNeMo72

    NVIDIA 扩展 BioNeMo 平台,礼来与 Thermo Fisher 等接入 AI 药物发现生态

    NVIDIA 宣布扩展开放开发平台 BioNeMo,新增 Clara 开放模型中的 RNAPro(RNA 结构预测)与 ReaSyn v2(确保 AI 设计药物可合成),并推出 BioNeMo Recipes 与 GPU 加速化学信息学库 nvMolKit。

    推荐理由:BioNeMo 扩展出 RNA 结构预测与可合成性模型,并接入礼来、Thermo Fisher 的实验室闭环,呈现平台化路径。

1月8日周四
  1. Vilya, Inc.70

    Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-1,用于大环结构预测与设计

    Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-1,专门建模含非天然氨基酸等多样化学的大环结构。公司称在公开与内部大环晶体结构合并基准上,Vilya-1 恢复晶体构象的表现超过次优方法一倍以上,物理与规则方法恢复的构象不到其一半,深度学习方法更落后。Vilya-1 还可微调用于富集可渗透化合物,并生成构象集合以评估能量景观、筛选结合剂;公司表示已在多个内部项目中应用该模型。

    推荐理由:Vilya-1 以全原子模型覆盖非天然化学的大环结构预测,并给出与物理规则及深度学习方法的具体对比。

12月16日周二
  1. Latent Labs58

    Latent Labs 发布 Latent-X2:AI 生成抗体具备类药可开发性与低免疫原性

    Latent Labs 在 Latent-X1 发布 5 个月后推出 Latent-X2,称其 AI 生成抗体在人体样本中表现出类药可开发性和低免疫原性,且为零样本生成。该模型目前面向部分合作伙伴开放使用,公司未披露具体实验数据与评测细节。

    推荐理由:Latent Labs 公布从 Latent-X1 到 Latent-X2 的迭代,并给出 AI 生成抗体在可开发性与免疫原性上的自述结果。

12月4日周四
  1. Baker Lab · IPD (蛋白质设计研究所)88

    Baker Lab 发布 RFdiffusion2:以提示直接生成高效酶

    Baker Lab 报告开发 RFdiffusion2,可直接以活性位点原子排布为输入生成酶,无需实验室优化即具备催化活性。在 Nature Methods 研究的计算基准中,该模型解决 41 项酶设计挑战中的 41 项,此前最佳工具为 16 项。

    推荐理由:RFdiffusion2 以活性位点结构为输入直接生成酶,并在计算基准中解决全部 41 项设计挑战,为酶设计提供了新的可复用工具。

11月19日周三
  1. Nabla Bio65

    Nabla Bio 发布 JAM-2 抗体设计模型,称可从计算机直接生成成药级抗体

    Nabla Bio 发布 JAM-2,称其为首个能从计算机直接生成成药级抗体的 AI 模型。公司称在 26 个靶点中有一半在每靶点测试少于 45 个设计的情况下获得皮摩尔至个位数纳摩尔级结合剂,直接针对细胞表面 GPCR 的结合剂成功率最高达 11%,超过 50% 的设计在零优化下通过核心行业可开发性标准,并称已与多家大型药企合作部署 JAM-2。上述结果来自公司自述与白皮书,尚未见独立验证。

    推荐理由:Nabla Bio 公布 JAM-2 在 26 个靶点上的抗体设计成功率与可开发性数据,可供对照评估从头抗体设计的能力边界。

4月14日周一
11月12日周二
  1. A-Alpha Bio 官网资讯78

    A-Alpha Bio 发布 AlphaBind 抗体优化模型并公开预训练权重

    A-Alpha Bio 发布 AlphaBind 抗体优化模型,基于约 750 万条抗体-抗原结合数据预训练,在四个抗体-抗原体系中仅用一轮实验室数据生成数千个高亲和力变体。BLI 验证的 10 个候选(最多 11 个突变)全部表达且结合力优于亲本抗体;模型以 MIT 许可开源,代码与微调数据已公开。公司称该模型已用于管线与合作的抗体发现,并计划推出 AlphaBind2。

9月29日周日
9月21日周六