AI制药的新赛段，不是更大的模型，是会自进化的微观世界模型？
DeepTech深科技以百奥几何为例，讨论AI制药竞争从模型预测能力转向真实研发交付，核心是其提出的“自进化微观世界模型”，连接分子设计、细胞响应与自动化实验。
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智药局精选AI 评分5858 UCB 与 Cradle 达成战略合作，将 AI 蛋白质工程平台用于数字抗体发现
比利时药企 UCB 于 11 月 4 日宣布与 Cradle 达成战略合作，在药物发现项目中引入其 AI 蛋白质工程平台，覆盖候选分子生成、先导优化与临床前开发准备环节，具体金额、期限和项目数量未披露。
推荐理由：UCB 引入 Cradle 平台做数字抗体发现，可对照其此前与晶泰科技的结构预测合作看药企 AI 布局差异。
New Market Pitch精选AI 评分5858 哪些 AI 蛋白设计初创公司已有药物进入临床试验
NewMarketPitch 梳理认为，Generate:Biomedicines、Absci、BigHat Biosciences 和 iBio 是已有可识别 AI 设计药物进入人体试验的 AI 蛋白设计公司，四家合计至少 8 个候选药物进入过人体评估，但仅 Generate 的哮喘抗体 GB-0895 进入 3 期。
推荐理由：梳理四家 AI 蛋白设计公司已进入人体试验的候选药物，并区分临床阶段与疗效证据的强弱。
A-Alpha Bio 官网资讯AI 评分7272 A-Alpha Bio 联合 GSK、Boltz、Cradle、Dyno 发起 Atlas 数据联盟
A-Alpha Bio 于 7 月公开启动 Atlas Data Consortium，创始成员包括 GSK、Boltz、Cradle 和 Dyno Therapeutics，成员每季度各设计一个含 100 万条蛋白-蛋白亲和力测量的 Data Block，由 A-Alpha 在 AlphaSeq 平台上统一生成后按非独占许可共享给全体成员。
A-Alpha Bio 官网资讯精选AI 评分7272 A-Alpha Bio 发起 Atlas Consortium 数据联盟，GSK、Boltz、Cradle、Dyno Therapeutics 为首批成员
A-Alpha Bio 宣布成立 Atlas Consortium，首批五家创始成员包括 GSK、Boltz、Cradle 和 Dyno Therapeutics，以订阅制按季度设计并共享标准化抗体抗原实验数据。
推荐理由：该联盟以订阅制汇集标准化抗体抗原实验数据，为AI抗体设计提供可比的亲和力与结构训练资源。
Cradle Bio Blog精选AI 评分6767 AI 如何改变抗体优化的第一轮：Cradle 七个多样化campaign的实测
Cradle 在七个抗体多样化campaign中，用基于进化序列数据训练的模型生成每个携带2-8个突变的多突变变体库，设计变体的结合保留率为56%-92%，其中四个campaign在未针对亲和力优化的情况下出现2倍至350倍亲和力提升。
推荐理由：Cradle 用七个抗体多样化campaign的实测数据，对比单点扫描与多突变首轮的取舍，给出首轮实验设计的具体参照。
Cradle Bio BlogAI 评分4646 Cradle 推出 Guided Rounds：将蛋白质工程轮次最佳实践内置到平台
Cradle 发布 Guided Rounds，把运行机器学习引导蛋白质工程轮次的最佳实践内置到平台，用户输入蛋白类型、是否有实验数据及设计或筛选目标后即可获得默认配置与分步引导。该功能今日面向所有用户上线，覆盖用户最常运行的轮次类型，并可视化数据集、模型训练、设计与审核之间的决策路径以提升可追溯性。需要逐参数控制的科学家仍可自行配置单项任务，计算科学家也可通过 API 扩展自有预测器与评分。
Cradle Bio Blog精选AI 评分6767 Cradle 展示零样本抗体多样化：七组实验与单突变扫描基线对比
Cradle 汇总其零样本抗体多样化流程在 SARS-CoV-2 RBD、HER2 和 EGFR 上的七组实验，其中 4/7 实验、2/3 靶点出现显著亲和力提升，弱结合剂 Ty2 的 KD 改善达 350 倍。
推荐理由：Cradle 汇总七组零样本抗体多样化实验，给出功能率与亲和力提升幅度，并对照文献单突变扫描基线。
Cradle Bio Blog精选AI 评分6262 Lundbeck 与 Cradle 合作，用 AI 蛋白设计平台优化脑病抗体疗法
Lundbeck 与 Cradle 宣布合作，将部署 Cradle 的 AI 蛋白设计平台，用于发现和优化针对脑部疾病的生物疗法，初期推进两个靶向 CNS 疾病的抗体项目。
推荐理由：Cradle 与 Lundbeck 签约，把生成式蛋白设计接入两条 CNS 抗体项目，并形成实验回流的迭代闭环。
Cradle Bio Blog精选AI 评分5858 Cradle与UC Berkeley Keasling实验室合作，用机器学习优化酵母生产疫苗佐剂QS-21的酶
Cradle与UC Berkeley Keasling实验室合作，将机器学习嵌入酵母生产疫苗佐剂QS-21的酶优化流程。该实验室2024年在Nature报告用38个植物基因使酵母从简单糖类合成QS-21，但产量远低于商业化水平。
推荐理由：案例展示机器学习如何嵌入植物酶优化流程，为替代植物提取的合成生物制造提供可迁移路径。
Cradle Bio BlogAI 评分4242 Cradle Bio 用桑基图可视化多属性蛋白质优化中的权衡
Cradle Bio 将桑基图用作多属性蛋白质生成项目的核心可视化，展示序列在活性、表达、稳定性、安全性和可开发性等约束下的通过或失败流向，以定位设计瓶颈。这些结果均为预测，序列尚未合成或经湿实验验证。两个虚构示例中，将次要安全性约束放宽约10%后序列流量打开；在抗体案例中放宽次要疏水性约束后，主要活性从起始模板的1.5倍提升至2.7倍。