Nature研究构建随机背景基线,量化配体优化中的效力与PK权衡
《Nature》2026年发表的这项研究针对6个靶点的18个先导化合物系统合成257个单原子水平类似物,发现11.3%的类似物效力提升至少10倍(95%置信区间7.5%–15.2%),但41.4%的类似物在肝微粒体稳定性、血浆游离分数或膜通透性中至少一项恶化超过3倍。
推荐理由:研究用257个单原子类似物建立配体优化的随机背景,量化效力提升与PK恶化的权衡。
《Nature》2026年发表的这项研究针对6个靶点的18个先导化合物系统合成257个单原子水平类似物,发现11.3%的类似物效力提升至少10倍(95%置信区间7.5%–15.2%),但41.4%的类似物在肝微粒体稳定性、血浆游离分数或膜通透性中至少一项恶化超过3倍。
推荐理由:研究用257个单原子类似物建立配体优化的随机背景,量化效力提升与PK恶化的权衡。
深势科技AI算法负责人高志锋在清华大学专场以《AI4S:重新理解科学发现》为题,分享团队从分子预训练大模型Uni-Mol到科研智能体SpecXMaster、再到材料产线的三段实践。
Isomorphic Labs 推出药物设计引擎 IsoDDE,称其可覆盖从小分子到复杂生物药的多模态药物空间。推文以保守估计的小分子化学搜索空间约 10^60 作对比,称可观测宇宙恒星数量仅约 10^22 至 10^24。公司称该引擎使其具备在这一空间中导航的能力,但未披露具体方法、验证结果或实验数据。
望石智慧在2026华为全联接大会展出全栈式医药早研智能体MolVortex与AI 3D分子生成平台MolVado,并获“2026年度华为全球卓越伙伴表彰——技术突破奖”。其与广药集团、华为联合打造的AI药研方案基于国产算力,两周完成POC验证、3个月落地,经华为算力优化后平台性能相较同类方案提升1.08倍。公司称已整合超400万条复合物数据,为PDB公开数据库的40倍。
德睿智药于2026年9月18日发布生命科学基座模型体系Intera,并公布首个模型InteraFold-Chem的技术报告,该模型聚焦蛋白质与小分子的结合构象预测。
推荐理由:德睿智药公布InteraFold-Chem在445个测试样本上的结合构象预测成功率,并给出与Protenix-v2、Chai-1、Boltz-2的对照结果。
成都先导通过香港全资子公司HitGen (HK) Ltd.与奥博资本亚洲基金、LAV、盘古资本等共同投资肿瘤领域新型小分子药物企业Connexus,Connexus同步完成A轮融资。成都先导以分阶段技术授权形式获取Connexus创始股权,后者将自建团队独立运营并承接新药项目后续开发,其在研项目均处于临床前阶段。
Inductive Bio 发布 Beacon-2,这是对 Beacon 系列模型的重大更新,可在 ADMET 之外直接从化学结构预测分子的有效人体剂量,由 ADMET-PK、效力与 PK/PD 三个可配置模块组成。
推荐理由:Beacon-2 把人体有效剂量作为可计算目标,并用 Indy 智能体的对照实验展示只优化效力会出现的偏差。
Inductive Bio 发布 AI 化学助手 Indy,面向其合作项目开放,公司称已在内部合作项目中使团队产能翻倍。Indy 可解析 CRO 报告、QC 剂量响应曲线、分析历史 SAR、运行生成化学算法、搭建 FEP 计算并生成项目汇报幻灯片,并接入 Inductive 的 ADMET 与 PK 模型。
推荐理由:Indy 在真实剂量响应曲线上的准确率对比通用大模型,展示了药化专用助手与通用模型的差距。
Inductive Bio 发布小分子药化助手 Indy,内嵌于其 Compass 平台,可做剂量响应数据质控、FEP 提交、人体剂量预测与 SAR 幻灯片生成。
推荐理由:Inductive 公开其药化智能体 Indy 与 Claude、GPT 在数据质控和常规设计动作上的对照评测,可看判断力差距落在哪。
深势科技发布药物分子专利解析智能体PharmMaster·Patent,基于文档解析引擎Uni-Parser 1.4,可从专利PDF中提取分子结构并关联活性数据、实验条件与权利要求,每条结论保留来源页码可回溯原文。
推荐理由:该工具把专利中的分子结构、活性数据与权利要求关联成可核验记录,展示了跨页证据整理的具体做法。
唯信计算与沐曦股份围绕AI制药与生命科学计算深化合作,基于WeMol平台、沐曦GPU及MXMACA软件栈完成联合运行环境建设。BoltzGen、Boltz-2、GROMACS分子动力学模块、OpenDDE及沐曦自研MetaxFEP自由能微扰引擎均已集成至WeMol并正式运行,覆盖生成式分子设计、结构与结合亲和力预测、分子动力学模拟及自由能计算等任务。
Inductive Bio 随 OpenAI Rosalind Workbench 发布,将其 ADMET 模型接入 OpenAI 生态(含 ChatGPT、Codex 与 Rosalind Workbench);此前 6 月已作为 Claude Science 生态伙伴进入 Claude,本月早些时候通过 ModelHub 进入 Benchling。
推荐理由:Inductive Bio 的 ADMET 模型接入三家主流平台,展示了化学预测模型嵌入现有科研软件栈的分发路径。
北大药学院与望石智慧联合建设的“AI赋能新药创制平台”入选北京市首批人工智能赋能科学研究典型案例,是唯一“AI+医药研发”领域高价值场景标杆应用。平台覆盖疾病靶点智能识别、分子逆向生成、多步合成路线规划与细胞药效高通量预测等环节,并面向医药研发机构开放药物智能设计工具。双方此前已共建联合实验室,2025年联合申报的“智慧药物研发北京市重点实验室”获评北京市重点实验室。
Valence Labs 介绍其置信度预测新工作,用于判断药物分子预测结果中哪些可信、哪些需回实验室补数据。推文指出生成式AI模型很少按已有证据校准置信度,在药物发现中这种虚假自信会浪费时间和资金。视频由 Tristan 讲解。
Valence Labs 构建了 Synflownet,用于生成最可能具有所需活性的可合成化合物,以提升活性分子搜索效率。该模型针对可购买分子数量达数十亿、无法逐一评估的问题,定位为“锁匠”式生成工具,而非逐个匹配的评估模型。
📄片段筛选数据使用的新建议来了。 该白皮书总结了关于片段筛选、从命中到先导化合物及先导化合物优化研究中结构生物学数据存储与复用的社区指导意见。 ⬇️在此阅读⬇️ https://cdn.rcsb.org/wwpdb/docs/documentation/Frag-screen-data-White-paper-08112026.pdf
望石智慧CEO周杰龙在AI FOR PHARMA 2026峰会上表示,公司以微观世界模型为底座,将物理规律、分子生成与效果预测统筹到同一模型体系,从底层解释分子与靶点作用机制。其与齐鲁制药合作完成超6000个分子筛选与聚类分析,合成两款全新衍生物,产出活性优异、选择性突出的潜在先导化合物。公司称该平台覆盖从靶点发现到PCC各环节,已沉淀十余条自研管线,部分进入临床试验阶段。
望石智慧创始人兼CEO周杰龙在2026中国科创投资夏季峰会上称,AI4S护城河来自人才、数据、生态三重叠加,公司正搭建覆盖电子、原子到分子的跨尺度微观分子世界模型。公司携多模态AI 3D分子生成平台MolVado与全栈式医药早研智能体MolVortex亮相展会与路演,并提及此前与华为、广药集团的“算力+模型+场景”三方合作。
当一个想法变成可用工具、多个团队几乎同时着手攻克它时,真是太酷了。开放 smiles 到 IUPAC 的翻译曾缺失了一段时间,而在两周内 @adrian_mirza_ 和 @NicholasRuncie 各自独立发布了相关工具。 这里的推动者是编码智能体!
望石智慧在首届医药协同创新大会上获授牌,成为“海淀智药创新7S加速营-AI4DD一站式公共服务平台”首批全球创新合伙人。公司将向平台开放靶点验证、分子设计、筛选评估等端到端AIDD能力,平台覆盖新药研发全链条七大板块的30个关键环节。其多模态AI 3D分子生成模型Lingo3Dmol阳参复现率已从超33%优化至超60%。
望石智慧在BIO 2026国际大会期间与医药魔方围绕「中国创新走向世界」展开对话,并展出小分子药物研发技术平台及智能体产品。公司介绍AI 3D分子生成平台MolVado融合大语言模型与几何深度学习、依托电子云密度数据实现3D分子生成,全栈式早研智能体MolVortex可自主拆解任务、调度工具并联动湿实验室形成干湿闭环。
予路乾行为一家海外生物技术公司完成DYRK1B选择性抑制剂项目,6个月内设计并合成20个化合物,交付IC50小于5nM、对DYRK1A选择性指数近20倍的分子。
推荐理由:项目展示了用分子动力学捕捉同源激酶动态构象差异、指导选择性设计的可复用路径。
Latent Labs 宣布药物设计智能体 Latent-Y 向全球研究者开放,获批研究者每天可免费获得 250 个设计。公司同时公布早期访问研究者的首批实验室结果,包括阻断离子通道的分子、在体内杀伤肿瘤细胞的 CAR-T 细胞,以及疟原虫难以通过突变逃逸的结合剂。
推荐理由:Latent Labs 开放其药物设计智能体 Latent-Y,并给出早期用户离子通道抑制剂与 CAR-T 的实验室结果。
BioAge启动口服小分子NLRP3抑制剂BGE-102的II期概念验证试验QUELL-CV并完成首例受试者给药,该药苗头化合物由成都先导DEL技术平台筛选获得。
推荐理由:DEL筛选获得的NLRP3抑制剂进入II期给药,呈现从苗头化合物到临床推进的合作路径。
Inductive Bio 在 OpenADMET 的 PXR Blind Challenge 中排名第一,击败来自大型药企、生物技术公司、学术机构和 AI 组织的 350 多名研究者。
推荐理由:Inductive Bio 在 PXR 盲测挑战中夺冠,可与该公司连续三次盲测成绩及 ADMET 建模的真实条件评测对照阅读。
@nebiusai Discovery Awards 2026 圆满成功。🏆 我们很高兴地分享,Gero 凭借我们的 ProtoBind 平台获得了荣誉提名,该平台是一个可直接从蛋白质序列进行小分子设计的生成式 AI 模型,在我们所在类别中跻身前 10 个项目。
Genesis Molecular AI 首次披露其智能体药物设计系统 Sapphire,该系统构建于其分子基础模型之上,可全天候自主迭代候选药物,对2D化学结构与3D分子构象进行推理并形成、检验假设。
予路乾行创始人兼CEO郑铮博士在招商银行与苏州日报联合推出的“招行思享会2026”栏目中接受专访,谈AI重塑新药研发。予路乾行打造多尺度分子动力学模拟平台与创新药早研决策AI平台,为小分子、多肽、大分子等药物研发提供Hits-to-PCC一体化研发平台。公司称已与超50家国内外生物医药企业合作推进80余条新药研发管线。
Inductive Bio 宣布加入 Anthropic 生命科学生态,并发布 Model Context Protocol(MCP)连接器,让 Claude 和 Claude Science 用户可用自然语言对任意化学结构获取 ADMET 性质预测。
推荐理由:Inductive Bio 把其 ADMET 预测模型接入 Claude,为小分子设计中的性质评估提供了一种对话式调用入口。
Terray Therapeutics分享了其生成式合成规划器TerraSynth的工作,针对小分子药物发现中的合成瓶颈。该工具将合成规划纳入设计循环,而非事后处理,以减少生成模型提出难合成分子对DMTA循环的拖慢。TerraSynth已整合进其EMMI平台,帮助聚焦值得合成的分子以推进项目。
MIT 的 Melis Anahtar 团队用含 38,650 个分子及其抑制淋球菌生长数据训练神经网络,再筛选 610 万分子,找到预测可靶向该菌的候选。实验室测试显示其中一个分子对多重耐药淋球菌有效且对人细胞毒性较低;用另外 152 个分子重训模型后又发现一个候选,该分子在体外杀死多重耐药菌株并在小鼠体内降低药物敏感菌株水平,进一步实验显示其抑制细菌细胞壁合成所需的一种酶。
推荐理由:研究用3.8万分子训练神经网络筛选610万分子,找到对多重耐药淋球菌有效且机制新颖的候选。
Valence Labs 的 Jason Hartford 介绍其 ICML 论文 f-Trajectory Balance,提出一族损失函数用于微调 GFlowNets、生成模型和 LLM,并支持离策略与在策略数据。
推荐理由:作者从损失函数角度解释生成模型探索与利用的权衡,为分子生成和 LLM 微调提供可迁移的方法视角。
Genesis Molecular AI 的基础模型 Pearl 入选 Fast Company "2026 改变世界创意"榜单,被列为 21 个引领医疗健康未来的项目之一。
Terray Therapeutics宣布其药物发现平台EMMI(实验遇见机器智能)入选Fast Company“改变世界创意”榜单。EMMI将AI与实验整合,用于探索化学空间中的“暗区”,以发现并优化针对难治疾病的新型小分子药物。
Ignota Labs 联合创始人 Layla Hosseini-Gerami 在 Nature 访谈中介绍其 AI 驱动平台:先从数千个失败药物中筛出因意外安全性问题(如肝毒性)而搁置、但患者潜力大的候选,再用深度学习结合生物信息学、化学信息学和多模态数据定位安全性问题根因并制定缓解策略。核心目标是以最小化学改动让这些药物尽快重回临床。
Genesis Molecular AI 宣布与 Incyte 扩大 AI 药物发现合作,规模达 10 亿美元。公司称其 GEMS AI 在一个无已知化学起点的靶点上参与命中化合物识别,并在另一个已有化学基础但存在开发障碍的先导优化靶点上发挥作用。Incyte 总裁兼全球研发负责人 Pablo Cagnoni 与 Genesis CEO 在访谈中讨论了这一进展及合作扩展对双方的意义。
推荐理由:Genesis 与 Incyte 扩大合作至 10 亿美元规模,文中给出两个靶点上 AI 参与命中识别与先导优化的具体分工。
HotSpot Therapeutics 在 EULAR 2026 以壁报展示其小分子 IRF5 抑制剂项目的临床前数据,该抑制剂经 Smart Allostery™ 平台发现,可剂量依赖地抑制多种人免疫细胞的细胞因子产生。
基于 ICLR 2023 的 Uni-Mol 框架微调血脑屏障渗透性分类模型,在留出测试集上取得 ROC-AUC 0.9199、PRC-AUC 0.9686。训练使用约 2000 多个 BBBP 分子,经 RDKit 规范化后剔除 11 个非法分子,微调 10 个 Epoch。
Ginkgo Datapoints、Tangible Scientific 与 Inductive Bio 联合推出 ADME-One,将完整的高通量 Tier 1 ADME 实验面板与 AI 驱动的人体 PK 预测及整合式化合物管理结合。三家机构称,该组合让团队可在命中化合物识别阶段就做出达到先导优化质量的决策。
Ginkgo Bioworks旗下Datapoints与Tangible Scientific、Inductive Bio联合推出高通量ADME平台ADME-One,将五项Tier 1 ADME检测、Inductive Bio的AI人体PK预测和化合物管理整合为一项服务。
推荐理由:三家合作方把高通量ADME实验、AI人体PK预测与化合物管理打包成一体化服务,展示AI与湿实验衔接的一种落地形态。