微软研究院公开预览 BioEmu2 生物分子结构、动力学与功能基础模型
微软研究院 AI for Science 公开预览基础模型 BioEmu2，面向生物分子结构、动力学与功能，开放权重并采用 MIT 许可，代码托管于 GitHub。作者同时展示了 BioEmu2 模拟无序肽 PUMA 与 MCL-1 受体结合的动画。
推荐理由：微软研究院发布生物分子结构与动力学基础模型 BioEmu2，开放权重与 MIT 许可便于研究者直接复用。
内容形态
模型/算法发布 最新动态
生命科学大模型、蛋白质结构预测、生成式化学与 AI 制药核心算法的权重、版本与能力发布。
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Frank Noé精选AI 评分7474
Martin Pacesa精选AI 评分5858 BindCraft2 v1.0.4 发布，改进 VHH、scFv、ARP 与诱导契合靶向
BindCraft2 v1.0.4 已发布，作者称该版本显著改进了 VHH、scFv、ARP 和诱导契合靶向能力，同时提升了运行速度与代码稳定性。作者建议此前困难的结合剂设计任务可再次尝试，并致谢 Erik Mäeots、Leonardo Tredese 和 Elizaveta Chernova 的工作。
推荐理由：BindCraft2 新版本针对 VHH、scFv 与诱导契合靶向改进，为结合剂设计流程提供了可复用的更新参照。
机器之心 · AI4Science精选AI 评分5858 中科大发布机器科学家2.2系统，宣称可自主创制新物质
中科大在智能科学家生态联盟第四届年会上发布机器科学家2.2系统，官方定位为新一代智能物质科学基础设施，由大模型提出假设、专业小模型计算筛选、科研机器人执行实验并回喂结果形成闭环。
推荐理由：报道梳理了该系统大模型假设、小模型求证与机器人实验的三层分工及闭环机制，并列出效率数据与数据、验证层面的现实约束。
Insilico Medicine 英矽智能精选AI 评分5858 英矽智能在虚拟细胞论坛展示虚拟衰老细胞模拟框架
英矽智能全球AI平台负责人Petrina Kamya在虚拟细胞论坛介绍了公司的虚拟衰老细胞模拟框架，该框架基于12年自有数据与基准测试构建，覆盖分子、细胞内、细胞间、组织/器官和机体五个生物学尺度。系统在每个生物层级使用约43个专用AI智能体，以患者种子基线图谱模拟干预后的细胞状态转变。Kamya表示，公司正在全自动机器人实验室中对机制未知的新分子开展前瞻性验证，以检验预测并排除对文献的记忆。
推荐理由：英矽智能公开虚拟衰老细胞框架的跨尺度多智能体架构，并说明其正用自动化实验室做前瞻验证。
智药局精选AI 评分6262 Boltz小分子模型BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间
Boltz于10月13日宣布，其小分子模型BoltzMol-1可直接搜索药明康德的GalaXi虚拟化合物库，该库规模约260亿个可合成分子，已在Boltz Lab平台和Boltz API上线供全球用户调用。
推荐理由：BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间，反映AI小分子模型对可合成化合物库的依赖。
英矽智能精选AI 评分5858 英矽智能Pharma.AI 2026秋季发布：MMAI Gym、专业模型与MCP智能体工作流
英矽智能在2026年Pharma.AI秋季网络研讨会上发布MMAI Gym科学后训练与评估框架，并展示激酶活性、GPCR活性、ADMET预测、单步逆合成和治疗靶点发现五款专业模型，公司称其在70多项化学与生物学基准任务中达到或超越当前SOTA。
推荐理由：英矽智能一次性披露Pharma.AI秋季多项更新，含专业模型基准表现与逆合成对比数据，可作平台能力横向参照。
智药邦精选AI 评分5858 丹纳赫推出AI驱动自主实验室，计划2027年初规模化运营
丹纳赫于2026年10月7日宣布计划推出旗下首个AI驱动自主实验室，用于加速定制抗体及其他分子工具的发现，预计2027年初实现规模化运营。
推荐理由：丹纳赫披露自主实验室的整合方式与产能目标，可作为抗体发现自动化的产业参照。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分5858 Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon，并展示其在酶设计与科研任务上的应用
Google DeepMind 发布 Gemini 4 Argon，通过 API、AI Studio、Gemini 平台及 Antigravity 等入口向开发者、企业和科研人员开放，输入定价为每百万 token 2 美元、输出为每百万 token 10 美元。
推荐理由：Gemini 4 Argon 在数小时内完成丝氨酸酯酶设计，并经实验室测试确认催化活性，为通用模型参与酶工程提供了具体案例。
insitro · Publications & Press精选AI 评分6565 insitro 与礼来共建的小分子体内 PK 预测模型上线 Lilly TuneLab
insitro 与礼来合作构建的小分子体外及体内性质预测机器学习模型，现已向部分生物技术公司开放于 Lilly TuneLab。模型基于礼来数十年研究产生的多物种临床前数据训练，覆盖数十万个独特分子，并会随数据集扩展而更新；insitro 称其可作为当前从体外实验外推的行业标准方法的替代方案。
推荐理由：礼来与 insitro 用数十年多物种临床前数据训练的小分子体内 PK 预测模型进入 TuneLab，为早期筛选提供参照。
insitro · Publications & Press精选AI 评分7272 insitro 与礼来在 TuneLab 推出体内 PK 预测机器学习模型
insitro 与礼来在 Lilly TuneLab 平台上线体内 PK 预测模型，可跨小鼠、大鼠、狗和猴四种临床前物种预测血浆清除率、稳态分布容积和平均驻留时间。
推荐理由：该模型用礼来历史数据直接预测体内PK，并与体外外推法对比，为小分子成药性评估提供参照。
Justas Dauparas精选AI 评分7272 Xaira 发布 X-Design，针对真实治疗靶点从头设计抗体
Xaira 的 Justas Dauparas 介绍团队开发的 X-Design，称其能针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规发现方法攻克。相关细节见 Xaira 官网新闻页，推文未披露具体靶点、实验数据或验证结果。
推荐理由：Xaira 员工披露 X-Design 针对真实治疗靶点生成抗体，其中一个靶点此前难以用常规方法发现。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分7474 Google DeepMind 推出 SynthID Bio，为 AI 生成蛋白与结构嵌入可验证水印
Google DeepMind 推出面向合成生物学的 SynthID Bio 水印方法，可在蛋白序列和 AlphaFold 3 预测的 3D 结构中嵌入可检测签名，并在实验室测试中保持生物功能。
推荐理由：介绍一种嵌入蛋白序列与预测结构的可验证水印方法，并给出湿实验与检测稳健性证据。
唯信计算精选AI 评分6363 唯信计算 WeMol 推出 AbForge 多特异性抗体全原子结构建模引擎
唯信计算在 WeMol 平台上线 AbForge，输入完整抗体 FASTA 后自动识别 Format 与结构域拓扑，按 KiH、CrossMab 等工程约束装配全原子三维模型。
推荐理由：官方展示多特异性抗体结构建模引擎与通用折叠模型在八个已上市或临床后期分子上的几何构型差异。
EMBL-EBI News精选AI 评分6868 AlphaFold 数据库新增病毒蛋白复合物预测，覆盖 2800 多种病毒
EMBL-EBI 与 Google DeepMind、NVIDIA 等合作，在 AlphaFold 数据库中开放 2800 多种病毒的 AI 预测蛋白复合物结构，优先覆盖已知感染人类的病毒科。
推荐理由：AlphaFold 数据库新增 2800 多种病毒的蛋白复合物预测结构，为疫苗与诊断靶点研究提供开放基础数据。
德睿智药精选AI 评分6868 德睿智药发布生命科学基座模型体系Intera，首推结合构象预测模型InteraFold-Chem
德睿智药于2026年9月18日发布生命科学基座模型体系Intera，并公布首个模型InteraFold-Chem的技术报告，该模型聚焦蛋白质与小分子的结合构象预测。
推荐理由：德睿智药公布InteraFold-Chem在445个测试样本上的结合构象预测成功率，并给出与Protenix-v2、Chai-1、Boltz-2的对照结果。
Mohammed AlQuraishi精选AI 评分7676 AlQuraishi 团队与 Apheris 用五家药企私有数据训练 OpenFold3p2
Mohammed AlQuraishi 表示，团队与 Apheris 合作，在五家药企内部的蛋白-配体复合物数据库上训练了 OpenFold3p2。由于 PDB 中类药化合物相对稀少，这批数据使相关结构数据量增加 3-4 倍，并带来精度显著提升。作者称训练数据未离开各药企内部环境。
推荐理由：作者披露 OpenFold3p2 在五家药企私有蛋白-配体结构上联合训练，给出数据规模与精度变化的具体参照。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分7272 Inductive Bio 发布 Beacon-2，可由化学结构预测小分子人体有效剂量
Inductive Bio 于 9 月 17 日发布 Beacon-2，该系统可直接从小分子化学结构预测人体有效剂量，先预测吸收、分布、代谢、排泄与毒性等决定剂量的性质并估算效力，再通过药代动力学机制模型整合。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可从结构计算的指标，并给出在真实药物项目与公开化合物上的验证范围。
Inductive Bio 官网资讯精选AI 评分7373 Inductive Bio 发布 Beacon-2 模型，从化学结构直接预测人体有效剂量
Inductive Bio 发布 Beacon-2，这是对 Beacon 系列模型的重大更新，可在 ADMET 之外直接从化学结构预测分子的有效人体剂量，由 ADMET-PK、效力与 PK/PD 三个可配置模块组成。
推荐理由：Beacon-2 把人体有效剂量作为可计算目标，并用 Indy 智能体的对照实验展示只优化效力会出现的偏差。
临港实验室精选AI 评分5555 临港实验室元生·开物发布AI原生制药工作台升级版
临港实验室元生·开物发布新版本，上线协作空间与OriBench Structure Viewer，支持多人多Agent协作、蛋白结构叠合与靶点注释，并开放自定义套件能力。
推荐理由：临港实验室发布元生·开物工作台升级，展示多模型配置在BiomniBench-DA上的对照结果与协作功能。
天鹜科技精选AI 评分7676 天鹜科技开源全原子结构预测模型VenusFold，FoldBench多类任务领先AlphaFold3与Boltz-2
天鹜科技发布并开源通用全原子生物分子结构预测模型VenusFold的代码与权重，可预测蛋白质、蛋白质-小分子和蛋白质-蛋白质复合物结构。
推荐理由：天鹜科技开源可商用的全原子结构预测模型，在统一基准下与 AlphaFold3 等模型对比接口精度，并给出训练策略改进细节。