AI制药日报｜大分子/小分子/虚拟细胞多项研究进展
研究团队用肽条形码、尺寸排阻色谱与质谱结合的混合方法，在大肠杆菌统一生产条件下量化了超过39000个天然蛋白结构域变体、从头设计蛋白和纳米抗体的单体产量。AtomLM-9b以全原子结构分词器将生物分子几何压缩为离散结构token，在CASP14和CASP15上全原子lDDT分别为0.832和0.835。单细胞基础模型基准评测显示，五种模型在跨物种注释与扰动预测上优于简单基线，但同物种内优势有限。
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Genesis Molecular AI精选AI 评分6868 Genesis Molecular AI 的 NeurIPS 2026 论文：分子优化达最强推理时搜索同等性能，oracle 调用少 58 倍
Genesis Molecular AI 在 NeurIPS 2026 论文中报告，其方法在分子优化任务上达到与最强推理时搜索相同的性能，同时 oracle 调用次数减少 58 倍。该推文指出，预训练分子生成器掌握化学规律但不了解具体靶点，论文聚焦离散扩散设计选择对反馈效率的影响。
推荐理由：该论文比较离散扩散分子生成中不同设计选择对反馈效率的影响，为优化时的 oracle 调用预算提供参照。
Genesis Molecular AI精选AI 评分5858 Caltech 与 Genesis 团队发布 DDAMO 论文并开源代码
Caltech 的 Trevor Chen 与 @ariel_1214_ 共同主导，联合 Genesis 团队（@edunov、@gruver_nate）等作者发布论文 arXiv:2607.02834，并在 GitHub 开源代码 DDAMO。材料未披露研究任务、方法细节与实验结果。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7474 Genesis 与 Caltech 提出离散扩散在线适应框架，分子优化用 86 次评估追平 Beam Search 约 5000 次评估表现
Genesis Molecular AI 与 Caltech 合作的 NeurIPS 2026 论文研究离散扩散分子生成模型在测试时如何分配算力，其在线适应框架仅用 86 次 oracle 评估即追平最强推理期搜索基线 Beam Search 约 5000 次评估的表现。
推荐理由：研究系统拆解在线适应式分子优化的四个设计选择，并给出何时值得用在线适应而非推理期搜索的判据。
Genesis Molecular AIAI 评分1818 Genesis CTO谈分子基础模型与AI制药
我们的CTO @edunov 做客 @AI_in_the_AM，与 @labenz 和 @8teAPi 一起讨论了分子基础模型、基于物理的模拟、湿实验数据、智能体工作流以及制药合作，以及它们如何共同服务于AI药物发现这一复杂任务。 他们还谈到了Anthropic的蛋白质结合剂设计报告、为什么亚埃级精度很重要，以及为什么生物学是AI研究中最令人兴奋的前沿领域。 观看链接：https://www.youtube.com/watch?v=JHglTBoaGTk
Genesis Molecular AIAI 评分3636 Genesis分子AI将在ICML首尔GenBio 2026展示DeCAF
期待下周在首尔@icmlconf举办的GenBio 2026研讨会。 ➡️ 高级员工ML研究科学家Pranav Murugan将展示聚光灯海报："Few-step Cofolding with All-Atom Flow Maps"，介绍DeCAF——Pearl的蒸馏版本，专为少步推理构建：https://arxiv.org/abs/2606.08375 ➡️ 关于我们自豪地联合赞助的研讨会的更多详情：https://genbio-workshop.github.io/2026/
Genesis Molecular AIAI 评分4040 Genesis 公开智能体药物设计系统 Sapphire
Genesis Molecular AI 首次披露其智能体药物设计系统 Sapphire，该系统构建于其分子基础模型之上，可全天候自主迭代候选药物，对2D化学结构与3D分子构象进行推理并形成、检验假设。
Genesis Molecular AIAI 评分2020 Genesis Molecular AI 的 Pearl 模型入选 Fast Company 2026 改变世界创意榜
Genesis Molecular AI 的基础模型 Pearl 入选 Fast Company "2026 改变世界创意"榜单，被列为 21 个引领医疗健康未来的项目之一。
Genesis Molecular AIAI 评分1212 Genesis Molecular AI 扩招以匹配药企合作与模型扩展
Genesis Molecular AI 因药企合作扩大、基础模型规模提升而扩充团队，正招聘 ML 与分子模拟科学家及基础模型 ML 研究科学家等岗位。前者将用 3D 扩散模型、物理启发神经网络和大规模分子模拟推进其 GEMS 药物发现平台，后者聚焦深度学习、物理与计算化学交叉的生成式 AI 模型研究。公司同时在 ML 研究、应用 ML 科学、产品与软件工程等方向开放职位。
Genesis Molecular AI精选AI 评分7474 Genesis Molecular AI 发布 DeCAF-Pearl 全原子共折叠流图模型，推理提速 5 倍
Genesis Molecular AI 发布 DeCAF-Pearl，称其为首个用于全原子共折叠的流图模型，相比其 Pearl 模型推理提速 5 倍且质量几乎无损。
推荐理由：DeCAF-Pearl 以更少计算步数在 Runs N' Poses 基准上超过多个全原子共折叠模型，为高通量筛选场景提供了速度参照。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7373 Genesis 发布 DeCAF-Pearl：面向全原子共折叠的流映射蒸馏模型
Genesis 发布 DeCAF-Pearl，这是首个用于全原子共折叠的流映射模型，由 Pearl-2026.1.dev 蒸馏而来，扩散采样阶段的模型调用减少约 20 倍，整体推理加速约 5 倍。
推荐理由：Genesis 将 Pearl 共折叠模型蒸馏为少步流映射模型，在保持成功率的同时把推理成本降低约 5 倍。
Genesis Molecular AI精选AI 评分5858 Genesis Molecular AI 与 Incyte 扩大 AI 药物发现合作至 10 亿美元
Genesis Molecular AI 宣布与 Incyte 扩大 AI 药物发现合作，规模达 10 亿美元。公司称其 GEMS AI 在一个无已知化学起点的靶点上参与命中化合物识别，并在另一个已有化学基础但存在开发障碍的先导优化靶点上发挥作用。Incyte 总裁兼全球研发负责人 Pablo Cagnoni 与 Genesis CEO 在访谈中讨论了这一进展及合作扩展对双方的意义。
推荐理由：Genesis 与 Incyte 扩大合作至 10 亿美元规模，文中给出两个靶点上 AI 参与命中识别与先导优化的具体分工。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7474 Genesis 的 Pearl 系统在 OpenBind 基准上零样本超越全部共折叠模型
Genesis 称其 Pearl 系统在 OpenBind 的 EV-A71 2A 蛋白酶基准（802 个化合物，best-of-25）上零样本取得 78% 联合标准成功率（RMSD ≤ 2 Å、PoseBusters 有效、LDDT-PLI ≥ 0.8），高于 OpenBind 评测的全部共折叠模型。
推荐理由：Genesis 在 OpenBind 公开基准上对比 Pearl 与六种共折叠模型及对接方法，给出零样本与亚埃级精度的具体参照。
Genesis Therapeutics 官网资讯精选AI 评分7171 Incyte 与 Genesis Molecular AI 扩大合作，120 亿美元级条款训练 GEMS 平台
Incyte 与 Genesis Molecular AI 扩大战略合作，Incyte 将共享自有实验数据用于训练 Genesis 的 GEMS 分子 AI 平台，并新增至少 5 个由 Incyte 选定的合作靶点。
推荐理由：交易条款与数据授权范围披露较完整，可观察大药企自有实验数据进入分子AI训练的具体安排。