融合 Boltz-2、OpenDDE 与 Schrödinger 的 GPCR 设计管线及 GPR84 实战
作者以 GPR84 为例,介绍一套融合 OpenDDE 生成、Boltz-2 共折叠与亲和力快筛、Schrödinger 2026-4 膜显式 MD 与 FEP+ 的 GPCR 计算设计管线。
推荐理由:以 GPR84 为例拆解 AI 生成、共折叠快筛与物理终审的分级管线,并给出激动剂与抑制剂形态差异的实操约束。
作者以 GPR84 为例,介绍一套融合 OpenDDE 生成、Boltz-2 共折叠与亲和力快筛、Schrödinger 2026-4 膜显式 MD 与 FEP+ 的 GPCR 计算设计管线。
推荐理由:以 GPR84 为例拆解 AI 生成、共折叠快筛与物理终审的分级管线,并给出激动剂与抑制剂形态差异的实操约束。
文章比较了 RFD4-Proteina、BoltzGen、PPIFlow、OpenDDE-Harness 与备选的 PartiDesign 五套抗体设计工具,指出它们并非简单性能排名,而是生成机制与后处理路径各不相同。
AI蛋白质设计融资追踪显示,2024年1月至2026年9月67家公司完成84笔融资,披露总额至少27.5亿美元,但中位数仅1500万美元,远低于3673万美元的平均值。
途深智合创始人兼CEO王宇光在第12届BiG IMPACT年会上参与“AI前沿创新者×一线投资机构深度对话”圆桌交流,与AI领域创新者及投资机构代表探讨行业发展议题。该年会10月24日在上海张江收官,设主论坛、四大分论坛及三场闭门会,聚焦难成药靶点突破、AI虚实之辩、CNS与自免研发及BD/NewCo出海等议题。
寻明生科开源全原子生物分子基座模型OpenDDE,在PXMeter-AB、FoldBench-AB和2026ARK-AB三项抗体-抗原共折叠基准上成功率分别为51.0%、70.0%和66.4%,模型约655M可训练参数。
首届国际AI抗体设计大赛AIntibody的结果发表于Nature Biotechnology,寻明生科自研抗体设计模型AuraIDE(参赛名AuraBind)在Challenge 1计算亲和力成熟任务中夺冠,其冠军抗体经KinExA测得KD为94.7pM,较亲本抗体提升约2000倍,优于第二轮组合文库湿实验筛选得到的最佳抗体(113pM)。
推荐理由:首届AIntibody盲测以统一湿实验验证抗体设计,冠军序列的亲和力优于实验筛选最优克隆,为模型能力提供了独立参照。
寻明生科(Aureka Biotechnologies)宣布完成总额1亿美元的B系列融资,首轮由Granite Asia独家投资,后续轮次由产业投资人领投、弘晖基金跟投,启明创投、经纬创投及纽尔利资本等现有股东持续投资,公司累计融资近2亿美元。
推荐理由:融资披露同时交代了资金用途与Lab-in-the-Loop闭环体系,可了解该公司基座模型与实验平台如何衔接。
寻明生科于2026年7月7日发布并开源全原子生物分子基座模型 OpenDDE,将生物分子共折叠、结构推理与规模化法则纳入同一框架。
推荐理由:寻明生科开源全原子共折叠基座模型,抗体-抗原基准成绩与规模化趋势为评估开放结构模型提供参照。
寻明生科宣布完成3500万美元A+轮融资,由红杉中国领投,经纬创投、博远资本跟投,老股东五源资本、启明创投、纽尔利资本等持续投资,A轮及A+轮累计近亿美元。资金将用于建设其自主研发的功能抗体设计平台AuraIDE™,加强基座模型与智能体能力及高通量高内涵实验平台。
推荐理由:融资披露同时给出抗体管线所处阶段与智能体实验闭环的建设方向,可对照其平台叙事与管线进度。
寻明生科(Aureka Biotechnologies)宣布完成数千万美元A轮融资,由五源资本与启明创投联合领投,老股东纽尔利资本持续投资,Agentic Ventures等跟投。
推荐理由:融资披露同时给出抗体设计智能体平台的技术路线与管线阶段,可对照其干湿闭环思路与商业化进展。
寻明生科在WAIC 2024入选“Future Tech 100未来之星”,并作为AI+制药领域两家入围企业之一参与Future Tech创新项目路演,介绍生成式AI与高通量数字生物学助力抗体设计。公司成立于2023年,结合高通量单细胞功能筛选、蛋白超突变进化和结构启发的生成式AI大模型,打造干湿闭环智能大分子药物发现平台。成立一年内已与10家跨国药企和知名biotech达成合作。
寻明生科与碧迪医疗(BD)启动合作项目,将利用寻明生科生成式AI赋能的抗体发现与工程平台开发高性能科研试剂。寻明生科称其结合超高通量单细胞功能筛选、酵母自主超突变与结构感知生成式AI模型,用于双特异性抗体、ADC及难成药靶点药物研发。
寻明生科与苏州康宁杰瑞签署合作协议,将结合前者单细胞功能筛选、合成生物学与AI技术平台和后者药物开发经验,联合推进first-in-class和best-in-class药物发现。寻明生科将获得首付款开展研究,并在项目后续获得里程碑付款和销售分成。
寻明生科(Aureka Biotechnologies)宣布加入英伟达初创加速计划(NVIDIA Inception),将获得英伟达硬件、软件、深度学习工具及行业专业知识支持。这家AI驱动药物发现公司专注于双特异性抗体、ADC和难成药靶点药物的设计与优化,通过融合多模态制药数据与结构感知生成式AI模型开展研发。