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10月5日周一
7月22日周三
  1. A-Alpha Bio 官网资讯72

    A-Alpha Bio 发起 Atlas Consortium 数据联盟,GSK、Boltz、Cradle、Dyno Therapeutics 为首批成员

    A-Alpha Bio 宣布成立 Atlas Consortium,首批五家创始成员包括 GSK、Boltz、Cradle 和 Dyno Therapeutics,以订阅制按季度设计并共享标准化抗体抗原实验数据。

    推荐理由:该联盟以订阅制汇集标准化抗体抗原实验数据,为AI抗体设计提供可比的亲和力与结构训练资源。

6月24日周三
  1. Cradle Bio Blog67

    AI 如何改变抗体优化的第一轮:Cradle 七个多样化campaign的实测

    Cradle 在七个抗体多样化campaign中,用基于进化序列数据训练的模型生成每个携带2-8个突变的多突变变体库,设计变体的结合保留率为56%-92%,其中四个campaign在未针对亲和力优化的情况下出现2倍至350倍亲和力提升。

    推荐理由:Cradle 用七个抗体多样化campaign的实测数据,对比单点扫描与多突变首轮的取舍,给出首轮实验设计的具体参照。

6月16日周二
  1. Cradle Bio Blog46

    Cradle 推出 Guided Rounds:将蛋白质工程轮次最佳实践内置到平台

    Cradle 发布 Guided Rounds,把运行机器学习引导蛋白质工程轮次的最佳实践内置到平台,用户输入蛋白类型、是否有实验数据及设计或筛选目标后即可获得默认配置与分步引导。该功能今日面向所有用户上线,覆盖用户最常运行的轮次类型,并可视化数据集、模型训练、设计与审核之间的决策路径以提升可追溯性。需要逐参数控制的科学家仍可自行配置单项任务,计算科学家也可通过 API 扩展自有预测器与评分。

6月9日周二
  1. Cradle Bio Blog67

    Cradle 展示零样本抗体多样化:七组实验与单突变扫描基线对比

    Cradle 汇总其零样本抗体多样化流程在 SARS-CoV-2 RBD、HER2 和 EGFR 上的七组实验,其中 4/7 实验、2/3 靶点出现显著亲和力提升,弱结合剂 Ty2 的 KD 改善达 350 倍。

    推荐理由:Cradle 汇总七组零样本抗体多样化实验,给出功能率与亲和力提升幅度,并对照文献单突变扫描基线。

6月3日周三
  1. Cradle Bio Blog62

    Lundbeck 与 Cradle 合作,用 AI 蛋白设计平台优化脑病抗体疗法

    Lundbeck 与 Cradle 宣布合作,将部署 Cradle 的 AI 蛋白设计平台,用于发现和优化针对脑部疾病的生物疗法,初期推进两个靶向 CNS 疾病的抗体项目。

    推荐理由:Cradle 与 Lundbeck 签约,把生成式蛋白设计接入两条 CNS 抗体项目,并形成实验回流的迭代闭环。

3月23日周一
  1. Cradle Bio Blog58

    Cradle与UC Berkeley Keasling实验室合作,用机器学习优化酵母生产疫苗佐剂QS-21的酶

    Cradle与UC Berkeley Keasling实验室合作,将机器学习嵌入酵母生产疫苗佐剂QS-21的酶优化流程。该实验室2024年在Nature报告用38个植物基因使酵母从简单糖类合成QS-21,但产量远低于商业化水平。

    推荐理由:案例展示机器学习如何嵌入植物酶优化流程,为替代植物提取的合成生物制造提供可迁移路径。

3月12日周四
  1. Cradle Bio Blog42

    Cradle Bio 用桑基图可视化多属性蛋白质优化中的权衡

    Cradle Bio 将桑基图用作多属性蛋白质生成项目的核心可视化,展示序列在活性、表达、稳定性、安全性和可开发性等约束下的通过或失败流向,以定位设计瓶颈。这些结果均为预测,序列尚未合成或经湿实验验证。两个虚构示例中,将次要安全性约束放宽约10%后序列流量打开;在抗体案例中放宽次要疏水性约束后,主要活性从起始模板的1.5倍提升至2.7倍。