Biomaterials | 广州医科大学周蕾等设计甘草酸可注射ROS响应水凝胶缓解神经病理性疼痛
广州医科大学周蕾等设计了一种ROS响应性天然药物自递送水凝胶GPG（GA-PBA-GA），用于神经病理性疼痛的局部持续治疗。机制引导的虚拟筛选鉴定甘草酸（GA）为PI3K靶向候选分子，体外实验显示GPG可抑制PI3K-Akt信号并促进巨噬细胞M1向M2再极化。在大鼠L5脊神经结扎模型中，DRG周围给药减轻机械性与热痛觉过敏，改善步态与电生理功能，并减少DRG神经炎症与脊髓小胶质细胞活化。
#靶点发现
iNatureAI 评分3030
药化猩球AI 评分4141 IF=12.2：贵州医科大学用Uni-Mol虚拟筛选锁定雷公藤红素，共价结合SMAD3 Cys421阻断糖尿病肾病纤维化
贵州医科大学基于Uni-Mol深度学习模型对天然产物库虚拟筛选，锁定雷公藤红素，并经化学蛋白质组学等实验证实其共价结合SMAD3的Cys421位点。雷公藤红素促使非磷酸化SMAD3经KPNB1入核，同时减弱SMAD3与SMAD4、TGFBR1的结合，阻断促纤维化信号。在HFD-STZ糖尿病肾病小鼠中，雷公藤红素剂量依赖性减轻肾脏胶原沉积并改善尿蛋白、血肌酐和尿素氮。
王初课题组AI 评分3030 化学蛋白质组学策略开发靶向PqsC的铜绿假单胞菌抗毒力化合物
研究者以绿脓素合成作为筛选指标，从亲电性抑制剂中筛出化合物D3，其可在不影响铜绿假单胞菌生长的前提下抑制绿脓素合成。通过荧光胶与DIA无标定量蛋白质组学，确认D3共价标记绿脓素合成关键蛋白PqsC的Cys129，并抑制其体外酶活。基于该结合位点将β-内酯替换为氯乙酰胺warhead并经SAR优化，所得共价化合物处理后的细菌上清液对哺乳动物细胞毒力弱于未处理对照。
SandboxAQAI 评分2020 SandboxAQ在AIDDD展示自主药物发现科学基础
SandboxAQ在AIDDD大会上由Mary Pitman发表主题演讲，提出仅靠工作流自动化不足以实现自主发现，方法本身需具备演化能力。她介绍了团队正在构建的非平衡嵌合切换、绝对结合自由能计算方法和知识图谱，Amogh Sood与Rae Qi还展示了AI与物理方法整合、可扩展自由能计算及结合亲和力预测三项研究。
DrugAI精选AI 评分6666 伯克利团队在Science提出刺激性蛋白降解SPD策略，小分子BD2激活CUL2-FEM1B改善线粒体功能
加州大学伯克利分校Michael Rapé团队在《Science》发表研究，提出刺激性蛋白降解（SPD）策略，用小分子解除BEX蛋白对E3连接酶CUL2-FEM1B的抑制，促进其天然底物降解。
推荐理由：研究提出激活E3连接酶天然底物清除的SPD策略，为多蛋白异常疾病提供不同于PROTAC的作用模式参照。
药化猩球精选AI 评分5858 能结合却无药效的分子还能做什么：从沉默结合到PROTAC与RiboTAC的药化设计
作者费米子父梳理了沉默结合配体在诱导邻近技术中的再利用路径，涵盖SAR by catalog、RiboTAC、RNATAC、RIPTAC与PhosTAC。文中引用Disney团队2023年Nature研究，将结合RNA但无功能效应的小分子接上RNase L招募模块后成为降解剂；Tong等2024年全转录组研究中481个结合RNA靶标仅5个达到RNase L依赖切割标准。
推荐理由：文章把沉默结合配体与多种诱导邻近技术串成一套设计检查框架，便于理解配体再利用的取舍。
王初课题组精选AI 评分5858 Nat. Chem. Biol. | Tryptoline立体探针结构拓展发现GRPEL1–HSPA9复合物抑制剂
Scripps研究所的Bruno Melillo与Benjamin F. Cravatt团队在Nat. Chem. Biol.发表研究，通过改造Tryptoline丙烯酰胺探针的C6/C7远端结构，在Ramos细胞中定量超过24,000个半胱氨酸位点，筛出95个可被立体选择性标记的位点。
推荐理由：研究用立体探针扩展半胱氨酸配体图谱，并借GRPEL1案例展示结构预测在非正构位点的识别局限。
BioArt精选AI 评分7272 Nature：Shokat团队提出双位点激酶抑制剂设计原则并开发PonatiLink-2
加州大学旧金山分校Kevan M. Shokat与Kevin Lou团队在Nature发表研究，以ABL1和EGFR为模型系统梳理双位点激酶抑制剂的设计原则，并开发出双位点ABL1抑制剂PonatiLink-2。
推荐理由：研究以ABL1与EGFR为模型系统梳理双位点激酶抑制剂的设计参数，为兼顾效力与选择性提供可迁移思路。
iNatureAI 评分3434 南京医科大学赵杨/陆茵团队发现MEKK3驱动脑海绵状血管畸形进展，AI辅助设计抑制剂DPDH
南京医科大学赵杨、陆茵团队在Advanced Science发表研究，证实内皮细胞MEKK3启动脑海绵状血管畸形（CCMs）病灶形成，小胶质细胞MEKK3则通过MEKK3–NF-κB通路加剧病灶晚期进展。借助AI辅助药物设计与结构优化，团队获得强效MEKK3抑制剂DPDH，可恢复血管屏障完整性并抑制小胶质细胞活化及对受损内皮的吞噬。研究据此提出DPDH作为CCMs候选药物的潜力。
药学进展精选AI 评分6262 南京中医药大学纪建建团队在Cell Reports Medicine发表AI筛选抗耐药RSV中药成分Punicalin的研究
南京中医药大学纪建建团队利用自主构建并开源的抗病毒药物AI模型，从中药化合物库中筛选出活性成分Punicalin，成果发表于Cell Reports Medicine。
推荐理由：研究用开源抗病毒AI模型从中药化合物库筛出靶向RSV G/F蛋白的天然产物，并给出动物实验与专利信息。
药明康德AI 评分4040 治疗“癌症之王”，新型RAS抑制剂如何拓展小分子药物的边界？｜Bilingual
2026年第三季度，两款采用不同诱导接近机制的新药获美国FDA批准：百时美施贵宝的CELMoD疗法iberdomide（Zenbexus）于8月13日加速获批用于多发性骨髓瘤，Revolution Medicines的RAS三元复合体抑制剂daraxonrasib（Rasonque）于8月26日获批用于转移性胰腺腺癌。
AI药物设计实验室精选AI 评分7878 Nature Communications 2026：高通量蛋白质组学与AI折叠发现靶向VAV1的分子胶
2026年发表于《Nature Communications》的研究用高通量DIA全球蛋白质组学在Jurkat细胞中筛选出可经CRBN诱导VAV1降解的苯基-戊二酰亚胺类分子胶，关键降解元件定位在VAV1 C端SH3-2结构域的RDxS基序（796–799位点）。
推荐理由：研究把高通量蛋白质组学与AI三元复合物折叠串成分子胶发现链，并给出FEP与细胞降解效力的相关性参照。
HouMed精选AI 评分7474 浙大团队在Nature Communications发表机器学习增强采样工作流，解析AR-NTD配体识别并发现新型拮抗剂K53
浙江大学李丹、侯廷军团队在Nature Communications发表机器学习增强采样工作流，用于解析本征无序蛋白AR-NTD的构象景观与配体识别机制，并发现新型AR-NTD拮抗剂K53。
推荐理由：该工作把增强采样、机器学习集合变量与虚拟筛选串成流程，用于本征无序蛋白的构象与配体识别研究。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3838 HotSpot Therapeutics 在 EULAR 2026 展示小分子 IRF5 抑制剂项目临床前数据
HotSpot Therapeutics 在 EULAR 2026 以壁报展示其小分子 IRF5 抑制剂项目的临床前数据，该抑制剂经 Smart Allostery™ 平台发现，可剂量依赖地抑制多种人免疫细胞的细胞因子产生。
Eikon Therapeutics 官网资讯AI 评分3838 单分子追踪加速优化：发现强效 RUVBL1/2 抑制剂以评估 MYC 驱动癌症靶向治疗
研究团队通过单分子追踪（SMT）驱动的构效关系优化，发现强效 RUVBL1/2 抑制剂化合物 18。活细胞高通量 RUVBL SMT assay 的效力测定与细胞活力和 MYC 降解强相关，而 ADP-Glo 生化 assay 在其实验条件下动态范围有限、重现性差。化合物 18 在 MYC 依赖性 Burkitt 淋巴瘤异种移植模型中，以显著低于 CB-6644 的剂量显示出更优疗效。
Ignota Labs 官网资讯AI 评分4141 Ignota Labs 入选 AI for Science Datasets RFP 十大获胜者，将构建激酶药物毒性数据集
Ignota Labs 入选 AI for Science Datasets RFP 十大获胜者，其提案是构建数据集以加深对药物毒性根源及缓解方式的理解。该公司与 Arctoris 合作，针对一批存在显著选择性挑战的癌症相关激酶，绘制分子结构微小改动引发行为显著变化、常导致意外副作用的化学边界，并称这是首个此类资源。
Mol.AIAI 评分2828 AI + 药物发现：从FDA已上市药物中虚拟筛选c-Abl激酶抗癌候选
一项计算模拟研究用AutoDock Vina将FDA已上市的前500个药物对接至c-Abl激酶（1IEP）活性口袋，筛出13个结合能低于-12.0 kcal/mol的分子。
药渡CyberAI 评分3333 药渡Cyber解析一种具有强大体内抗MASH活性的高效选择性肝脏靶向HSD17B13抑制剂的发现
广东药科大学研究团队经多参数优化发现强效选择性HSD17B13抑制剂化合物32（IC50=2.5 nM），其肝微粒体稳定性和药代动力学特征优于BI-3231并具肝脏靶向性。
药渡CyberAI 评分3333 药渡Cyber解析新型高选择性IIb型c-Met激酶抑制剂KIN-8741的发现
研究以优化亲脂效率为目标，通过基于结构的药物设计发现高选择性IIb型c-Met抑制剂KIN-8741，对D1228X、Y1230X等获得性耐药突变及L1195X/F1200X后口袋突变具广谱抑制活性。
HotSpot Therapeutics 官网资讯AI 评分3434 HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布IRF5小分子项目临床前数据
HotSpot Therapeutics在FOCIS 2025公布其Smart Allostery平台发现的强效选择性口服小分子IRF5抑制剂临床前数据，该类抑制剂在两种小鼠关节炎模型中实现IRF5磷酸化与核转位的完全剂量依赖性抑制，并降低干扰素响应基因、抗原特异性抗体和关节肿胀。
A-Alpha Bio 官网资讯AI 评分3636 A-Alpha Bio 在 AACR 2025 展示海报：通过大规模识别可成胶的连接酶-靶点对实现智能分子胶发现
A-Alpha Bio 在 2025 年美国癌症研究协会年会上展示海报，介绍通过大规模识别可成胶的连接酶-靶点对来发现分子胶。海报内容未在原文中披露具体方法、数据或结果。
HotSpot Therapeutics 官网资讯精选AI 评分5858 HotSpot Therapeutics在SITC 2021公布CBL-B变构抑制剂临床前数据
HotSpot Therapeutics宣布其Smart Allostery平台发现的新型CBL-B变构抑制剂在体外和小鼠中促进T细胞应答并增强NK细胞杀伤，数据将在SITC第36届年会以壁报864展示。
推荐理由：该数据展示机器学习平台如何定位蛋白调控口袋并得到口服小分子抑制剂，为不可成药靶点提供一条可参考路径。