AI制药日报｜Nature发表RNA基础模型structRFM、OriBench-AutoLAB初步闭环...
中国科学技术大学、浙江大学等机构在Nature发表RNA基础模型structRFM，预训练中通过结构引导掩码语言建模同时学习序列与碱基配对关系。临港实验室与上海人工智能实验室联合推出基于OriBench的自驱动实验室平台AutoLab，打通从计算推演到实验验证的干湿闭环。
#干湿闭环/自动化
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智药邦精选AI 评分5858 npj Drug Discov｜TechBio 3.0：AI制药如何把预测、设计与实验连成闭环
牛津大学Krish Ramadurai与Abhirup Banerjee在《npj Drug Discovery》发表综述，用TechBio 3.0概括将多模态AI、生成式化学与自动化实验接入同一反馈体系的研发方式，并区分1.0性质预测、2.0靶点发现与分子生成、3.0实验反馈持续更新模型与设计。
推荐理由：文章以综述框架梳理多模态AI、生成式设计与自动化实验的闭环，并借两个企业案例说明证据边界。
Alex ZhavoronkovAI 评分3838 智能体AI与自驱动实验室药物发现综述
新药研发研究综述：智能体AI + 自驱动实验室用于药物发现。 包含我们的“提示词到药物”/制药超级智能框架，并对验证与监管给出了恰当的注意事项。 祝贺 Bhagyashri Rathod、Manish Baviskar、Sachin Puri。 https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ddr.70400
智药局精选AI 评分5858 镁伽联合腾讯云、Twist发起Poreva Open蛋白质设计赛，计划湿实验验证超1万条序列
镁伽科技牵头，腾讯云、Twist、思朗科技、诺唯赞等参与，发起全球AI蛋白质设计竞赛Poreva Open，不限国家、模型与技术路线，计划对超过10000条设计序列做湿实验验证。评价体系除靶点结合外新增热稳定性和低非特异性指标，首批3项挑战靶点已公布，赛后拟择优引入类器官等模型进一步验证。奖金包括最高100万元现金、百万元级免费湿实验验证额度和千万元级投资激励。
推荐理由：镁伽联合腾讯云、Twist等发起不限模型的蛋白质设计赛，以万条湿实验验证切入AI4S数据入口。
清华大学智能产业研究院精选AI 评分7474 清华AIR联合上海AI Lab发布PFArena，用202项真实实验评测大模型蛋白质改造能力
清华大学智能产业研究院联合上海人工智能实验室和清华大学药学院推出PFArena，基于202项真实蛋白质实验、293个任务实例和607,269条候选记录，评测蛋白质语言模型、通用大模型与科学智能体在突变生成和排序上的表现。
推荐理由：该基准把真实蛋白质适应度实验转成生成与排序任务，比较PLM、通用LLM与智能体在有限实验预算下的决策差异。
智药邦精选AI 评分5858 浙大侯廷军等在npj Drug Discovery提出智能体六级自主性框架
浙江大学药学院侯廷军等在npj Drug Discovery发表观点文章，梳理智能体在药物发现中的应用并提出L0至L5六级自主性框架。作者从科学决策、系统自主性和人工参与程度三个维度划分能力，将能提出原创假设并组织端到端探索的L5“虚拟科学家”定位为长期愿景。
推荐理由：文章梳理智能体在药物发现中的能力分层，并给出区分工具调用与研究闭环的评估尺度。
BioArtAI 评分4444 Cell Biomaterials综述 | AI驱动肽类药物发现
西湖大学曾坚阳团队与宾夕法尼亚大学Cesar de la Fuente-Nunez团队在Cell Biomaterials发表综述，系统梳理肽-蛋白相互作用的实验发现、AI预测与生成式设计及治疗转化挑战。
DrugAI精选AI 评分7878 Nat. Comput. Sci.：主动学习与几何深度学习提升数据稀缺药物发现中的化学反应预测
研究人员提出主动学习、高通量实验与几何图神经网络组成的闭环流程，用于数据稀缺条件下的C–H硼化反应预测。经3轮主动学习新增50种底物、4,821次高通量实验，最终数据集含6,865条反应记录和568种底物，独特Bemis–Murcko骨架由105个增至147个。
推荐理由：研究把主动学习选样与几何图神经网络结合，在C–H硼化上展示数据稀缺条件下的实验闭环路径。
AI4Protein精选AI 评分8080 Science 论文解读：Townley 等用深度学习从头设计 RNA 假结
Townley 等人在 Science 发表的工作用深度学习设计 RNA 假结，先做对二级结构与局部拓扑，再借助 RNA 自身折叠补全三维细节。
推荐理由：文章解读了深度学习设计 RNA 假结并用 SHAPE 与补偿突变验证的路线，也点出结构正确不等于功能保留。