Briefings in Bioinformatics· Suyue Wang, Ayan Sengupta, Songling Li, Daron M Standley·· 7 天前精选AI 评分74
研究揭示蛋白语言模型检索适应性免疫受体的胚系依赖
Germline dependence in protein language model retrieval of adaptive immune receptors
AI 导读
【全文总结】研究者在IEDB、VDJdb、SAbDab和McPAS-TCR四个免疫受体数据库上以克隆感知划分评测抗原特异性受体检索,发现经典序列比对在CDR3层面一致优于零样本蛋白语言模型,BLOSUM62比ESM2-150M高7.2至11.5个百分点。
推荐理由
研究用克隆感知划分比较序列比对与零样本蛋白语言模型,指出全长检索的趋同可能来自胚系序列这一捷径。
来源:Briefings in Bioinformatics · doi.org