Drug Discov Today|赛诺菲等综述:通路分析如何提升药物靶点优先级排序效率
赛诺菲、Open Targets与EMBL-EBI等团队在《Drug Discovery Today》发表综述,系统梳理通路分析在药物靶点优先级排序中的应用。文章比较Reactome、KEGG、WikiPathways、GO等通路资源及ORA、GSEA和拓扑感知方法,并列举GWAS、转录组、蛋白质组与CRISPR筛选中的靶点发现案例。
赛诺菲、Open Targets与EMBL-EBI等团队在《Drug Discovery Today》发表综述,系统梳理通路分析在药物靶点优先级排序中的应用。文章比较Reactome、KEGG、WikiPathways、GO等通路资源及ORA、GSEA和拓扑感知方法,并列举GWAS、转录组、蛋白质组与CRISPR筛选中的靶点发现案例。
Google 发布智能体科研工作台 Google Antigravity,并用它从 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一个预测对呼吸道感染病原体有活性的新型抗菌肽候选,该先导物正在接受湿实验验证。
推荐理由:展示智能体工作台如何把跨库检索、功能注释与结构查看串成一次会话,为抗菌肽早期发现提供可迁移流程。
pLDDT、ipTM、ipSAE、pDockQ2 和 LIS 如何相互配合? 了解这些指标如何共同评估 AlphaFold DB 复合物界面的置信度。 🎬 观看完整教程:https://youtu.be/k4yBqddtPyQ #AlphaFold #AlphaFoldDB
EMBL-EBI 与 Google DeepMind、NVIDIA 等合作,在 AlphaFold 数据库中开放 2800 多种病毒的 AI 预测蛋白复合物结构,优先覆盖已知感染人类的病毒科。
推荐理由:AlphaFold 数据库新增 2800 多种病毒的蛋白复合物预测结构,为疫苗与诊断靶点研究提供开放基础数据。
EMBL-EBI 研究负责人 Julio Saez-Rodriguez 等人在一篇 Perspective 文章中讨论生物医学基础模型的基准评测,提出数据质量、模型仓库与评测框架三个相互关联的支柱,并主张将性能评估与方法开发隔离、由独立方在未见数据上评测。
推荐理由:EMBL-EBI 研究负责人系统梳理生物医学基础模型基准评测的三角框架与独立评测原则,为理解模型评测争议提供参照。
📄片段筛选数据使用的新建议来了。 该白皮书总结了关于片段筛选、从命中到先导化合物及先导化合物优化研究中结构生物学数据存储与复用的社区指导意见。 ⬇️在此阅读⬇️ https://cdn.rcsb.org/wwpdb/docs/documentation/Frag-screen-data-White-paper-08112026.pdf
🔬扰动目录(Perturbation Catalogue)全新更新! 全新设计的界面、更丰富的数据集和强大的分析工作流,让探索遗传扰动数据比以往更加便捷。https://www.ebi.ac.uk/perturbation-catalogue/ #生物信息学 #功能基因组学 @OpenTargets
IHI Europe启动LIGAND-AI项目,由苏格兰药物发现中心(@thesgconline)与辉瑞英国(@Pfizer_UK)牵头,目标是生成开放的蛋白-配体相互作用数据集,用于训练AI药物发现模型。EMBL-EBI将负责归档数据,并把结果整合进ChEMBL数据库。
推荐理由:该项目由多方联合推进,计划产出开放蛋白-配体相互作用数据集并汇入ChEMBL,为AI药物发现模型提供数据基础。