AI制药日报|Pallatom2 全原子生成模型发布;多项预印本成果发布
力文所发布全原子生成模型Pallatom2,可同时生成氨基酸序列与主侧链原子构型并指定靶点结合界面;据该帖介绍,210个候选中确认112个具结合活性,10个靶点均获结合剂,其中6个靶点经BLI测定报告pM量级KD。
力文所发布全原子生成模型Pallatom2,可同时生成氨基酸序列与主侧链原子构型并指定靶点结合界面;据该帖介绍,210个候选中确认112个具结合活性,10个靶点均获结合剂,其中6个靶点经BLI测定报告pM量级KD。
力文所发布Pallatom2技术报告,以Atom-to-Atom建模联合生成序列、主链与侧链,单链采样达1600个残基,对称组装扩展至C10、总长2000个残基。
力文所预告 Pallatom2 技术报告即将发布,该模型延续全原子生成思想,重构模型与框架并显著提升训练数据量、网络深度和可处理的蛋白质尺度,关注 mini-binder 设计更高的实验成功率。
力文所发布以 Agent 为核心的蛋白质设计智能应用 Lévin™ Harness,将数据、模型、插件工具、算力和工作流整合到同一工作区。该应用内置 Mol* 三维结构查看器,使分子结构进入 Agent 上下文,并以插件形式接入 AlphaFold、ProteinMPNN、Pallatom、RFantibody 等开源工具,自动完成下载、安装与调用。
推荐理由:该产品把结构查看、开源设计模型与工作流编排收进同一 Agent 工作区,可对照现有蛋白设计工具链的碎片化问题。
杭州力文所介绍其Pallatom系列全原子生成模型,从V1端到端生成主链、侧链与序列,到V2面向靶点界面与结合位点做功能分子设计,再到以Agent组织模型与结构分析工具的Pallatom-Lévin。
推荐理由:梳理力文所Pallatom系列从全原子生成到Agent闭环的版本演进,并列出多靶点binder实验成功率。
力文所与复融生物宣布达成首批类药寡聚体设计交付,这批分子由力文所 Pallatom2 引擎生成,并在复融生物高通量实验平台完成验证。据文中描述,候选分子在体积排阻色谱中呈单一峰型、实现预期寡聚化状态,多个核心候选亲和力达到皮摩尔级,热稳定性与表达滴度达到工业评价标准。文中称部分分子已具备推进成药性评价的基础,但未披露具体靶点、分子数量与实验数值。
推荐理由:力文所与复融生物披露首批寡聚体设计交付,展示了全原子生成模型在湿实验中的验证路径。