从NVL-655专利突破到分子设计:望石智慧MolVortex如何赋能ALK四代抑制剂研发
望石智慧以ALK第四代抑制剂为例,展示MolVortex药物研发智能体如何串联项目立项、专利分析、分子生成与成药性评价。在海思科专利WO2026219300的NVL-655 Fast Follow案例中,代表性化合物49-A的ALK G1202R/L1196M酶活性IC50为0.08 nM,食蟹猴AUC@3mpk达1605 ng*h/ml,小鼠药效试验21天抑瘤率107%。
望石智慧以ALK第四代抑制剂为例,展示MolVortex药物研发智能体如何串联项目立项、专利分析、分子生成与成药性评价。在海思科专利WO2026219300的NVL-655 Fast Follow案例中,代表性化合物49-A的ALK G1202R/L1196M酶活性IC50为0.08 nM,食蟹猴AUC@3mpk达1605 ng*h/ml,小鼠药效试验21天抑瘤率107%。
望石智慧在MolVortex大师班第2期展示其全栈式小分子早研智能体MolVortex针对CBL-b别构抑制剂的靶点调研与分子生成流程。该流程先做知识产权全景调研与专利解析,再自动抽取分子结构与活性数据并输出构效关系分析报告,随后以五种设计模式单批生成100个有效分子,并对接靶点口袋预测结合构象与结合打分。
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0,将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由:该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库,并给出LLM加RAG的检索架构,可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
Google DeepMind 为 Google Antigravity 发布 Cheminformatics Skills,基于 RDKit 并接入 ChEMBL 与 PubChem,让语言模型负责流程编排、确定性化学工具执行分子计算。
推荐理由:官方演示了智能体在真实肺癌药物数据上完成检索、配对分析与大环设计,可观察化学工作流的自动化边界。
Corin Wagen 表示,自动生成合成中间体是 Rowan 已加入的体验改进之一,与自动扭转角重拟合、收敛检测等功能并列。他引用的 @manntis4 内容称,在测试小分子辅因子支持 FEP 时发现,把合成中间体配体加入 RBFE 图可改善与实验结合亲和力的相关性,示例为 KRAS-G12D。Wagen 认为稳健的智能体驱动 FEP 还需要更多此类能力。
推荐理由:Rowan 团队以 KRAS-G12D 为例说明合成中间体配体如何改善 RBFE 与实验亲和力的相关性,并列出自动化改进方向。
望石智慧在MolVortex大师班第1期展示了其全栈式小分子早研智能体MolVortex完成CBL-b别构抑制剂Hit分子发现的流程。该智能体在数十分钟内检索10+个文献源及80+个专业数据库完成靶点调研,基于8GCY、8QTK、8QNG共晶结构识别别构口袋,参照8GCY结合模式与NX-1607共享药效团生成30个全新候选分子。
英矽智能在 Chemistry42 逆合成模块中推出 ChemCensor,用 0-5 分的基于先例的评分判断所提反应是否化学上可行,依据是相同反应中心、相同官能团兼容性以及有真实文献先例支持。该功能在首尔 ICML 2026 上介绍,公司称其并非模式匹配,而是将化学家逻辑系统化。
Recursion在平台系列第7篇中介绍其自动化化学平台:候选分子在计算机设计后直接进入自动化DMTL实验室,可规模化执行多步药物化学合成,并自动完成后处理、纯化与数字化样品追踪。其自研AI智能体还协助科学家规划高效合成路线;公司称因设计、合成、测试在同一集成系统内完成,消除了团队间数据交接的摩擦与时间损耗。
望石智慧在2026物理AI与世界模型大会创新专区展示物理AI与世界模型成果,并同期在2026 AsiaBIO创新峰会·华南站、中国药学会智能药物专业委员会学术年会上分享小分子药物研发实践。
🧪 #Chemistry42 全新 #FeatureFriday:类型化排除体积 排除体积并不新鲜,但类型化的排除体积是新的。现在你不仅能封锁某片空间区域,还能精确指定那里不允许出现什么:不许有芳香环、不许有氢键供体、不许有带正电的基团,随药物化学需求而定。 在这段短片中,我们用一个真实的 B-RAF 生长向量示例进行演示。 #PharmaAI #GenerativeChemistry
Terray Therapeutics 将基于英伟达 Nemotron 3.5 Super VL 及此前版本的化学合成路线提取能力嵌入其 EMMI 平台,使 AI 智能体可即时解析和推理化学文献。公司称这形成持续的数据飞轮,扩大可操作化学空间的获取并加速新药研发。
在超级智能的世界里,瓶颈正迅速变成执行。我们能想象的和我们能制造的东西之间的差距从未如此之大,但@b12Labs 来弥合它🔥
b12 Labs(YC S25)发布b12 Foundry,将其AI设计的分子通过自动化设施实际合成,并与苏黎世大学HTEL合作把现有自动化设施改造为分子生产平台。该平台由AI智能体与化学家协同工作,产出分子、反应和数据,公司称其灵活性与质量少有其他机构能比。b12 Labs正寻求难以合成或需生成实验数据的分子合作方。
Recursion 的药物设计高级副总裁 Donovan Chin 介绍,其 AI 原生引擎可在约一天内跑完一轮计算设计循环,将数百万分子快速筛选为可合成的高质量候选短名单。流程先用 Nesso-1 等 3D 结构模型评估结合亲和力,再整合 ADME、效力、模拟与 AI 逆合成等数百个模型,使化学家能探索全新化学空间并预测合成路线。公司称这些分子不仅在计算上有前景,而且在送实验室前即可实际合成。
课题组两个项目在浙江省国际大学生创新大赛(2026)获双金,其中LynxMind以高教主赛道本科生创意组人工智能+赛道第一名斩获金奖。LynxMind聚焦中枢神经系统药物发现,整合血脑屏障穿透性预测、分子生成与优化及可解释性分析;PROTACnova以自主智能体连接信息检索、分子生成、连接子优化与理化评估,面向蛋白降解药物设计。
Recursion称其各项目在仅合成约300个化合物后即推进了高质量新候选分子,比行业平均少约90%。其AI原生引擎已产出逾10个开发候选分子,设计依托整合数百个机器学习与物理模型的Centaur平台,从靶点性质出发做生成式从头设计,并通过计算与实验的持续反馈循环迭代更新模型。
在Roche Pharma Day 2026演讲中,Aviv Regev介绍罗氏正在建设的Lab-in-the-Loop,将AI、基础模型、自动化实验与临床数据嵌入从靶点发现到临床验证的环节;2025年第四季度至2026年第二季度约40%的研发管线决策存在可追踪的AI或计算贡献。
推荐理由:罗氏披露AI在研发管线决策中的实际占比与闭环建设路径,为评估药企AI落地程度提供参照。
望石智慧在2026云栖大会首发全栈式小分子医药早研智能体MolVortex,以多智能体协同架构和决策罗盘数据底座覆盖情报分析、分子设计、亲和力与口袋分析、合成性与成药性评估等早期研发环节。
Isomorphic Labs 推出药物设计引擎 IsoDDE,称其可覆盖从小分子到复杂生物药的多模态药物空间。推文以保守估计的小分子化学搜索空间约 10^60 作对比,称可观测宇宙恒星数量仅约 10^22 至 10^24。公司称该引擎使其具备在这一空间中导航的能力,但未披露具体方法、验证结果或实验数据。
Inductive Bio 发布 AI 化学助手 Indy,面向其合作项目开放,公司称已在内部合作项目中使团队产能翻倍。Indy 可解析 CRO 报告、QC 剂量响应曲线、分析历史 SAR、运行生成化学算法、搭建 FEP 计算并生成项目汇报幻灯片,并接入 Inductive 的 ADMET 与 PK 模型。
推荐理由:Indy 在真实剂量响应曲线上的准确率对比通用大模型,展示了药化专用助手与通用模型的差距。
Inductive Bio 发布小分子药化助手 Indy,内嵌于其 Compass 平台,可做剂量响应数据质控、FEP 提交、人体剂量预测与 SAR 幻灯片生成。
推荐理由:Inductive 公开其药化智能体 Indy 与 Claude、GPT 在数据质控和常规设计动作上的对照评测,可看判断力差距落在哪。
深势科技发布药物分子专利解析智能体PharmMaster·Patent,基于文档解析引擎Uni-Parser 1.4,可从专利PDF中提取分子结构并关联活性数据、实验条件与权利要求,每条结论保留来源页码可回溯原文。
推荐理由:该工具把专利中的分子结构、活性数据与权利要求关联成可核验记录,展示了跨页证据整理的具体做法。
唯信计算与沐曦股份围绕AI制药与生命科学计算深化合作,基于WeMol平台、沐曦GPU及MXMACA软件栈完成联合运行环境建设。BoltzGen、Boltz-2、GROMACS分子动力学模块、OpenDDE及沐曦自研MetaxFEP自由能微扰引擎均已集成至WeMol并正式运行,覆盖生成式分子设计、结构与结合亲和力预测、分子动力学模拟及自由能计算等任务。
Inductive Bio 随 OpenAI Rosalind Workbench 发布,将其 ADMET 模型接入 OpenAI 生态(含 ChatGPT、Codex 与 Rosalind Workbench);此前 6 月已作为 Claude Science 生态伙伴进入 Claude,本月早些时候通过 ModelHub 进入 Benchling。
推荐理由:Inductive Bio 的 ADMET 模型接入三家主流平台,展示了化学预测模型嵌入现有科研软件栈的分发路径。
当一个想法变成可用工具、多个团队几乎同时着手攻克它时,真是太酷了。开放 smiles 到 IUPAC 的翻译曾缺失了一段时间,而在两周内 @adrian_mirza_ 和 @NicholasRuncie 各自独立发布了相关工具。 这里的推动者是编码智能体!
望石智慧在BIO 2026国际大会期间与医药魔方围绕「中国创新走向世界」展开对话,并展出小分子药物研发技术平台及智能体产品。公司介绍AI 3D分子生成平台MolVado融合大语言模型与几何深度学习、依托电子云密度数据实现3D分子生成,全栈式早研智能体MolVortex可自主拆解任务、调度工具并联动湿实验室形成干湿闭环。
Latent Labs 宣布药物设计智能体 Latent-Y 向全球研究者开放,获批研究者每天可免费获得 250 个设计。公司同时公布早期访问研究者的首批实验室结果,包括阻断离子通道的分子、在体内杀伤肿瘤细胞的 CAR-T 细胞,以及疟原虫难以通过突变逃逸的结合剂。
推荐理由:Latent Labs 开放其药物设计智能体 Latent-Y,并给出早期用户离子通道抑制剂与 CAR-T 的实验室结果。
Genesis Molecular AI 首次披露其智能体药物设计系统 Sapphire,该系统构建于其分子基础模型之上,可全天候自主迭代候选药物,对2D化学结构与3D分子构象进行推理并形成、检验假设。
Inductive Bio 宣布加入 Anthropic 生命科学生态,并发布 Model Context Protocol(MCP)连接器,让 Claude 和 Claude Science 用户可用自然语言对任意化学结构获取 ADMET 性质预测。
推荐理由:Inductive Bio 把其 ADMET 预测模型接入 Claude,为小分子设计中的性质评估提供了一种对话式调用入口。
Terray Therapeutics分享了其生成式合成规划器TerraSynth的工作,针对小分子药物发现中的合成瓶颈。该工具将合成规划纳入设计循环,而非事后处理,以减少生成模型提出难合成分子对DMTA循环的拖慢。TerraSynth已整合进其EMMI平台,帮助聚焦值得合成的分子以推进项目。
Ginkgo Bioworks旗下Datapoints与Tangible Scientific、Inductive Bio联合推出高通量ADME平台ADME-One,将五项Tier 1 ADME检测、Inductive Bio的AI人体PK预测和化合物管理整合为一项服务。
推荐理由:三家合作方把高通量ADME实验、AI人体PK预测与化合物管理打包成一体化服务,展示AI与湿实验衔接的一种落地形态。