晓鹜®平台minibinder从头设计教程：三条路线跑完PD-L1设计全流程
天鹜科技晓鹜®平台发布minibinder从头设计教程，以PD-L1为靶点演示RFdiffusion+ProteinMPNN、BindCraft、BoltzGen三条路线，用户通过提示词即可完成靶点调研、结构裁剪、骨架与序列生成及跨工具打分筛选。
#多肽药物
天鹜科技AI 评分3838
药明康德AI 评分4444 药明康德TidesID®平台将复杂多肽代谢产物鉴定提速约30%，9个工作日交付
药明康德DMPK团队用自主开发的TidesID®一站式化合物鉴定平台，为一家全球药企完成复杂多肽代谢产物结构解析，9个工作日交付结果。该平台已迭代至2.0版本，覆盖多肽和寡核苷酸等复杂分子；据项目实践，整体MetID项目周转时间可缩短约30%。
泓博医药AI 评分2828 泓博医药 DiOrion 平台入选《医药领域企业级 AI 创新应用良好实践案例》
泓博医药的 DiOrion 生成式 AI 药物设计与多智能体协同研发平台入选《医药领域企业级 AI 创新应用良好实践案例》，该评选从 50 家企业 80 余个项目中遴选出近 30 个优秀实践。
机器之心 · AI4Science精选AI 评分5858 中科大发布机器科学家2.2系统，宣称可自主创制新物质
中科大在智能科学家生态联盟第四届年会上发布机器科学家2.2系统，官方定位为新一代智能物质科学基础设施，由大模型提出假设、专业小模型计算筛选、科研机器人执行实验并回喂结果形成闭环。
推荐理由：报道梳理了该系统大模型假设、小模型求证与机器人实验的三层分工及闭环机制，并列出效率数据与数据、验证层面的现实约束。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分6060 Google 推出 Antigravity 智能体工作台，用 ProtNLM 挖掘抗菌肽候选
Google 发布智能体科研工作台 Google Antigravity，并用它从 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一个预测对呼吸道感染病原体有活性的新型抗菌肽候选，该先导物正在接受湿实验验证。
推荐理由：展示智能体工作台如何把跨库检索、功能注释与结构查看串成一次会话，为抗菌肽早期发现提供可迁移流程。
AI-Protein DesignAI 评分3838 每天学点设计：介绍在线版多肽设计工具AfDesign
MIT的Sergey Ovchinnikov开发的在线多肽设计工具AfDesign，可用于短肽设计，2025年一篇Cell研究曾用其设计短肽调控离子通道功能。以MDM2-P53为例，设定binder长度12、运行168次迭代优化后，损失函数逐渐下降，plddt、iptm等打分升高，并可用AF3进一步确认多肽与靶蛋白结合情况。
Mol.AI精选AI 评分6363 浙江大学团队在Nature Communications发表CycloPepper，用机器学习预测环肽环化位点并上线在线工具
浙江大学李承熙团队在《Nature Communications》发表CycloPepper，用机器学习预测治疗性环肽的环化结果并优化合成。研究基于全自动环肽合成平台CycloBot构建306个环肽数据集，采用SVC模型结合One-hot编码、氨基酸组成、二肽组成及16维理化特征，交叉验证准确率84%，实验验证一致性86%。
推荐理由：该研究用自动化合成数据训练环化位点预测模型，为环肽合成路线选择提供了可复用的在线工具。