每天学点设计：介绍在线版多肽设计工具AfDesign

MIT的Sergey Ovchinnikov开发的在线多肽设计工具AfDesign，可用于短肽设计，2025年一篇Cell研究曾用其设计短肽调控离子通道功能。以MDM2-P53为例，设定binder长度12、运行168次迭代优化后，损失函数逐渐下降，plddt、iptm等打分升高，并可用AF3进一步确认多肽与靶蛋白结合情况。